MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_000921	AAT	2	6	824026	824031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611810
17003	NC_000921	CTT	2	6	824085	824090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611810
17004	NC_000921	AAT	2	6	824109	824114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611810
17005	NC_000921	GAG	2	6	824206	824211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611810
17006	NC_000921	T	8	8	824216	824223	0 %	100 %	0 %	0 %	15611810
17007	NC_000921	A	6	6	824232	824237	100 %	0 %	0 %	0 %	15611810
17008	NC_000921	TTG	2	6	824316	824321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611810
17009	NC_000921	ATT	2	6	824324	824329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611810
17010	NC_000921	ATT	2	6	824360	824365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611810
17011	NC_000921	TGG	3	9	824386	824394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611810
17012	NC_000921	CGG	2	6	824397	824402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611810
17013	NC_000921	GTTT	2	8	824442	824449	0 %	75 %	25 %	0 %	15611810
17014	NC_000921	CAC	2	6	824498	824503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611810
17015	NC_000921	CGG	2	6	824508	824513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611810
17016	NC_000921	A	6	6	824522	824527	100 %	0 %	0 %	0 %	15611810
17017	NC_000921	T	6	6	824580	824585	0 %	100 %	0 %	0 %	15611810
17018	NC_000921	TTGG	2	8	824654	824661	0 %	50 %	50 %	0 %	15611810
17019	NC_000921	TCATG	2	10	824680	824689	20 %	40 %	20 %	20 %	15611810
17020	NC_000921	C	6	6	824715	824720	0 %	0 %	0 %	100 %	15611810
17021	NC_000921	AGT	2	6	824743	824748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611810
17022	NC_000921	TGA	2	6	824809	824814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611810
17023	NC_000921	GC	3	6	824836	824841	0 %	0 %	50 %	50 %	15611810
17024	NC_000921	ATA	2	6	824873	824878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611810
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17026	NC_000921	CAA	2	6	824930	824935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611810
17027	NC_000921	TA	3	6	825011	825016	50 %	50 %	0 %	0 %	15611810
17028	NC_000921	TGA	2	6	825193	825198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611810
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17030	NC_000921	C	6	6	825246	825251	0 %	0 %	0 %	100 %	15611810
17031	NC_000921	ACTG	2	8	825273	825280	25 %	25 %	25 %	25 %	15611810
17032	NC_000921	GC	3	6	825322	825327	0 %	0 %	50 %	50 %	15611810
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17034	NC_000921	GCA	2	6	825415	825420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611810
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17038	NC_000921	T	7	7	825611	825617	0 %	100 %	0 %	0 %	15611810
17039	NC_000921	A	6	6	825618	825623	100 %	0 %	0 %	0 %	15611810
17040	NC_000921	CGAC	2	8	825676	825683	25 %	0 %	25 %	50 %	15611810
17041	NC_000921	A	6	6	825687	825692	100 %	0 %	0 %	0 %	15611810
17042	NC_000921	CATT	2	8	825718	825725	25 %	50 %	0 %	25 %	15611810
17043	NC_000921	ATT	2	6	825774	825779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_000921	TTAT	2	8	825918	825925	25 %	75 %	0 %	0 %	15611811
17045	NC_000921	GAA	2	6	825935	825940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611811
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17052	NC_000921	TTCA	2	8	826474	826481	25 %	50 %	0 %	25 %	15611812
17053	NC_000921	GA	3	6	826542	826547	50 %	0 %	50 %	0 %	15611812
17054	NC_000921	CTT	2	6	826620	826625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611812
17055	NC_000921	CTT	2	6	826629	826634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611812
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17057	NC_000921	TTC	2	6	826699	826704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611812
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17062	NC_000921	T	9	9	826794	826802	0 %	100 %	0 %	0 %	15611812
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17075	NC_000921	CT	3	6	827334	827339	0 %	50 %	0 %	50 %	15611813
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17088	NC_000921	A	6	6	827754	827759	100 %	0 %	0 %	0 %	15611814
17089	NC_000921	TTCT	2	8	827807	827814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17090	NC_000921	ACCA	2	8	827822	827829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17091	NC_000921	A	6	6	827864	827869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_000921	T	14	14	827909	827922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_000921	TAT	2	6	827958	827963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_000921	TTCC	2	8	827965	827972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17095	NC_000921	TAT	3	9	828172	828180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_000921	ATT	3	9	828183	828191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_000921	ATTTT	2	10	828213	828222	20 %	80 %	0 %	0 %	15611815
17098	NC_000921	T	8	8	828219	828226	0 %	100 %	0 %	0 %	15611815
17099	NC_000921	CTT	2	6	828295	828300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611815
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17101	NC_000921	CAAA	2	8	828418	828425	75 %	0 %	0 %	25 %	15611815
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17109	NC_000921	TCA	2	6	828705	828710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611815
17110	NC_000921	TGA	2	6	828729	828734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611815
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17112	NC_000921	T	9	9	828820	828828	0 %	100 %	0 %	0 %	15611815
17113	NC_000921	A	6	6	828978	828983	100 %	0 %	0 %	0 %	15611815
17114	NC_000921	A	6	6	828999	829004	100 %	0 %	0 %	0 %	15611815
17115	NC_000921	ATG	2	6	829010	829015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611815
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17117	NC_000921	TCT	3	9	829056	829064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611815
17118	NC_000921	A	6	6	829100	829105	100 %	0 %	0 %	0 %	15611815
17119	NC_000921	TTCA	2	8	829229	829236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17120	NC_000921	AACC	2	8	829247	829254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17121	NC_000921	GAA	2	6	829385	829390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611816
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17124	NC_000921	ACC	2	6	829694	829699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611816
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17126	NC_000921	ATAGAA	2	12	829745	829756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15611816
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17249	NC_000921	A	6	6	836412	836417	100 %	0 %	0 %	0 %	15611824
17250	NC_000921	A	6	6	836471	836476	100 %	0 %	0 %	0 %	15611824
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