MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000921	A	6	6	49937	49942	100 %	0 %	0 %	0 %	15611114
1002	NC_000921	GATT	2	8	49961	49968	25 %	50 %	25 %	0 %	15611114
1003	NC_000921	AGG	2	6	49970	49975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611114
1004	NC_000921	TGT	2	6	50084	50089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611114
1005	NC_000921	AGG	2	6	50091	50096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611114
1006	NC_000921	TGA	2	6	50102	50107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611114
1007	NC_000921	TGG	2	6	50131	50136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611114
1008	NC_000921	TGA	2	6	50144	50149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611114
1009	NC_000921	GGCTAG	2	12	50215	50226	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15611115
1010	NC_000921	AGG	2	6	50230	50235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611115
1011	NC_000921	TTGC	2	8	50251	50258	0 %	50 %	25 %	25 %	15611115
1012	NC_000921	ATC	2	6	50290	50295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611115
1013	NC_000921	A	6	6	50398	50403	100 %	0 %	0 %	0 %	15611115
1014	NC_000921	GATTG	2	10	50517	50526	20 %	40 %	40 %	0 %	15611115
1015	NC_000921	TGCT	2	8	50537	50544	0 %	50 %	25 %	25 %	15611115
1016	NC_000921	GCTTT	2	10	50573	50582	0 %	60 %	20 %	20 %	15611115
1017	NC_000921	AC	3	6	50620	50625	50 %	0 %	0 %	50 %	15611115
1018	NC_000921	CAA	2	6	50662	50667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611115
1019	NC_000921	CAA	2	6	50716	50721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611115
1020	NC_000921	T	8	8	50732	50739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_000921	CTA	2	6	50792	50797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_000921	TCA	2	6	50833	50838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_000921	CAT	2	6	50879	50884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_000921	CAT	2	6	51004	51009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_000921	T	6	6	51061	51066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_000921	A	6	6	51077	51082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_000921	A	6	6	51154	51159	100 %	0 %	0 %	0 %	15611116
1028	NC_000921	AAAC	2	8	51184	51191	75 %	0 %	0 %	25 %	15611116
1029	NC_000921	GTT	2	6	51297	51302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611116
1030	NC_000921	AGA	2	6	51344	51349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611116
1031	NC_000921	TAA	2	6	51368	51373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611116
1032	NC_000921	T	7	7	51381	51387	0 %	100 %	0 %	0 %	15611116
1033	NC_000921	T	8	8	51469	51476	0 %	100 %	0 %	0 %	15611116
1034	NC_000921	TTA	2	6	51483	51488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611116
1035	NC_000921	TCAA	2	8	51501	51508	50 %	25 %	0 %	25 %	15611116
1036	NC_000921	CTT	2	6	51511	51516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611116
1037	NC_000921	GCC	2	6	51556	51561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611116
1038	NC_000921	T	6	6	51732	51737	0 %	100 %	0 %	0 %	15611116
1039	NC_000921	TAAAA	2	10	51747	51756	80 %	20 %	0 %	0 %	15611116
1040	NC_000921	ATTTC	2	10	51822	51831	20 %	60 %	0 %	20 %	15611116
1041	NC_000921	ATAG	2	8	51905	51912	50 %	25 %	25 %	0 %	15611116
1042	NC_000921	GTT	2	6	51952	51957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611116
1043	NC_000921	ACT	2	6	51984	51989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611116
1044	NC_000921	TTGT	2	8	52065	52072	0 %	75 %	25 %	0 %	15611116
1045	NC_000921	AT	4	8	52089	52096	50 %	50 %	0 %	0 %	15611116
1046	NC_000921	A	7	7	52134	52140	100 %	0 %	0 %	0 %	15611116
1047	NC_000921	ATA	2	6	52233	52238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611117
1048	NC_000921	AGT	2	6	52253	52258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611117
1049	NC_000921	TAT	2	6	52279	52284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611117
1050	NC_000921	AT	3	6	52293	52298	50 %	50 %	0 %	0 %	15611117
1051	NC_000921	CGT	2	6	52363	52368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611117
1052	NC_000921	TCC	2	6	52388	52393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611117
1053	NC_000921	AAT	2	6	52421	52426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611117
1054	NC_000921	T	6	6	52430	52435	0 %	100 %	0 %	0 %	15611117
1055	NC_000921	ATG	2	6	52466	52471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611117
1056	NC_000921	GCTT	2	8	52517	52524	0 %	50 %	25 %	25 %	15611117
1057	NC_000921	TAT	2	6	52591	52596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611117
1058	NC_000921	GTTT	2	8	52631	52638	0 %	75 %	25 %	0 %	15611117
1059	NC_000921	TTA	2	6	52668	52673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611117
1060	NC_000921	TTA	2	6	52807	52812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611117
1061	NC_000921	AATC	2	8	52867	52874	50 %	25 %	0 %	25 %	15611117
1062	NC_000921	TC	4	8	52873	52880	0 %	50 %	0 %	50 %	15611117
1063	NC_000921	AAT	2	6	52966	52971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611117
1064	NC_000921	AAG	2	6	53058	53063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_000921	TTGA	2	8	53069	53076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_000921	GTT	2	6	53084	53089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_000921	GAC	2	6	53115	53120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_000921	CAA	2	6	53143	53148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_000921	AAT	2	6	53198	53203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_000921	T	6	6	53213	53218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_000921	AAAC	2	8	53475	53482	75 %	0 %	0 %	25 %	15611118
1072	NC_000921	CAA	2	6	53489	53494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611118
1073	NC_000921	CGCT	2	8	53501	53508	0 %	25 %	25 %	50 %	15611118
1074	NC_000921	AG	3	6	53589	53594	50 %	0 %	50 %	0 %	15611118
1075	NC_000921	A	6	6	53633	53638	100 %	0 %	0 %	0 %	15611118
1076	NC_000921	AGCC	2	8	53675	53682	25 %	0 %	25 %	50 %	15611118
1077	NC_000921	TGAAA	2	10	53727	53736	60 %	20 %	20 %	0 %	15611118
1078	NC_000921	A	6	6	53734	53739	100 %	0 %	0 %	0 %	15611118
1079	NC_000921	TCA	2	6	53780	53785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611118
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1081	NC_000921	TCG	2	6	53816	53821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611118
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1083	NC_000921	TCA	2	6	53879	53884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611118
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1085	NC_000921	TCT	2	6	53971	53976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611118
1086	NC_000921	CAAG	2	8	54154	54161	50 %	0 %	25 %	25 %	15611118
1087	NC_000921	ATA	2	6	54169	54174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611118
1088	NC_000921	AAGA	2	8	54196	54203	75 %	0 %	25 %	0 %	15611118
1089	NC_000921	TC	3	6	54221	54226	0 %	50 %	0 %	50 %	15611118
1090	NC_000921	CAC	2	6	54282	54287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611118
1091	NC_000921	TCA	3	9	54299	54307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611118
1092	NC_000921	CCT	2	6	54349	54354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611118
1093	NC_000921	AAT	2	6	54372	54377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611118
1094	NC_000921	CACT	2	8	54443	54450	25 %	25 %	0 %	50 %	15611118
1095	NC_000921	GAA	2	6	54457	54462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611118
1096	NC_000921	A	6	6	54467	54472	100 %	0 %	0 %	0 %	15611118
1097	NC_000921	A	6	6	54474	54479	100 %	0 %	0 %	0 %	15611118
1098	NC_000921	ATC	2	6	54522	54527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611118
1099	NC_000921	AAT	2	6	54545	54550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611118
1100	NC_000921	TG	3	6	54653	54658	0 %	50 %	50 %	0 %	15611118
1101	NC_000921	C	7	7	54669	54675	0 %	0 %	0 %	100 %	15611118
1102	NC_000921	TCGC	2	8	54721	54728	0 %	25 %	25 %	50 %	15611118
1103	NC_000921	AAT	2	6	54779	54784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611118
1104	NC_000921	TAAAAA	2	12	54808	54819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15611118
1105	NC_000921	ACA	2	6	54880	54885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611118
1106	NC_000921	ATTT	2	8	54918	54925	25 %	75 %	0 %	0 %	15611119
1107	NC_000921	CAGCA	2	10	54928	54937	40 %	0 %	20 %	40 %	15611119
1108	NC_000921	GAT	2	6	54991	54996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611119
1109	NC_000921	TGCT	2	8	55090	55097	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
1110	NC_000921	A	8	8	55227	55234	100 %	0 %	0 %	0 %	15611119
1111	NC_000921	TCGT	2	8	55253	55260	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
1112	NC_000921	A	6	6	55381	55386	100 %	0 %	0 %	0 %	15611119
1113	NC_000921	CG	3	6	55475	55480	0 %	0 %	50 %	50 %	15611119
1114	NC_000921	GT	3	6	55494	55499	0 %	50 %	50 %	0 %	15611119
1115	NC_000921	TCA	2	6	55500	55505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611119
1116	NC_000921	T	6	6	55548	55553	0 %	100 %	0 %	0 %	15611119
1117	NC_000921	TCT	4	12	55566	55577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611119
1118	NC_000921	TCC	2	6	55624	55629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611119
1119	NC_000921	T	6	6	55646	55651	0 %	100 %	0 %	0 %	15611119
1120	NC_000921	C	7	7	55654	55660	0 %	0 %	0 %	100 %	15611119
1121	NC_000921	TGG	2	6	55690	55695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611119
1122	NC_000921	TTG	2	6	55698	55703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611119
1123	NC_000921	ATA	2	6	55736	55741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611119
1124	NC_000921	TCA	2	6	55837	55842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611119
1125	NC_000921	T	6	6	55889	55894	0 %	100 %	0 %	0 %	15611119
1126	NC_000921	TCA	2	6	55918	55923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611119
1127	NC_000921	ATC	2	6	55934	55939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611119
1128	NC_000921	TGA	2	6	55996	56001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611119
1129	NC_000921	CTT	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611119
1130	NC_000921	TCTG	2	8	56213	56220	0 %	50 %	25 %	25 %	15611119
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