MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_000921	T	8	8	1161398	1161405	0 %	100 %	0 %	0 %	15612110
24003	NC_000921	AGA	2	6	1161463	1161468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612110
24004	NC_000921	GCC	2	6	1161479	1161484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15612110
24005	NC_000921	ACA	2	6	1161497	1161502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612110
24006	NC_000921	TAA	2	6	1161548	1161553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612110
24007	NC_000921	ATG	2	6	1161662	1161667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612110
24008	NC_000921	CTTT	2	8	1161729	1161736	0 %	75 %	0 %	25 %	15612110
24009	NC_000921	AAGC	2	8	1161897	1161904	50 %	0 %	25 %	25 %	15612110
24010	NC_000921	CGCT	2	8	1161943	1161950	0 %	25 %	25 %	50 %	15612110
24011	NC_000921	TTA	3	9	1161959	1161967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612110
24012	NC_000921	CCT	2	6	1161972	1161977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15612110
24013	NC_000921	TAAA	2	8	1162032	1162039	75 %	25 %	0 %	0 %	15612110
24014	NC_000921	CAAA	2	8	1162051	1162058	75 %	0 %	0 %	25 %	15612110
24015	NC_000921	TTGC	2	8	1162073	1162080	0 %	50 %	25 %	25 %	15612110
24016	NC_000921	CTC	2	6	1162095	1162100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24017	NC_000921	ATTA	2	8	1162105	1162112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24018	NC_000921	TGCG	2	8	1162155	1162162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24019	NC_000921	AACA	2	8	1162173	1162180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24020	NC_000921	CA	3	6	1162199	1162204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24021	NC_000921	TC	3	6	1162225	1162230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24022	NC_000921	CTCC	2	8	1162303	1162310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24023	NC_000921	A	6	6	1162312	1162317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_000921	TCA	2	6	1162505	1162510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612111
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24028	NC_000921	TCGCAT	2	12	1162710	1162721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15612111
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24047	NC_000921	T	6	6	1163590	1163595	0 %	100 %	0 %	0 %	15612111
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24054	NC_000921	G	7	7	1163944	1163950	0 %	0 %	100 %	0 %	15612111
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24058	NC_000921	A	6	6	1164020	1164025	100 %	0 %	0 %	0 %	15612111
24059	NC_000921	GTT	2	6	1164072	1164077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24062	NC_000921	AAAT	2	8	1164158	1164165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24117	NC_000921	TTA	2	6	1166541	1166546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24119	NC_000921	TTC	2	6	1166648	1166653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612114
24120	NC_000921	TGAG	2	8	1166660	1166667	25 %	25 %	50 %	0 %	15612114
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24122	NC_000921	CAT	2	6	1166693	1166698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612114
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24245	NC_000921	ATC	2	6	1172412	1172417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612121
24246	NC_000921	TCA	2	6	1172426	1172431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612121
24247	NC_000921	A	6	6	1172534	1172539	100 %	0 %	0 %	0 %	15612121
24248	NC_000921	TA	3	6	1172555	1172560	50 %	50 %	0 %	0 %	15612121
24249	NC_000921	TCA	2	6	1172602	1172607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612121
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24251	NC_000921	GTT	2	6	1172738	1172743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612121
24252	NC_000921	CT	3	6	1172745	1172750	0 %	50 %	0 %	50 %	15612121
24253	NC_000921	TTC	2	6	1172763	1172768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612121
24254	NC_000921	T	7	7	1172776	1172782	0 %	100 %	0 %	0 %	15612121
24255	NC_000921	TGTC	2	8	1172804	1172811	0 %	50 %	25 %	25 %	15612121
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24259	NC_000921	CTT	2	6	1172867	1172872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612121
24260	NC_000921	TTC	2	6	1172877	1172882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612121
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24273	NC_000921	CTAT	2	8	1173319	1173326	25 %	50 %	0 %	25 %	15612122
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24283	NC_000921	AGA	2	6	1173840	1173845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612123
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24304	NC_000921	TCAT	2	8	1175313	1175320	25 %	50 %	0 %	25 %	15612125
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24329	NC_000921	TTTC	2	8	1176863	1176870	0 %	75 %	0 %	25 %	15612126
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24331	NC_000921	TCT	2	6	1176995	1177000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612127
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24333	NC_000921	CACGCT	2	12	1177066	1177077	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15612127
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24336	NC_000921	TTTGA	2	10	1177297	1177306	20 %	60 %	20 %	0 %	15612127
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24339	NC_000921	ATC	2	6	1177630	1177635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612127
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24344	NC_000921	GTTT	2	8	1177898	1177905	0 %	75 %	25 %	0 %	15612127
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24348	NC_000921	TCT	3	9	1178210	1178218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612127
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24350	NC_000921	TTC	2	6	1178395	1178400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612127
24351	NC_000921	TTATCT	2	12	1178418	1178429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15612127
24352	NC_000921	GATT	2	8	1178435	1178442	25 %	50 %	25 %	0 %	15612128
24353	NC_000921	T	8	8	1178470	1178477	0 %	100 %	0 %	0 %	15612128
24354	NC_000921	TCT	2	6	1178484	1178489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612128
24355	NC_000921	T	6	6	1178540	1178545	0 %	100 %	0 %	0 %	15612128
24356	NC_000921	CTT	2	6	1178608	1178613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612128
24357	NC_000921	ATT	2	6	1178621	1178626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612128
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24359	NC_000921	T	6	6	1178782	1178787	0 %	100 %	0 %	0 %	15612128
24360	NC_000921	T	6	6	1178810	1178815	0 %	100 %	0 %	0 %	15612128
24361	NC_000921	TTC	2	6	1178900	1178905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612128
24362	NC_000921	T	6	6	1179035	1179040	0 %	100 %	0 %	0 %	15612129
24363	NC_000921	CT	4	8	1179042	1179049	0 %	50 %	0 %	50 %	15612129
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24365	NC_000921	CTT	2	6	1179187	1179192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612129
24366	NC_000921	AAT	2	6	1179206	1179211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612129
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24378	NC_000921	CAA	3	9	1179875	1179883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612130
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24380	NC_000921	TTTC	2	8	1179944	1179951	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24478	NC_000921	TTTC	2	8	1184198	1184205	0 %	75 %	0 %	25 %	15612135
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24487	NC_000921	TTTG	2	8	1184598	1184605	0 %	75 %	25 %	0 %	15612135
24488	NC_000921	TCT	2	6	1184611	1184616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612135
24489	NC_000921	T	7	7	1184621	1184627	0 %	100 %	0 %	0 %	15612135
24490	NC_000921	GTT	2	6	1184675	1184680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612135
24491	NC_000921	T	6	6	1184679	1184684	0 %	100 %	0 %	0 %	15612135
24492	NC_000921	TAT	2	6	1184729	1184734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612135
24493	NC_000921	TTA	2	6	1184786	1184791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612135
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