MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_000921	GCAA	2	8	945215	945222	50 %	0 %	25 %	25 %	15611922
19503	NC_000921	CAC	3	9	945232	945240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611922
19504	NC_000921	GCC	2	6	945245	945250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611922
19505	NC_000921	AAAAT	2	10	945282	945291	80 %	20 %	0 %	0 %	15611922
19506	NC_000921	GTTT	2	8	945345	945352	0 %	75 %	25 %	0 %	15611922
19507	NC_000921	A	7	7	945357	945363	100 %	0 %	0 %	0 %	15611922
19508	NC_000921	GAAA	2	8	945442	945449	75 %	0 %	25 %	0 %	15611922
19509	NC_000921	ATTTC	2	10	945462	945471	20 %	60 %	0 %	20 %	15611922
19510	NC_000921	TCA	2	6	945486	945491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611922
19511	NC_000921	GGT	2	6	945540	945545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611922
19512	NC_000921	TGG	2	6	945576	945581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611922
19513	NC_000921	ATT	2	6	945603	945608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611922
19514	NC_000921	GTTT	2	8	945633	945640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_000921	TAA	2	6	945667	945672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_000921	GATT	2	8	945710	945717	25 %	50 %	25 %	0 %	15611923
19517	NC_000921	A	7	7	945820	945826	100 %	0 %	0 %	0 %	15611923
19518	NC_000921	TAA	2	6	945849	945854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
19519	NC_000921	T	6	6	945864	945869	0 %	100 %	0 %	0 %	15611923
19520	NC_000921	G	6	6	945901	945906	0 %	0 %	100 %	0 %	15611923
19521	NC_000921	GTC	2	6	945948	945953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611923
19522	NC_000921	TAG	2	6	946020	946025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611923
19523	NC_000921	TTA	2	6	946044	946049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611923
19524	NC_000921	TGG	2	6	946077	946082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611923
19525	NC_000921	TGG	2	6	946107	946112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611923
19526	NC_000921	G	6	6	946126	946131	0 %	0 %	100 %	0 %	15611923
19527	NC_000921	ATCA	2	8	946300	946307	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19528	NC_000921	GAC	2	6	946399	946404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611923
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19531	NC_000921	TCAA	2	8	946457	946464	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19532	NC_000921	TCAA	2	8	946472	946479	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19533	NC_000921	TCAA	2	8	946532	946539	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19534	NC_000921	TCAA	2	8	946589	946596	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19535	NC_000921	TAA	2	6	946629	946634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
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19539	NC_000921	TCAA	2	8	946772	946779	50 %	25 %	0 %	25 %	15611923
19540	NC_000921	TAA	3	9	946785	946793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
19541	NC_000921	TAA	2	6	946911	946916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
19542	NC_000921	ATG	2	6	946922	946927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611923
19543	NC_000921	TAT	2	6	946986	946991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611923
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19546	NC_000921	ACA	2	6	947090	947095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611923
19547	NC_000921	ACCA	2	8	947173	947180	50 %	0 %	0 %	50 %	15611923
19548	NC_000921	CAA	2	6	947188	947193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611923
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19553	NC_000921	CAAAA	2	10	947533	947542	80 %	0 %	0 %	20 %	15611923
19554	NC_000921	CAAA	2	8	947549	947556	75 %	0 %	0 %	25 %	15611923
19555	NC_000921	TAT	2	6	947563	947568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611923
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19558	NC_000921	AAT	2	6	947791	947796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
19559	NC_000921	TGG	2	6	947829	947834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611923
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19562	NC_000921	AAT	2	6	947968	947973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
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19573	NC_000921	GTTT	2	8	948834	948841	0 %	75 %	25 %	0 %	15611923
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19592	NC_000921	TTC	2	6	949689	949694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611923
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19597	NC_000921	TAA	2	6	949857	949862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611923
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19600	NC_000921	CAAG	2	8	950001	950008	50 %	0 %	25 %	25 %	15611923
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19605	NC_000921	CATC	2	8	950207	950214	25 %	25 %	0 %	50 %	15611923
19606	NC_000921	TA	3	6	950290	950295	50 %	50 %	0 %	0 %	15611923
19607	NC_000921	C	6	6	950349	950354	0 %	0 %	0 %	100 %	15611923
19608	NC_000921	TTG	2	6	950395	950400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611923
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