MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_000921	ATT	2	6	1040040	1040045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612003
21503	NC_000921	GCTCAA	2	12	1040052	1040063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15612003
21504	NC_000921	TAG	3	9	1040117	1040125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612003
21505	NC_000921	AG	3	6	1040180	1040185	50 %	0 %	50 %	0 %	15612003
21506	NC_000921	AAAGC	2	10	1040210	1040219	60 %	0 %	20 %	20 %	15612003
21507	NC_000921	CAA	2	6	1040268	1040273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612003
21508	NC_000921	CAAACC	2	12	1040361	1040372	50 %	0 %	0 %	50 %	15612003
21509	NC_000921	AGTGGC	2	12	1040406	1040417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15612003
21510	NC_000921	G	6	6	1040464	1040469	0 %	0 %	100 %	0 %	15612003
21511	NC_000921	TGT	2	6	1040473	1040478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15612003
21512	NC_000921	AGA	2	6	1040543	1040548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612003
21513	NC_000921	ATA	2	6	1040593	1040598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612003
21514	NC_000921	ATA	2	6	1040686	1040691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612003
21515	NC_000921	ATT	2	6	1040704	1040709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612003
21516	NC_000921	AAGCC	2	10	1040846	1040855	40 %	0 %	20 %	40 %	15612003
21517	NC_000921	TCAA	2	8	1040866	1040873	50 %	25 %	0 %	25 %	15612003
21518	NC_000921	TTAC	2	8	1040883	1040890	25 %	50 %	0 %	25 %	15612003
21519	NC_000921	GAT	2	6	1040970	1040975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612003
21520	NC_000921	ATG	2	6	1040992	1040997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612003
21521	NC_000921	ACAA	2	8	1041025	1041032	75 %	0 %	0 %	25 %	15612003
21522	NC_000921	A	6	6	1041040	1041045	100 %	0 %	0 %	0 %	15612003
21523	NC_000921	GAAAGA	2	12	1041054	1041065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15612003
21524	NC_000921	TGA	2	6	1041149	1041154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612004
21525	NC_000921	GA	3	6	1041153	1041158	50 %	0 %	50 %	0 %	15612004
21526	NC_000921	T	8	8	1041170	1041177	0 %	100 %	0 %	0 %	15612004
21527	NC_000921	ACTTT	2	10	1041216	1041225	20 %	60 %	0 %	20 %	15612004
21528	NC_000921	A	6	6	1041283	1041288	100 %	0 %	0 %	0 %	15612004
21529	NC_000921	T	6	6	1041355	1041360	0 %	100 %	0 %	0 %	15612004
21530	NC_000921	AAC	2	6	1041386	1041391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15612004
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21533	NC_000921	T	6	6	1041541	1041546	0 %	100 %	0 %	0 %	15612004
21534	NC_000921	CTT	2	6	1041563	1041568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612004
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21537	NC_000921	ATC	2	6	1041667	1041672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15612004
21538	NC_000921	TTTCA	2	10	1041757	1041766	20 %	60 %	0 %	20 %	15612004
21539	NC_000921	T	8	8	1041819	1041826	0 %	100 %	0 %	0 %	15612004
21540	NC_000921	TTC	2	6	1041832	1041837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612004
21541	NC_000921	TCT	2	6	1041851	1041856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612004
21542	NC_000921	ATTAA	2	10	1041863	1041872	60 %	40 %	0 %	0 %	15612004
21543	NC_000921	TCT	3	9	1041890	1041898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612004
21544	NC_000921	TCT	2	6	1042010	1042015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612004
21545	NC_000921	TAA	2	6	1042060	1042065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612004
21546	NC_000921	TAA	2	6	1042111	1042116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15612004
21547	NC_000921	TAATC	2	10	1042147	1042156	40 %	40 %	0 %	20 %	15612004
21548	NC_000921	TAA	2	6	1042182	1042187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21549	NC_000921	AT	3	6	1042221	1042226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21550	NC_000921	AAT	3	9	1042228	1042236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21551	NC_000921	AGTT	2	8	1042265	1042272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21552	NC_000921	ATT	2	6	1042276	1042281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21553	NC_000921	ATT	2	6	1042285	1042290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21554	NC_000921	AT	3	6	1042297	1042302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21555	NC_000921	ATA	3	9	1042312	1042320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21556	NC_000921	ATCT	2	8	1042349	1042356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21557	NC_000921	AAT	2	6	1042357	1042362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21558	NC_000921	TAA	3	9	1042370	1042378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21559	NC_000921	A	6	6	1042429	1042434	100 %	0 %	0 %	0 %	15612005
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21570	NC_000921	A	7	7	1043050	1043056	100 %	0 %	0 %	0 %	15612005
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21588	NC_000921	ATT	2	6	1043637	1043642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_000921	ACC	2	6	1043678	1043683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21609	NC_000921	GT	3	6	1044774	1044779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21610	NC_000921	TCTA	2	8	1044790	1044797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21611	NC_000921	A	6	6	1044919	1044924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21612	NC_000921	AAT	2	6	1044968	1044973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21613	NC_000921	ATTG	2	8	1044988	1044995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21614	NC_000921	TTG	2	6	1045167	1045172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21615	NC_000921	TAC	2	6	1045185	1045190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21617	NC_000921	A	6	6	1045388	1045393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21619	NC_000921	TC	3	6	1045430	1045435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21620	NC_000921	T	6	6	1045515	1045520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21621	NC_000921	CA	3	6	1045573	1045578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21622	NC_000921	TGCTA	2	10	1045621	1045630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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21995	NC_000921	CTT	2	6	1063734	1063739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15612022
21996	NC_000921	A	6	6	1063758	1063763	100 %	0 %	0 %	0 %	15612022
21997	NC_000921	ATT	2	6	1063774	1063779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15612022
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22000	NC_000921	ATG	2	6	1063870	1063875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15612022

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