MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 58906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51355	NC_002607	CGT	2	6	1749429	1749434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791139
51356	NC_002607	GCCACG	2	12	1749468	1749479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15791139
51357	NC_002607	TCG	2	6	1749485	1749490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791139
51358	NC_002607	GCC	2	6	1749559	1749564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791139
51359	NC_002607	CCT	2	6	1749612	1749617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791139
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51362	NC_002607	TCG	3	9	1749752	1749760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791139
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51373	NC_002607	TCG	2	6	1750262	1750267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791139
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51377	NC_002607	CGTG	2	8	1750424	1750431	0 %	25 %	50 %	25 %	15791140
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51381	NC_002607	GTC	2	6	1750524	1750529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791140
51382	NC_002607	GGC	2	6	1750584	1750589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791140
51383	NC_002607	TCC	2	6	1750597	1750602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791140
51384	NC_002607	GGC	2	6	1750605	1750610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791140
51385	NC_002607	GAC	2	6	1750656	1750661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791140
51386	NC_002607	CGT	2	6	1750809	1750814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51387	NC_002607	CGT	3	9	1750854	1750862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791141
51388	NC_002607	TGCG	2	8	1750888	1750895	0 %	25 %	50 %	25 %	15791141
51389	NC_002607	GGCGT	2	10	1750901	1750910	0 %	20 %	60 %	20 %	15791141
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51394	NC_002607	CGAG	2	8	1751121	1751128	25 %	0 %	50 %	25 %	15791141
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51406	NC_002607	CGAT	2	8	1751517	1751524	25 %	25 %	25 %	25 %	15791141
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51412	NC_002607	CCG	2	6	1751620	1751625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51413	NC_002607	CCA	2	6	1751661	1751666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791142
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51425	NC_002607	GTG	2	6	1752201	1752206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791143
51426	NC_002607	CGA	2	6	1752208	1752213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791143
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51428	NC_002607	GCCG	2	8	1752360	1752367	0 %	0 %	50 %	50 %	15791144
51429	NC_002607	CGC	2	6	1752411	1752416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791144
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51432	NC_002607	GGC	2	6	1752538	1752543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791144
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51444	NC_002607	TCG	2	6	1753049	1753054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791144
51445	NC_002607	CGATGC	2	12	1753092	1753103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15791144
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51448	NC_002607	GTA	2	6	1753141	1753146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791144
51449	NC_002607	CCGA	2	8	1753163	1753170	25 %	0 %	25 %	50 %	15791144
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51452	NC_002607	GTC	2	6	1753421	1753426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791144
51453	NC_002607	CACC	2	8	1753443	1753450	25 %	0 %	0 %	75 %	15791144
51454	NC_002607	CCT	2	6	1753467	1753472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791144
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51456	NC_002607	GCC	2	6	1753525	1753530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791144
51457	NC_002607	T	6	6	1753543	1753548	0 %	100 %	0 %	0 %	15791144
51458	NC_002607	TGGC	2	8	1753570	1753577	0 %	25 %	50 %	25 %	15791144
51459	NC_002607	CCT	2	6	1753633	1753638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791145
51460	NC_002607	CGG	2	6	1753646	1753651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791145
51461	NC_002607	GGT	2	6	1753664	1753669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15791145
51462	NC_002607	CAG	2	6	1753707	1753712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51463	NC_002607	GT	3	6	1753752	1753757	0 %	50 %	50 %	0 %	15791145
51464	NC_002607	G	6	6	1753799	1753804	0 %	0 %	100 %	0 %	15791145
51465	NC_002607	GTCG	2	8	1753815	1753822	0 %	25 %	50 %	25 %	15791145
51466	NC_002607	TCG	3	9	1753870	1753878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791145
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51469	NC_002607	CGA	2	6	1754084	1754089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51470	NC_002607	TCG	2	6	1754128	1754133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51471	NC_002607	CAT	2	6	1754163	1754168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15791145
51472	NC_002607	GC	3	6	1754179	1754184	0 %	0 %	50 %	50 %	15791145
51473	NC_002607	C	6	6	1754193	1754198	0 %	0 %	0 %	100 %	15791145
51474	NC_002607	TCG	2	6	1754218	1754223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51475	NC_002607	CGC	2	6	1754227	1754232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791145
51476	NC_002607	TCGGGG	2	12	1754233	1754244	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15791145
51477	NC_002607	CCT	2	6	1754285	1754290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791145
51478	NC_002607	CGC	2	6	1754393	1754398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791145
51479	NC_002607	CCT	2	6	1754408	1754413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15791145
51480	NC_002607	GGA	2	6	1754474	1754479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15791145
51481	NC_002607	CGA	2	6	1754549	1754554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51482	NC_002607	GTCC	2	8	1754619	1754626	0 %	25 %	25 %	50 %	15791145
51483	NC_002607	GTC	4	12	1754676	1754687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791145
51484	NC_002607	CAC	2	6	1754717	1754722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15791146
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51487	NC_002607	GAC	2	6	1754820	1754825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51488	NC_002607	GAT	2	6	1754826	1754831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791146
51489	NC_002607	ACG	2	6	1754858	1754863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51490	NC_002607	CGA	2	6	1754865	1754870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51491	NC_002607	CGG	2	6	1754916	1754921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15791146
51492	NC_002607	GCC	2	6	1754976	1754981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791146
51493	NC_002607	GCA	2	6	1755026	1755031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51494	NC_002607	CTT	2	6	1755092	1755097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15791146
51495	NC_002607	CGT	2	6	1755147	1755152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51496	NC_002607	CAG	2	6	1755174	1755179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15791146
51497	NC_002607	CCG	2	6	1755181	1755186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15791146
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51499	NC_002607	C	6	6	1755303	1755308	0 %	0 %	0 %	100 %	15791146
51500	NC_002607	GTA	2	6	1755309	1755314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15791146

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