MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_000921	GCATC	2	10	1506292	1506301	20 %	20 %	20 %	40 %	15612438
31002	NC_000921	CTTT	2	8	1506303	1506310	0 %	75 %	0 %	25 %	15612438
31003	NC_000921	ATC	2	6	1506360	1506365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612438
31004	NC_000921	GT	3	6	1506414	1506419	0 %	50 %	50 %	0 %	15612438
31005	NC_000921	TAA	2	6	1506451	1506456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612438
31006	NC_000921	ATTTTC	2	12	1506512	1506523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15612438
31007	NC_000921	TCT	2	6	1506537	1506542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612438
31008	NC_000921	T	6	6	1506577	1506582	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31009	NC_000921	T	7	7	1506621	1506627	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31010	NC_000921	ATGA	2	8	1506647	1506654	50 %	25 %	25 %	0 %	15612438
31011	NC_000921	GC	3	6	1506655	1506660	0 %	0 %	50 %	50 %	15612438
31012	NC_000921	CGC	2	6	1506718	1506723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15612438
31013	NC_000921	AATC	2	8	1506730	1506737	50 %	25 %	0 %	25 %	15612438
31014	NC_000921	TTG	2	6	1506746	1506751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612438
31015	NC_000921	T	7	7	1506805	1506811	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31016	NC_000921	TCT	2	6	1506825	1506830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612438
31017	NC_000921	T	6	6	1506850	1506855	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31018	NC_000921	T	6	6	1506962	1506967	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31019	NC_000921	T	6	6	1506985	1506990	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31020	NC_000921	T	6	6	1507128	1507133	0 %	100 %	0 %	0 %	15612438
31021	NC_000921	AAAG	2	8	1507134	1507141	75 %	0 %	25 %	0 %	15612438
31022	NC_000921	ATCA	2	8	1507178	1507185	50 %	25 %	0 %	25 %	15612438
31023	NC_000921	T	7	7	1507353	1507359	0 %	100 %	0 %	0 %	15612439
31024	NC_000921	ACC	2	6	1507410	1507415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612439
31025	NC_000921	AAG	2	6	1507420	1507425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612439
31026	NC_000921	GC	3	6	1507434	1507439	0 %	0 %	50 %	50 %	15612439
31027	NC_000921	GCC	2	6	1507453	1507458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15612439
31028	NC_000921	GCT	2	6	1507487	1507492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612439
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31030	NC_000921	TCA	2	6	1507539	1507544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612439
31031	NC_000921	CAAA	2	8	1507561	1507568	75 %	0 %	0 %	25 %	15612439
31032	NC_000921	A	6	6	1507634	1507639	100 %	0 %	0 %	0 %	15612439
31033	NC_000921	CT	3	6	1507641	1507646	0 %	50 %	0 %	50 %	15612439
31034	NC_000921	GTT	2	6	1507675	1507680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612439
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31038	NC_000921	TCGC	2	8	1507810	1507817	0 %	25 %	25 %	50 %	15612439
31039	NC_000921	TGG	2	6	1507860	1507865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612439
31040	NC_000921	ACC	2	6	1507896	1507901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612439
31041	NC_000921	TTC	2	6	1507946	1507951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612439
31042	NC_000921	TTTG	2	8	1507997	1508004	0 %	75 %	25 %	0 %	15612440
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31045	NC_000921	T	7	7	1508173	1508179	0 %	100 %	0 %	0 %	15612440
31046	NC_000921	T	7	7	1508205	1508211	0 %	100 %	0 %	0 %	15612440
31047	NC_000921	AAT	2	6	1508232	1508237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612440
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31049	NC_000921	T	6	6	1508334	1508339	0 %	100 %	0 %	0 %	15612441
31050	NC_000921	ATTC	2	8	1508341	1508348	25 %	50 %	0 %	25 %	15612441
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31053	NC_000921	T	7	7	1508495	1508501	0 %	100 %	0 %	0 %	15612441
31054	NC_000921	A	6	6	1508546	1508551	100 %	0 %	0 %	0 %	15612441
31055	NC_000921	CTT	2	6	1508563	1508568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612441
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31057	NC_000921	AAG	2	6	1508665	1508670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612441
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31059	NC_000921	TTA	2	6	1508718	1508723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612441
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31061	NC_000921	CAAAAA	2	12	1508849	1508860	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15612441
31062	NC_000921	TCA	2	6	1508908	1508913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612441
31063	NC_000921	ATC	2	6	1508945	1508950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612441
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31065	NC_000921	T	6	6	1508965	1508970	0 %	100 %	0 %	0 %	15612441
31066	NC_000921	CTTG	2	8	1508971	1508978	0 %	50 %	25 %	25 %	15612441
31067	NC_000921	T	6	6	1508990	1508995	0 %	100 %	0 %	0 %	15612441
31068	NC_000921	ATG	2	6	1508997	1509002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612441
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31070	NC_000921	GCAT	2	8	1509123	1509130	25 %	25 %	25 %	25 %	15612442
31071	NC_000921	T	6	6	1509130	1509135	0 %	100 %	0 %	0 %	15612442
31072	NC_000921	CAAC	2	8	1509187	1509194	50 %	0 %	0 %	50 %	15612442
31073	NC_000921	CAA	2	6	1509223	1509228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612442
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31076	NC_000921	AAATA	2	10	1509368	1509377	80 %	20 %	0 %	0 %	15612442
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31078	NC_000921	CATT	2	8	1509451	1509458	25 %	50 %	0 %	25 %	15612442
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31082	NC_000921	AC	3	6	1509683	1509688	50 %	0 %	0 %	50 %	15612443
31083	NC_000921	TCA	2	6	1509714	1509719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612443
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31086	NC_000921	TCG	2	6	1509842	1509847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612443
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31088	NC_000921	T	6	6	1509942	1509947	0 %	100 %	0 %	0 %	15612443
31089	NC_000921	A	6	6	1509977	1509982	100 %	0 %	0 %	0 %	15612443
31090	NC_000921	TGA	2	6	1510011	1510016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612443
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31092	NC_000921	GCAT	2	8	1510137	1510144	25 %	25 %	25 %	25 %	15612444
31093	NC_000921	CA	3	6	1510236	1510241	50 %	0 %	0 %	50 %	15612444
31094	NC_000921	CAT	2	6	1510247	1510252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612444
31095	NC_000921	AGA	2	6	1510268	1510273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612444
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31101	NC_000921	GCGTT	2	10	1510698	1510707	0 %	40 %	40 %	20 %	15612444
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31103	NC_000921	T	6	6	1510873	1510878	0 %	100 %	0 %	0 %	15612444
31104	NC_000921	CTT	2	6	1510879	1510884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612444
31105	NC_000921	AAAG	2	8	1510919	1510926	75 %	0 %	25 %	0 %	15612444
31106	NC_000921	AGGA	2	8	1510977	1510984	50 %	0 %	50 %	0 %	15612444
31107	NC_000921	T	6	6	1511008	1511013	0 %	100 %	0 %	0 %	15612444
31108	NC_000921	A	7	7	1511141	1511147	100 %	0 %	0 %	0 %	15612444
31109	NC_000921	T	6	6	1511167	1511172	0 %	100 %	0 %	0 %	15612445
31110	NC_000921	A	6	6	1511184	1511189	100 %	0 %	0 %	0 %	15612445
31111	NC_000921	GCAA	2	8	1511313	1511320	50 %	0 %	25 %	25 %	15612445
31112	NC_000921	TGT	2	6	1511349	1511354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612445
31113	NC_000921	TCA	2	6	1511481	1511486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612445
31114	NC_000921	TAAAA	2	10	1511547	1511556	80 %	20 %	0 %	0 %	15612445
31115	NC_000921	CA	3	6	1511588	1511593	50 %	0 %	0 %	50 %	15612445
31116	NC_000921	T	6	6	1511634	1511639	0 %	100 %	0 %	0 %	15612445
31117	NC_000921	GCA	2	6	1511688	1511693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612445
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31120	NC_000921	TAA	2	6	1511903	1511908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612445
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31122	NC_000921	CCA	3	9	1512105	1512113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612445
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31242	NC_000921	GTT	2	6	1517917	1517922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31491	NC_000921	A	6	6	1530722	1530727	100 %	0 %	0 %	0 %	15612464
31492	NC_000921	ACG	2	6	1530744	1530749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15612464
31493	NC_000921	TGGT	2	8	1530777	1530784	0 %	50 %	50 %	0 %	15612464
31494	NC_000921	CCG	2	6	1530856	1530861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15612464
31495	NC_000921	CAT	2	6	1530862	1530867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612464
31496	NC_000921	CAC	2	6	1530899	1530904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612464
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31498	NC_000921	A	6	6	1531070	1531075	100 %	0 %	0 %	0 %	15612464
31499	NC_000921	CAAA	2	8	1531105	1531112	75 %	0 %	0 %	25 %	15612464
31500	NC_000921	CAC	2	6	1531113	1531118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612464

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