MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_000921	AGA	2	6	652253	652258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611655
13503	NC_000921	GAAA	2	8	652280	652287	75 %	0 %	25 %	0 %	15611655
13504	NC_000921	A	6	6	652285	652290	100 %	0 %	0 %	0 %	15611655
13505	NC_000921	GTT	2	6	652295	652300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611655
13506	NC_000921	GTT	2	6	652354	652359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611655
13507	NC_000921	A	6	6	652422	652427	100 %	0 %	0 %	0 %	15611655
13508	NC_000921	T	6	6	652463	652468	0 %	100 %	0 %	0 %	15611655
13509	NC_000921	CAT	2	6	652545	652550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611655
13510	NC_000921	AAG	2	6	652552	652557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611655
13511	NC_000921	T	6	6	652578	652583	0 %	100 %	0 %	0 %	15611656
13512	NC_000921	TTA	2	6	652590	652595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611656
13513	NC_000921	GCTC	2	8	652617	652624	0 %	25 %	25 %	50 %	15611656
13514	NC_000921	GTG	2	6	652643	652648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611656
13515	NC_000921	CTCG	2	8	652709	652716	0 %	25 %	25 %	50 %	15611656
13516	NC_000921	TG	3	6	652719	652724	0 %	50 %	50 %	0 %	15611656
13517	NC_000921	T	6	6	652738	652743	0 %	100 %	0 %	0 %	15611656
13518	NC_000921	GTG	2	6	652793	652798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611656
13519	NC_000921	T	7	7	652881	652887	0 %	100 %	0 %	0 %	15611657
13520	NC_000921	ATTTT	2	10	652888	652897	20 %	80 %	0 %	0 %	15611657
13521	NC_000921	T	6	6	652894	652899	0 %	100 %	0 %	0 %	15611657
13522	NC_000921	A	7	7	652955	652961	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13523	NC_000921	CCG	2	6	652964	652969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611657
13524	NC_000921	ATT	3	9	652982	652990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611657
13525	NC_000921	A	7	7	653011	653017	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13526	NC_000921	A	6	6	653035	653040	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13527	NC_000921	GCAA	2	8	653153	653160	50 %	0 %	25 %	25 %	15611657
13528	NC_000921	ACA	2	6	653185	653190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611657
13529	NC_000921	TATCGC	2	12	653211	653222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15611657
13530	NC_000921	A	6	6	653285	653290	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13531	NC_000921	GAA	2	6	653317	653322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611657
13532	NC_000921	CTT	2	6	653354	653359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611657
13533	NC_000921	GC	3	6	653387	653392	0 %	0 %	50 %	50 %	15611657
13534	NC_000921	A	7	7	653414	653420	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13535	NC_000921	T	6	6	653590	653595	0 %	100 %	0 %	0 %	15611657
13536	NC_000921	A	7	7	653623	653629	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13537	NC_000921	GAT	2	6	653680	653685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611657
13538	NC_000921	T	6	6	653705	653710	0 %	100 %	0 %	0 %	15611657
13539	NC_000921	A	7	7	653734	653740	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13540	NC_000921	AGCCC	2	10	653761	653770	20 %	0 %	20 %	60 %	15611657
13541	NC_000921	CAT	2	6	653826	653831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611657
13542	NC_000921	CCT	2	6	653863	653868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15611657
13543	NC_000921	A	6	6	653909	653914	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13544	NC_000921	TAT	2	6	653965	653970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611657
13545	NC_000921	A	6	6	653972	653977	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13546	NC_000921	TAT	3	9	654028	654036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611657
13547	NC_000921	ATT	2	6	654055	654060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611657
13548	NC_000921	TC	3	6	654137	654142	0 %	50 %	0 %	50 %	15611657
13549	NC_000921	ATT	2	6	654269	654274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611657
13550	NC_000921	A	6	6	654289	654294	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13551	NC_000921	ACC	2	6	654302	654307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611657
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13553	NC_000921	A	6	6	654387	654392	100 %	0 %	0 %	0 %	15611657
13554	NC_000921	A	6	6	654561	654566	100 %	0 %	0 %	0 %	15611658
13555	NC_000921	TGC	2	6	654634	654639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611658
13556	NC_000921	GAA	2	6	654675	654680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611658
13557	NC_000921	CAGG	2	8	654718	654725	25 %	0 %	50 %	25 %	15611658
13558	NC_000921	AGA	2	6	654740	654745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611658
13559	NC_000921	CAA	2	6	654791	654796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611658
13560	NC_000921	GAA	2	6	655032	655037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611658
13561	NC_000921	GTG	2	6	655038	655043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611658
13562	NC_000921	AGA	2	6	655046	655051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611658
13563	NC_000921	AGA	2	6	655088	655093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611658
13564	NC_000921	CCAAG	2	10	655128	655137	40 %	0 %	20 %	40 %	15611658
13565	NC_000921	ACTC	2	8	655256	655263	25 %	25 %	0 %	50 %	15611658
13566	NC_000921	CAT	2	6	655280	655285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611658
13567	NC_000921	TAT	2	6	655356	655361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611658
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13569	NC_000921	TTA	2	6	655402	655407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611659
13570	NC_000921	TGG	2	6	655455	655460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611659
13571	NC_000921	GCTT	2	8	655462	655469	0 %	50 %	25 %	25 %	15611659
13572	NC_000921	C	7	7	655483	655489	0 %	0 %	0 %	100 %	15611659
13573	NC_000921	TAA	2	6	655507	655512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611659
13574	NC_000921	CT	3	6	655517	655522	0 %	50 %	0 %	50 %	15611659
13575	NC_000921	T	6	6	655673	655678	0 %	100 %	0 %	0 %	15611659
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13578	NC_000921	A	6	6	655778	655783	100 %	0 %	0 %	0 %	15611659
13579	NC_000921	T	6	6	655803	655808	0 %	100 %	0 %	0 %	15611660
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13582	NC_000921	GTG	2	6	655936	655941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611660
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13586	NC_000921	GC	3	6	656107	656112	0 %	0 %	50 %	50 %	15611660
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13592	NC_000921	CAG	2	6	656430	656435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611660
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13595	NC_000921	CAGC	2	8	656547	656554	25 %	0 %	25 %	50 %	15611660
13596	NC_000921	ATCA	2	8	656560	656567	50 %	25 %	0 %	25 %	15611660
13597	NC_000921	ATC	2	6	656569	656574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611660
13598	NC_000921	A	6	6	656665	656670	100 %	0 %	0 %	0 %	15611660
13599	NC_000921	CAC	2	6	656688	656693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611660
13600	NC_000921	GAA	2	6	656776	656781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611660
13601	NC_000921	CATG	2	8	656802	656809	25 %	25 %	25 %	25 %	15611660
13602	NC_000921	CTT	2	6	656921	656926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611660
13603	NC_000921	GA	3	6	657004	657009	50 %	0 %	50 %	0 %	15611660
13604	NC_000921	GGA	2	6	657012	657017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15611660
13605	NC_000921	AAT	2	6	657062	657067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611660
13606	NC_000921	T	6	6	657096	657101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_000921	ATT	2	6	657103	657108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_000921	TTA	2	6	657174	657179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611661
13609	NC_000921	T	6	6	657210	657215	0 %	100 %	0 %	0 %	15611661
13610	NC_000921	A	6	6	657274	657279	100 %	0 %	0 %	0 %	15611661
13611	NC_000921	TTGA	2	8	657310	657317	25 %	50 %	25 %	0 %	15611661
13612	NC_000921	TGCG	2	8	657345	657352	0 %	25 %	50 %	25 %	15611661
13613	NC_000921	GTTG	2	8	657357	657364	0 %	50 %	50 %	0 %	15611661
13614	NC_000921	G	7	7	657406	657412	0 %	0 %	100 %	0 %	15611661
13615	NC_000921	GAACAT	2	12	657426	657437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15611661
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13617	NC_000921	AG	3	6	657784	657789	50 %	0 %	50 %	0 %	15611661
13618	NC_000921	GGC	2	6	657799	657804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611661
13619	NC_000921	GAAAA	2	10	657856	657865	80 %	0 %	20 %	0 %	15611661
13620	NC_000921	AAG	2	6	657869	657874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611661
13621	NC_000921	GCC	2	6	657881	657886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611661
13622	NC_000921	AAC	2	6	657901	657906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611661
13623	NC_000921	GCT	2	6	658005	658010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611661
13624	NC_000921	TGAA	2	8	658034	658041	50 %	25 %	25 %	0 %	15611661
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