MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_000921	TAA	2	6	193974	193979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611248
4003	NC_000921	C	6	6	194009	194014	0 %	0 %	0 %	100 %	15611248
4004	NC_000921	CTT	2	6	194024	194029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4005	NC_000921	TCT	2	6	194032	194037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4006	NC_000921	CTT	2	6	194165	194170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4007	NC_000921	T	6	6	194169	194174	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4008	NC_000921	TCA	2	6	194237	194242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611248
4009	NC_000921	TTC	2	6	194250	194255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4010	NC_000921	AATC	2	8	194342	194349	50 %	25 %	0 %	25 %	15611248
4011	NC_000921	TG	3	6	194352	194357	0 %	50 %	50 %	0 %	15611248
4012	NC_000921	T	7	7	194420	194426	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4013	NC_000921	TCT	2	6	194440	194445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4014	NC_000921	GC	3	6	194496	194501	0 %	0 %	50 %	50 %	15611248
4015	NC_000921	CTT	2	6	194528	194533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4016	NC_000921	T	6	6	194538	194543	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4017	NC_000921	CT	3	6	194547	194552	0 %	50 %	0 %	50 %	15611248
4018	NC_000921	CTT	2	6	194579	194584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611248
4019	NC_000921	CT	3	6	194592	194597	0 %	50 %	0 %	50 %	15611248
4020	NC_000921	CAA	2	6	194631	194636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611248
4021	NC_000921	CTTT	2	8	194656	194663	0 %	75 %	0 %	25 %	15611248
4022	NC_000921	AAT	2	6	194726	194731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611248
4023	NC_000921	ACC	2	6	194752	194757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611248
4024	NC_000921	TCAC	2	8	194761	194768	25 %	25 %	0 %	50 %	15611248
4025	NC_000921	C	6	6	194776	194781	0 %	0 %	0 %	100 %	15611248
4026	NC_000921	C	8	8	194873	194880	0 %	0 %	0 %	100 %	15611248
4027	NC_000921	TGT	2	6	194975	194980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611248
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4029	NC_000921	TC	3	6	195046	195051	0 %	50 %	0 %	50 %	15611248
4030	NC_000921	T	7	7	195055	195061	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4031	NC_000921	CA	3	6	195097	195102	50 %	0 %	0 %	50 %	15611248
4032	NC_000921	T	6	6	195189	195194	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4033	NC_000921	CGC	2	6	195363	195368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611248
4034	NC_000921	GTG	2	6	195397	195402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611248
4035	NC_000921	TAC	2	6	195489	195494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611248
4036	NC_000921	TAT	2	6	195509	195514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611248
4037	NC_000921	ATG	2	6	195516	195521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611248
4038	NC_000921	T	6	6	195639	195644	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4039	NC_000921	GAC	2	6	195720	195725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611248
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4041	NC_000921	T	7	7	195896	195902	0 %	100 %	0 %	0 %	15611248
4042	NC_000921	GCC	2	6	195940	195945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611248
4043	NC_000921	TTTG	2	8	195998	196005	0 %	75 %	25 %	0 %	15611248
4044	NC_000921	AAT	2	6	196044	196049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611248
4045	NC_000921	ATTTTC	2	12	196069	196080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15611248
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4053	NC_000921	CTG	2	6	196601	196606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611249
4054	NC_000921	A	6	6	196659	196664	100 %	0 %	0 %	0 %	15611249
4055	NC_000921	A	6	6	196768	196773	100 %	0 %	0 %	0 %	15611249
4056	NC_000921	ATA	2	6	196821	196826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611249
4057	NC_000921	TCT	2	6	196840	196845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611249
4058	NC_000921	TAC	2	6	196919	196924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_000921	AAT	2	6	196931	196936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_000921	TAA	2	6	196943	196948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_000921	A	7	7	196966	196972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_000921	TTCAA	2	10	196973	196982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4063	NC_000921	T	6	6	197007	197012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_000921	TAA	2	6	197021	197026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_000921	ACC	2	6	197036	197041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_000921	TAA	2	6	197042	197047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_000921	A	6	6	197139	197144	100 %	0 %	0 %	0 %	15611250
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4081	NC_000921	TCATT	2	10	197751	197760	20 %	60 %	0 %	20 %	15611250
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4083	NC_000921	TCAA	2	8	197862	197869	50 %	25 %	0 %	25 %	15611251
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4098	NC_000921	TGCA	2	8	198678	198685	25 %	25 %	25 %	25 %	15611252
4099	NC_000921	A	6	6	198791	198796	100 %	0 %	0 %	0 %	15611252
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4102	NC_000921	TGT	2	6	198955	198960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611252
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4105	NC_000921	A	7	7	199206	199212	100 %	0 %	0 %	0 %	15611252
4106	NC_000921	GTT	2	6	199340	199345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611252
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4109	NC_000921	A	6	6	199578	199583	100 %	0 %	0 %	0 %	15611252
4110	NC_000921	TTG	2	6	199589	199594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611252
4111	NC_000921	T	6	6	199610	199615	0 %	100 %	0 %	0 %	15611252
4112	NC_000921	TAA	2	6	199641	199646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_000921	ATT	2	6	199667	199672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_000921	TAA	2	6	199674	199679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_000921	TTTTC	2	10	199701	199710	0 %	80 %	0 %	20 %	15611253
4116	NC_000921	GATCA	2	10	199753	199762	40 %	20 %	20 %	20 %	15611253
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4119	NC_000921	A	7	7	199912	199918	100 %	0 %	0 %	0 %	15611253
4120	NC_000921	GCG	2	6	199960	199965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611253
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4123	NC_000921	CCAT	2	8	200102	200109	25 %	25 %	0 %	50 %	15611253
4124	NC_000921	A	6	6	200141	200146	100 %	0 %	0 %	0 %	15611253
4125	NC_000921	ACA	2	6	200153	200158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611253
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4127	NC_000921	GCGT	2	8	200198	200205	0 %	25 %	50 %	25 %	15611253
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4129	NC_000921	AAG	2	6	200288	200293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611253
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4139	NC_000921	TAT	2	6	200934	200939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611254
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4150	NC_000921	A	7	7	201526	201532	100 %	0 %	0 %	0 %	15611255
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4253	NC_000921	A	8	8	206698	206705	100 %	0 %	0 %	0 %	15611261
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4258	NC_000921	A	6	6	206903	206908	100 %	0 %	0 %	0 %	15611261
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4260	NC_000921	ATT	2	6	207041	207046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611261
4261	NC_000921	TTTG	2	8	207124	207131	0 %	75 %	25 %	0 %	15611261
4262	NC_000921	AAAT	2	8	207189	207196	75 %	25 %	0 %	0 %	15611261
4263	NC_000921	CTGTAT	2	12	207264	207275	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15611261
4264	NC_000921	TAA	2	6	207296	207301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611261
4265	NC_000921	ATCT	2	8	207302	207309	25 %	50 %	0 %	25 %	15611261
4266	NC_000921	CAT	2	6	207329	207334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611261
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4268	NC_000921	TA	3	6	207377	207382	50 %	50 %	0 %	0 %	15611261
4269	NC_000921	TTG	2	6	207395	207400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611261
4270	NC_000921	CTT	2	6	207439	207444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611261
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4272	NC_000921	T	6	6	207516	207521	0 %	100 %	0 %	0 %	15611261
4273	NC_000921	TCA	2	6	207525	207530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611261
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4275	NC_000921	T	6	6	207690	207695	0 %	100 %	0 %	0 %	15611261
4276	NC_000921	TTGTTT	2	12	207770	207781	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15611261
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4279	NC_000921	TTA	2	6	207822	207827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611261
4280	NC_000921	ATTG	2	8	207880	207887	25 %	50 %	25 %	0 %	15611261
4281	NC_000921	T	6	6	207911	207916	0 %	100 %	0 %	0 %	15611261
4282	NC_000921	ATT	2	6	207926	207931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611261
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4284	NC_000921	TAA	2	6	208004	208009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611261
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4287	NC_000921	GTC	2	6	208067	208072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611261
4288	NC_000921	TGAC	2	8	208179	208186	25 %	25 %	25 %	25 %	15611261
4289	NC_000921	TTC	2	6	208253	208258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611262
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4291	NC_000921	CAT	2	6	208327	208332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611262
4292	NC_000921	ATT	2	6	208373	208378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611262
4293	NC_000921	ACC	2	6	208392	208397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611262
4294	NC_000921	C	6	6	208400	208405	0 %	0 %	0 %	100 %	15611262
4295	NC_000921	TCA	2	6	208413	208418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611262
4296	NC_000921	ATTTA	2	10	208530	208539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_000921	AAACA	2	10	208552	208561	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4298	NC_000921	AAG	2	6	208614	208619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611263
4299	NC_000921	ATC	2	6	208643	208648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611263
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4321	NC_000921	A	6	6	209779	209784	100 %	0 %	0 %	0 %	15611264
4322	NC_000921	T	7	7	209796	209802	0 %	100 %	0 %	0 %	15611264
4323	NC_000921	TCGCT	2	10	209809	209818	0 %	40 %	20 %	40 %	15611264
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4326	NC_000921	TCTTTG	2	12	209948	209959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15611264
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4349	NC_000921	GTTT	2	8	211050	211057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_000921	T	6	6	212369	212374	0 %	100 %	0 %	0 %	15611265
4368	NC_000921	TGA	2	6	212427	212432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611265
4369	NC_000921	T	6	6	212480	212485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_000921	GC	3	6	212509	212514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4371	NC_000921	TTA	2	6	212539	212544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_000921	TGA	2	6	212611	212616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611266
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4374	NC_000921	T	7	7	212644	212650	0 %	100 %	0 %	0 %	15611266
4375	NC_000921	ATT	2	6	212695	212700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611266
4376	NC_000921	A	9	9	212770	212778	100 %	0 %	0 %	0 %	15611266
4377	NC_000921	T	6	6	212867	212872	0 %	100 %	0 %	0 %	15611266
4378	NC_000921	A	6	6	212895	212900	100 %	0 %	0 %	0 %	15611266
4379	NC_000921	A	6	6	212979	212984	100 %	0 %	0 %	0 %	15611266
4380	NC_000921	TCA	2	6	212993	212998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611266
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4382	NC_000921	GTT	2	6	213135	213140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611266
4383	NC_000921	T	7	7	213172	213178	0 %	100 %	0 %	0 %	15611266
4384	NC_000921	ATA	2	6	213214	213219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611266
4385	NC_000921	A	6	6	213219	213224	100 %	0 %	0 %	0 %	15611266
4386	NC_000921	AGA	2	6	213233	213238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611266
4387	NC_000921	GATCA	2	10	213246	213255	40 %	20 %	20 %	20 %	15611266
4388	NC_000921	AGCG	2	8	213260	213267	25 %	0 %	50 %	25 %	15611266
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