MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_000921	ACT	2	6	1456083	1456088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612391
30003	NC_000921	CTTTGG	2	12	1456188	1456199	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15612391
30004	NC_000921	CTTG	2	8	1456218	1456225	0 %	50 %	25 %	25 %	15612391
30005	NC_000921	A	6	6	1456237	1456242	100 %	0 %	0 %	0 %	15612391
30006	NC_000921	GCGTTA	2	12	1456265	1456276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15612391
30007	NC_000921	TG	4	8	1456298	1456305	0 %	50 %	50 %	0 %	15612391
30008	NC_000921	TC	3	6	1456320	1456325	0 %	50 %	0 %	50 %	15612391
30009	NC_000921	T	6	6	1456381	1456386	0 %	100 %	0 %	0 %	15612391
30010	NC_000921	TAA	2	6	1456447	1456452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612391
30011	NC_000921	CTTT	2	8	1456469	1456476	0 %	75 %	0 %	25 %	15612391
30012	NC_000921	GTC	2	6	1456591	1456596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15612391
30013	NC_000921	TCA	2	6	1456607	1456612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612391
30014	NC_000921	TTG	2	6	1456724	1456729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612391
30015	NC_000921	AC	3	6	1456754	1456759	50 %	0 %	0 %	50 %	15612391
30016	NC_000921	TTA	2	6	1456766	1456771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612391
30017	NC_000921	T	6	6	1456822	1456827	0 %	100 %	0 %	0 %	15612391
30018	NC_000921	T	6	6	1456838	1456843	0 %	100 %	0 %	0 %	15612391
30019	NC_000921	GTTG	2	8	1456942	1456949	0 %	50 %	50 %	0 %	15612391
30020	NC_000921	G	11	11	1456957	1456967	0 %	0 %	100 %	0 %	15612391
30021	NC_000921	T	6	6	1457080	1457085	0 %	100 %	0 %	0 %	15612391
30022	NC_000921	ATG	2	6	1457129	1457134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612391
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30025	NC_000921	ATG	2	6	1457318	1457323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612391
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30030	NC_000921	CTTTC	2	10	1457658	1457667	0 %	60 %	0 %	40 %	15612391
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30041	NC_000921	A	7	7	1458237	1458243	100 %	0 %	0 %	0 %	15612391
30042	NC_000921	GTG	2	6	1458316	1458321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612391
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30045	NC_000921	ATCT	2	8	1458466	1458473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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30053	NC_000921	TTCA	2	8	1458748	1458755	25 %	50 %	0 %	25 %	15612392
30054	NC_000921	AATG	2	8	1458823	1458830	50 %	25 %	25 %	0 %	15612392
30055	NC_000921	ATG	2	6	1458844	1458849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612392
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30061	NC_000921	TCAA	2	8	1459193	1459200	50 %	25 %	0 %	25 %	15612392
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30088	NC_000921	TAT	2	6	1460372	1460377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30093	NC_000921	TTG	2	6	1460672	1460677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30094	NC_000921	TTTG	2	8	1460725	1460732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30095	NC_000921	T	7	7	1460742	1460748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30096	NC_000921	CTAAGT	2	12	1460808	1460819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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30101	NC_000921	A	6	6	1460989	1460994	100 %	0 %	0 %	0 %	15612395
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30105	NC_000921	CTCGCA	2	12	1461113	1461124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15612395
30106	NC_000921	CAAAA	2	10	1461170	1461179	80 %	0 %	0 %	20 %	15612395
30107	NC_000921	T	6	6	1461202	1461207	0 %	100 %	0 %	0 %	15612395
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30112	NC_000921	AACA	2	8	1461563	1461570	75 %	0 %	0 %	25 %	15612396
30113	NC_000921	T	6	6	1461573	1461578	0 %	100 %	0 %	0 %	15612396
30114	NC_000921	TGG	3	9	1461641	1461649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15612396
30115	NC_000921	GAT	2	6	1461668	1461673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612396
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30118	NC_000921	ATAA	2	8	1462048	1462055	75 %	25 %	0 %	0 %	15612396
30119	NC_000921	AGA	2	6	1462103	1462108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612397
30120	NC_000921	A	6	6	1462164	1462169	100 %	0 %	0 %	0 %	15612397
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30122	NC_000921	GTT	2	6	1462253	1462258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612397
30123	NC_000921	TTA	2	6	1462283	1462288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612397
30124	NC_000921	TAA	2	6	1462330	1462335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612397
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30126	NC_000921	TCA	2	6	1462382	1462387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612397
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30130	NC_000921	A	6	6	1462613	1462618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30131	NC_000921	CAAG	2	8	1462662	1462669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30132	NC_000921	TAC	2	6	1462700	1462705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30134	NC_000921	TAAG	2	8	1462813	1462820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30135	NC_000921	AAG	2	6	1462840	1462845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30136	NC_000921	CAAG	2	8	1462867	1462874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30137	NC_000921	AAAC	2	8	1462884	1462891	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30138	NC_000921	A	7	7	1462936	1462942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30139	NC_000921	CAA	2	6	1462974	1462979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30141	NC_000921	TG	4	8	1463108	1463115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30142	NC_000921	TG	3	6	1463350	1463355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30143	NC_000921	ATG	2	6	1463376	1463381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30144	NC_000921	CGT	2	6	1463388	1463393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30145	NC_000921	TCC	3	9	1463402	1463410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30146	NC_000921	CACGA	2	10	1463502	1463511	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30147	NC_000921	GAC	2	6	1463515	1463520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30148	NC_000921	GCA	2	6	1463527	1463532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30149	NC_000921	TC	3	6	1463582	1463587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30150	NC_000921	TTC	2	6	1463608	1463613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30152	NC_000921	CAA	2	6	1463752	1463757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30153	NC_000921	CATC	2	8	1463762	1463769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30154	NC_000921	CAG	2	6	1463847	1463852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30155	NC_000921	ACCT	2	8	1463916	1463923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30156	NC_000921	TAG	2	6	1463940	1463945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30157	NC_000921	CTGA	2	8	1463987	1463994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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30160	NC_000921	TCC	2	6	1464152	1464157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30164	NC_000921	TTACC	2	10	1464300	1464309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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30168	NC_000921	TGT	2	6	1464586	1464591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30172	NC_000921	ATC	2	6	1464752	1464757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30175	NC_000921	ATC	2	6	1464775	1464780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30177	NC_000921	AAT	2	6	1464878	1464883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30230	NC_000921	TGAAG	2	10	1467567	1467576	40 %	20 %	40 %	0 %	15612402
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30234	NC_000921	ATT	2	6	1467738	1467743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612402
30235	NC_000921	A	7	7	1467809	1467815	100 %	0 %	0 %	0 %	15612402
30236	NC_000921	ATA	2	6	1467936	1467941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612402
30237	NC_000921	GAAA	2	8	1467944	1467951	75 %	0 %	25 %	0 %	15612403
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30240	NC_000921	ACAG	2	8	1468059	1468066	50 %	0 %	25 %	25 %	15612403
30241	NC_000921	GACT	2	8	1468096	1468103	25 %	25 %	25 %	25 %	15612403
30242	NC_000921	CCA	2	6	1468346	1468351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15612403
30243	NC_000921	A	6	6	1468408	1468413	100 %	0 %	0 %	0 %	15612404
30244	NC_000921	CAT	2	6	1468446	1468451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612404
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30351	NC_000921	AACTTG	2	12	1473510	1473521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15612410
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30353	NC_000921	T	6	6	1473641	1473646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30354	NC_000921	AT	3	6	1473729	1473734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30355	NC_000921	A	6	6	1473768	1473773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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