MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_002607	GTG	2	6	1837293	1837298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791225
54003	NC_002607	CG	3	6	1837319	1837324	0 %	0 %	50 %	50 %	15791225
54004	NC_002607	GC	4	8	1837325	1837332	0 %	0 %	50 %	50 %	15791225
54005	NC_002607	CCT	2	6	1837378	1837383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791225
54006	NC_002607	ACGCCG	2	12	1837398	1837409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15791225
54007	NC_002607	CGT	2	6	1837411	1837416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791225
54008	NC_002607	GCG	2	6	1837472	1837477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791225
54009	NC_002607	CGA	2	6	1837518	1837523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791225
54010	NC_002607	GTG	2	6	1837525	1837530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791225
54011	NC_002607	CCCCG	2	10	1837543	1837552	0 %	0 %	20 %	80 %	15791225
54012	NC_002607	GCC	2	6	1837583	1837588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791225
54013	NC_002607	ACG	2	6	1837605	1837610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791225
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54015	NC_002607	CAG	2	6	1837649	1837654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791225
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54019	NC_002607	GAC	2	6	1837738	1837743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791225
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54027	NC_002607	CGA	2	6	1838035	1838040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791225
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54029	NC_002607	GCGG	2	8	1838237	1838244	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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54031	NC_002607	CAT	2	6	1838323	1838328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54032	NC_002607	AT	3	6	1838349	1838354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54033	NC_002607	CCG	2	6	1838440	1838445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791226
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54035	NC_002607	CGC	2	6	1838550	1838555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54037	NC_002607	CA	3	6	1838723	1838728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54038	NC_002607	GCC	2	6	1838816	1838821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791227
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54052	NC_002607	TGAC	2	8	1839322	1839329	25 %	25 %	25 %	25 %	15791227
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54114	NC_002607	C	6	6	1841339	1841344	0 %	0 %	0 %	100 %	15791231
54115	NC_002607	CCGCA	2	10	1841353	1841362	20 %	0 %	20 %	60 %	15791231
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54119	NC_002607	CGA	2	6	1841508	1841513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791231
54120	NC_002607	CCAGC	2	10	1841535	1841544	20 %	0 %	20 %	60 %	15791231
54121	NC_002607	GCC	2	6	1841550	1841555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791231
54122	NC_002607	CGG	2	6	1841583	1841588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791231
54123	NC_002607	GCC	2	6	1841636	1841641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791231
54124	NC_002607	CGG	2	6	1841658	1841663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791231
54125	NC_002607	GAT	2	6	1841677	1841682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791231
54126	NC_002607	TGG	2	6	1841687	1841692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791231
54127	NC_002607	GC	4	8	1841707	1841714	0 %	0 %	50 %	50 %	15791231
54128	NC_002607	ACG	2	6	1841718	1841723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791231
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54130	NC_002607	AGC	2	6	1841768	1841773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791231
54131	NC_002607	GCCC	2	8	1841829	1841836	0 %	0 %	25 %	75 %	15791231
54132	NC_002607	GCC	2	6	1841846	1841851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791231
54133	NC_002607	CG	3	6	1841923	1841928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54134	NC_002607	ACGC	2	8	1841942	1841949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54135	NC_002607	GCC	2	6	1841963	1841968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791232
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54137	NC_002607	CTG	2	6	1841993	1841998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54138	NC_002607	CAT	2	6	1842011	1842016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791232
54139	NC_002607	CTG	2	6	1842050	1842055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54140	NC_002607	CAT	2	6	1842068	1842073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791232
54141	NC_002607	AGC	2	6	1842087	1842092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54142	NC_002607	CG	4	8	1842124	1842131	0 %	0 %	50 %	50 %	15791232
54143	NC_002607	ATG	2	6	1842198	1842203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791232
54144	NC_002607	CGT	2	6	1842244	1842249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
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54147	NC_002607	TGT	2	6	1842319	1842324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15791232
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54149	NC_002607	TCC	2	6	1842417	1842422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791232
54150	NC_002607	CG	3	6	1842425	1842430	0 %	0 %	50 %	50 %	15791232
54151	NC_002607	GCT	2	6	1842448	1842453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54152	NC_002607	TGG	2	6	1842547	1842552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791232
54153	NC_002607	CGC	2	6	1842583	1842588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791232
54154	NC_002607	CTG	2	6	1842659	1842664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
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54157	NC_002607	CGA	2	6	1842718	1842723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791232
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54165	NC_002607	GCCG	2	8	1842951	1842958	0 %	0 %	50 %	50 %	15791232
54166	NC_002607	CTT	2	6	1842965	1842970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15791232
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54173	NC_002607	GA	3	6	1843179	1843184	50 %	0 %	50 %	0 %	15791232
54174	NC_002607	ACGTCG	2	12	1843200	1843211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54175	NC_002607	GCA	2	6	1843216	1843221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54176	NC_002607	GAC	2	6	1843241	1843246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791232
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54178	NC_002607	GTC	2	6	1843322	1843327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791232
54179	NC_002607	CGG	2	6	1843438	1843443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54180	NC_002607	CG	3	6	1843479	1843484	0 %	0 %	50 %	50 %	15791233
54181	NC_002607	GCCGAC	2	12	1843512	1843523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15791233
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54183	NC_002607	CGCC	2	8	1843555	1843562	0 %	0 %	25 %	75 %	15791233
54184	NC_002607	CGA	2	6	1843580	1843585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791233
54185	NC_002607	AC	4	8	1843587	1843594	50 %	0 %	0 %	50 %	15791233
54186	NC_002607	AC	3	6	1843606	1843611	50 %	0 %	0 %	50 %	15791233
54187	NC_002607	CGC	2	6	1843679	1843684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791233
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54194	NC_002607	GCCG	2	8	1843865	1843872	0 %	0 %	50 %	50 %	15791233
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54201	NC_002607	TCG	2	6	1844121	1844126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791234
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54219	NC_002607	GCG	2	6	1844701	1844706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791234
54220	NC_002607	TCG	2	6	1844721	1844726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791234
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54223	NC_002607	CGA	2	6	1844777	1844782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791234
54224	NC_002607	CTC	2	6	1844783	1844788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791234
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54227	NC_002607	CGG	2	6	1844878	1844883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791234
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54230	NC_002607	CCT	2	6	1844950	1844955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791234
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54232	NC_002607	GCT	2	6	1845032	1845037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791235
54233	NC_002607	CTG	2	6	1845051	1845056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791235
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54235	NC_002607	CTG	2	6	1845066	1845071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791235
54236	NC_002607	CTG	2	6	1845087	1845092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791235
54237	NC_002607	GCT	2	6	1845098	1845103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791235
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54252	NC_002607	TCAC	2	8	1845478	1845485	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54253	NC_002607	GCA	2	6	1845490	1845495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54254	NC_002607	CTTCC	2	10	1845508	1845517	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54255	NC_002607	CGC	2	6	1845524	1845529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54257	NC_002607	GGA	2	6	1845586	1845591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54330	NC_002607	GAA	2	6	1847983	1847988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54331	NC_002607	AGT	2	6	1847990	1847995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54333	NC_002607	GCG	2	6	1848099	1848104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791241
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54336	NC_002607	GTC	2	6	1848155	1848160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791241
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54343	NC_002607	GAG	2	6	1848296	1848301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791241
54344	NC_002607	ACC	2	6	1848320	1848325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791241
54345	NC_002607	CGA	2	6	1848379	1848384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791241
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54349	NC_002607	CGA	2	6	1848526	1848531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791241
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54355	NC_002607	CGA	2	6	1849027	1849032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791241
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54458	NC_002607	CGT	2	6	1853030	1853035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791245
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54461	NC_002607	C	6	6	1853131	1853136	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54462	NC_002607	CGT	2	6	1853150	1853155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54463	NC_002607	CGT	2	6	1853188	1853193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54464	NC_002607	CGC	2	6	1853201	1853206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54465	NC_002607	AGC	2	6	1853214	1853219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54466	NC_002607	GCA	2	6	1853239	1853244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54468	NC_002607	CGA	2	6	1853312	1853317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54469	NC_002607	GT	3	6	1853354	1853359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54470	NC_002607	CG	3	6	1853380	1853385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54471	NC_002607	CTG	2	6	1853401	1853406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54473	NC_002607	GCT	2	6	1853436	1853441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54499	NC_002607	CG	3	6	1854337	1854342	0 %	0 %	50 %	50 %	15791246
54500	NC_002607	CTC	2	6	1854400	1854405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791246

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