MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_001869	CGA	2	6	45890	45895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1002	NC_001869	CTC	2	6	45978	45983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803590
1003	NC_001869	ACGTC	2	10	46033	46042	20 %	20 %	20 %	40 %	10803590
1004	NC_001869	GAC	2	6	46074	46079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1005	NC_001869	CGA	2	6	46082	46087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1006	NC_001869	CGA	2	6	46109	46114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1007	NC_001869	GCG	2	6	46144	46149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803590
1008	NC_001869	TCG	2	6	46159	46164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1009	NC_001869	ACG	2	6	46189	46194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1010	NC_001869	ACC	2	6	46198	46203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803590
1011	NC_001869	GC	3	6	46227	46232	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
1012	NC_001869	ACG	2	6	46237	46242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1013	NC_001869	GTCGAA	2	12	46245	46256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	10803590
1014	NC_001869	ACG	2	6	46261	46266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1015	NC_001869	GCT	2	6	46277	46282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1016	NC_001869	CTC	2	6	46298	46303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803590
1017	NC_001869	CCT	2	6	46319	46324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803590
1018	NC_001869	ACG	2	6	46327	46332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1019	NC_001869	ATC	2	6	46347	46352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803590
1020	NC_001869	TGCG	2	8	46360	46367	0 %	25 %	50 %	25 %	10803590
1021	NC_001869	ACCG	2	8	46371	46378	25 %	0 %	25 %	50 %	10803590
1022	NC_001869	GAC	2	6	46386	46391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1023	NC_001869	GAG	2	6	46476	46481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803590
1024	NC_001869	CGA	2	6	46535	46540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1025	NC_001869	GAC	2	6	46544	46549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1026	NC_001869	CGC	2	6	46550	46555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803590
1027	NC_001869	CCA	2	6	46585	46590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803590
1028	NC_001869	AC	3	6	46613	46618	50 %	0 %	0 %	50 %	10803590
1029	NC_001869	CCT	2	6	46630	46635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803590
1030	NC_001869	TCG	2	6	46639	46644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1031	NC_001869	CGCC	2	8	46691	46698	0 %	0 %	25 %	75 %	10803590
1032	NC_001869	GAG	2	6	46707	46712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803590
1033	NC_001869	CGA	2	6	46715	46720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1034	NC_001869	GC	3	6	46723	46728	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
1035	NC_001869	GC	3	6	46737	46742	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
1036	NC_001869	TCG	2	6	46795	46800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1037	NC_001869	GC	3	6	46804	46809	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
1038	NC_001869	CGC	2	6	46820	46825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803590
1039	NC_001869	CGC	2	6	46832	46837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803590
1040	NC_001869	TCG	2	6	46870	46875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1041	NC_001869	TCG	2	6	46912	46917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1042	NC_001869	GCC	2	6	46937	46942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803590
1043	NC_001869	CGGC	2	8	46944	46951	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
1044	NC_001869	CAT	2	6	46964	46969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803590
1045	NC_001869	CGA	2	6	46972	46977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1046	NC_001869	CGA	3	9	46997	47005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1047	NC_001869	AAC	2	6	47034	47039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10803590
1048	NC_001869	GCCA	2	8	47046	47053	25 %	0 %	25 %	50 %	10803590
1049	NC_001869	CT	3	6	47057	47062	0 %	50 %	0 %	50 %	10803590
1050	NC_001869	ACG	2	6	47075	47080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803590
1051	NC_001869	TCCACT	2	12	47095	47106	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	10803591
1052	NC_001869	CGC	2	6	47113	47118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803591
1053	NC_001869	CGCTA	2	10	47144	47153	20 %	20 %	20 %	40 %	10803591
1054	NC_001869	CGG	2	6	47155	47160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803591
1055	NC_001869	GCT	2	6	47161	47166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1056	NC_001869	CAG	2	6	47273	47278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1057	NC_001869	GGC	2	6	47298	47303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803591
1058	NC_001869	CGT	2	6	47347	47352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1059	NC_001869	GCG	2	6	47361	47366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803591
1060	NC_001869	GAC	2	6	47371	47376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1061	NC_001869	TCG	2	6	47400	47405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1062	NC_001869	GCG	2	6	47406	47411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803591
1063	NC_001869	TCG	2	6	47415	47420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803591
1064	NC_001869	CG	3	6	47430	47435	0 %	0 %	50 %	50 %	10803591
1065	NC_001869	TCG	2	6	47612	47617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1066	NC_001869	TTCGGG	2	12	47629	47640	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	10803592
1067	NC_001869	GTC	2	6	47671	47676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1068	NC_001869	TCC	2	6	47684	47689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803592
1069	NC_001869	CGG	2	6	47724	47729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803592
1070	NC_001869	CGC	2	6	47730	47735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803592
1071	NC_001869	TTC	2	6	47752	47757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803592
1072	NC_001869	CGC	2	6	47762	47767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803592
1073	NC_001869	GCT	2	6	47769	47774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1074	NC_001869	CG	3	6	47779	47784	0 %	0 %	50 %	50 %	10803592
1075	NC_001869	GCC	2	6	47810	47815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803592
1076	NC_001869	GCC	2	6	47896	47901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803592
1077	NC_001869	CAGCCA	2	12	47988	47999	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	10803592
1078	NC_001869	CGG	2	6	48017	48022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803592
1079	NC_001869	CGA	2	6	48171	48176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1080	NC_001869	GCC	2	6	48182	48187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803592
1081	NC_001869	CTC	2	6	48188	48193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803592
1082	NC_001869	TCG	2	6	48210	48215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1083	NC_001869	GGC	2	6	48230	48235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803592
1084	NC_001869	TCG	2	6	48264	48269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803592
1085	NC_001869	TGG	2	6	48412	48417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803594
1086	NC_001869	CAG	2	6	48440	48445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1087	NC_001869	GCC	2	6	48449	48454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803594
1088	NC_001869	TCG	2	6	48474	48479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1089	NC_001869	GCG	2	6	48480	48485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803594
1090	NC_001869	TCC	2	6	48510	48515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803594
1091	NC_001869	TCG	2	6	48564	48569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1092	NC_001869	TCG	3	9	48705	48713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1093	NC_001869	GTC	2	6	48719	48724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1094	NC_001869	TGG	2	6	48725	48730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803594
1095	NC_001869	CGA	2	6	48742	48747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1096	NC_001869	GCG	2	6	48760	48765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803594
1097	NC_001869	TGC	2	6	48768	48773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1098	NC_001869	CGGG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	75 %	25 %	10803594
1099	NC_001869	GCT	2	6	48847	48852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1100	NC_001869	CGA	2	6	48853	48858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1101	NC_001869	CGG	3	9	48892	48900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803594
1102	NC_001869	GAT	2	6	48940	48945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803594
1103	NC_001869	ACT	2	6	48963	48968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803594
1104	NC_001869	TCG	2	6	49068	49073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1105	NC_001869	CAT	2	6	49081	49086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803594
1106	NC_001869	GTG	2	6	49092	49097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10803594
1107	NC_001869	CGG	2	6	49105	49110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803594
1108	NC_001869	TGC	2	6	49209	49214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803594
1109	NC_001869	CGT	2	6	49231	49236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1110	NC_001869	GTTCG	2	10	49250	49259	0 %	40 %	40 %	20 %	10803595
1111	NC_001869	GTC	2	6	49288	49293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
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1113	NC_001869	TTC	2	6	49365	49370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10803595
1114	NC_001869	CGAG	2	8	49377	49384	25 %	0 %	50 %	25 %	10803595
1115	NC_001869	CCGT	2	8	49391	49398	0 %	25 %	25 %	50 %	10803595
1116	NC_001869	GTA	2	6	49437	49442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803595
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1118	NC_001869	GAG	2	6	49563	49568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803595
1119	NC_001869	TC	3	6	49574	49579	0 %	50 %	0 %	50 %	10803595
1120	NC_001869	CGA	2	6	49631	49636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803595
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1122	NC_001869	CTC	2	6	49695	49700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10803595
1123	NC_001869	CGAG	2	8	49724	49731	25 %	0 %	50 %	25 %	10803595
1124	NC_001869	GAC	2	6	49749	49754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1125	NC_001869	GTC	2	6	49767	49772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1126	NC_001869	TCG	2	6	49810	49815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1127	NC_001869	AGT	2	6	49816	49821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803595
1128	NC_001869	TCG	2	6	49822	49827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1129	NC_001869	CGT	2	6	49833	49838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1130	NC_001869	CGT	2	6	49842	49847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803595
1131	NC_001869	GAT	3	9	50102	50110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803596
1132	NC_001869	GAA	2	6	50138	50143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10803596
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1134	NC_001869	ACTG	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	10803596
1135	NC_001869	CGA	2	6	50233	50238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803596
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1138	NC_001869	ACG	2	6	50325	50330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803596
1139	NC_001869	GACG	2	8	50341	50348	25 %	0 %	50 %	25 %	10803596
1140	NC_001869	TC	4	8	50443	50450	0 %	50 %	0 %	50 %	10803596
1141	NC_001869	CGA	2	6	50524	50529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803596
1142	NC_001869	ATG	2	6	50532	50537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803596
1143	NC_001869	ACGC	2	8	50561	50568	25 %	0 %	25 %	50 %	10803596
1144	NC_001869	GGC	2	6	50590	50595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803596
1145	NC_001869	ACG	2	6	50613	50618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803596
1146	NC_001869	CCA	2	6	50632	50637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803596
1147	NC_001869	GCG	2	6	50768	50773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803596
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1149	NC_001869	TGA	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10803596
1150	NC_001869	CCG	2	6	50957	50962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803596
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1152	NC_001869	GAACG	2	10	50990	50999	40 %	0 %	40 %	20 %	10803596
1153	NC_001869	TCG	2	6	51027	51032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803596
1154	NC_001869	CCG	2	6	51062	51067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10803596
1155	NC_001869	GAG	2	6	51116	51121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803596
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1158	NC_001869	GGA	2	6	51301	51306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10803597
1159	NC_001869	TCGT	2	8	51341	51348	0 %	50 %	25 %	25 %	10803597
1160	NC_001869	ATC	2	6	51464	51469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803597
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1166	NC_001869	ACG	2	6	51801	51806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803597
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1168	NC_001869	CGG	2	6	51867	51872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803597
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1184	NC_001869	ACC	2	6	52411	52416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10803598
1185	NC_001869	TGCGCC	2	12	52417	52428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	10803598
1186	NC_001869	CT	3	6	52492	52497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1187	NC_001869	TGC	2	6	52539	52544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1188	NC_001869	GTC	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1189	NC_001869	GAT	2	6	52659	52664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1190	NC_001869	ACCG	2	8	52683	52690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1191	NC_001869	AGC	2	6	52695	52700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1192	NC_001869	TCC	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1193	NC_001869	CTG	2	6	52834	52839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10803599
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1201	NC_001869	TCA	2	6	53141	53146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10803599
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1229	NC_001869	GCG	2	6	54400	54405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1230	NC_001869	AGT	2	6	54439	54444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1231	NC_001869	TG	3	6	54447	54452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_001869	CTA	2	6	54485	54490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1233	NC_001869	CAGA	2	8	54564	54571	50 %	0 %	25 %	25 %	10803601
1234	NC_001869	CGA	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803601
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1238	NC_001869	GCG	2	6	54748	54753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803601
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1242	NC_001869	GAC	2	6	54992	54997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803602
1243	NC_001869	CGG	2	6	55034	55039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803602
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1245	NC_001869	GC	4	8	55204	55211	0 %	0 %	50 %	50 %	10803602
1246	NC_001869	CGA	2	6	55295	55300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10803602
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1248	NC_001869	GCG	3	9	55315	55323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10803602
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1250	NC_001869	GTT	2	6	55343	55348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10803602
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