MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000921	GTT	2	6	25437	25442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611092
502	NC_000921	A	6	6	25533	25538	100 %	0 %	0 %	0 %	15611092
503	NC_000921	T	6	6	25599	25604	0 %	100 %	0 %	0 %	15611092
504	NC_000921	CTTTA	2	10	25619	25628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
505	NC_000921	GT	3	6	25667	25672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_000921	TAAG	2	8	25676	25683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_000921	A	14	14	25759	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_000921	GTT	2	6	25833	25838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_000921	A	6	6	25856	25861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_000921	T	7	7	25867	25873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_000921	GTTTG	2	10	25884	25893	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
512	NC_000921	TTTG	2	8	25905	25912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_000921	TAA	2	6	25913	25918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_000921	GTT	2	6	25940	25945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000921	A	6	6	25964	25969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_000921	T	6	6	25974	25979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_000921	GTTTG	2	10	25990	25999	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
518	NC_000921	T	6	6	26012	26017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_000921	TGT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_000921	TGT	2	6	26039	26044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_000921	T	7	7	26106	26112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_000921	A	7	7	26113	26119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_000921	ATT	2	6	26157	26162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_000921	A	6	6	26163	26168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_000921	ATC	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_000921	TTA	2	6	26289	26294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_000921	AGCCT	2	10	26301	26310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
528	NC_000921	A	6	6	26430	26435	100 %	0 %	0 %	0 %	15611093
529	NC_000921	TTC	2	6	26534	26539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611093
530	NC_000921	GC	3	6	26625	26630	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
531	NC_000921	CG	4	8	26698	26705	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
532	NC_000921	TCT	2	6	26739	26744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611093
533	NC_000921	GGC	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611093
534	NC_000921	AGA	2	6	26864	26869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611093
535	NC_000921	GTG	2	6	26955	26960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611093
536	NC_000921	GC	3	6	27020	27025	0 %	0 %	50 %	50 %	15611093
537	NC_000921	ATAA	2	8	27035	27042	75 %	25 %	0 %	0 %	15611093
538	NC_000921	TCT	2	6	27126	27131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611093
539	NC_000921	AG	3	6	27188	27193	50 %	0 %	50 %	0 %	15611093
540	NC_000921	CA	3	6	27339	27344	50 %	0 %	0 %	50 %	15611093
541	NC_000921	T	6	6	27407	27412	0 %	100 %	0 %	0 %	15611093
542	NC_000921	AGA	2	6	27452	27457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611093
543	NC_000921	A	7	7	27475	27481	100 %	0 %	0 %	0 %	15611093
544	NC_000921	ATT	2	6	27563	27568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611093
545	NC_000921	ATT	2	6	27572	27577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611093
546	NC_000921	A	6	6	27643	27648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_000921	T	7	7	27677	27683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_000921	A	7	7	27721	27727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_000921	TA	3	6	27741	27746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_000921	GAA	2	6	27838	27843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
551	NC_000921	GAT	2	6	27936	27941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611094
552	NC_000921	A	7	7	27985	27991	100 %	0 %	0 %	0 %	15611094
553	NC_000921	A	6	6	28184	28189	100 %	0 %	0 %	0 %	15611094
554	NC_000921	TG	3	6	28200	28205	0 %	50 %	50 %	0 %	15611094
555	NC_000921	GGT	2	6	28220	28225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611094
556	NC_000921	AAG	2	6	28319	28324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
557	NC_000921	A	6	6	28339	28344	100 %	0 %	0 %	0 %	15611094
558	NC_000921	T	6	6	28353	28358	0 %	100 %	0 %	0 %	15611094
559	NC_000921	A	6	6	28379	28384	100 %	0 %	0 %	0 %	15611094
560	NC_000921	AGC	2	6	28399	28404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611094
561	NC_000921	AAG	2	6	28430	28435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
562	NC_000921	AG	3	6	28440	28445	50 %	0 %	50 %	0 %	15611094
563	NC_000921	CAAGC	2	10	28485	28494	40 %	0 %	20 %	40 %	15611094
564	NC_000921	CAT	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611094
565	NC_000921	GCTC	2	8	28563	28570	0 %	25 %	25 %	50 %	15611094
566	NC_000921	ATC	2	6	28645	28650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611094
567	NC_000921	CAA	2	6	28681	28686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611094
568	NC_000921	GCG	2	6	28762	28767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611094
569	NC_000921	TGG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611094
570	NC_000921	G	6	6	28773	28778	0 %	0 %	100 %	0 %	15611094
571	NC_000921	TAT	2	6	28887	28892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611094
572	NC_000921	ATG	2	6	28906	28911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611094
573	NC_000921	ATGG	2	8	29011	29018	25 %	25 %	50 %	0 %	15611094
574	NC_000921	AAG	2	6	29024	29029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611094
575	NC_000921	TGA	2	6	29054	29059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611094
576	NC_000921	GAAT	2	8	29265	29272	50 %	25 %	25 %	0 %	15611095
577	NC_000921	AAT	2	6	29291	29296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611095
578	NC_000921	A	6	6	29358	29363	100 %	0 %	0 %	0 %	15611095
579	NC_000921	TTTTA	2	10	29408	29417	20 %	80 %	0 %	0 %	15611095
580	NC_000921	TGGC	2	8	29488	29495	0 %	25 %	50 %	25 %	15611095
581	NC_000921	T	7	7	29529	29535	0 %	100 %	0 %	0 %	15611095
582	NC_000921	AG	3	6	29548	29553	50 %	0 %	50 %	0 %	15611095
583	NC_000921	CTA	2	6	29600	29605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611095
584	NC_000921	T	6	6	29612	29617	0 %	100 %	0 %	0 %	15611095
585	NC_000921	TTTA	2	8	29641	29648	25 %	75 %	0 %	0 %	15611095
586	NC_000921	TTG	2	6	29678	29683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611096
587	NC_000921	TTA	2	6	29712	29717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611096
588	NC_000921	GTT	2	6	29759	29764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611096
589	NC_000921	CAA	2	6	29825	29830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611096
590	NC_000921	TCT	2	6	29913	29918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611096
591	NC_000921	TCT	3	9	30033	30041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611096
592	NC_000921	TAA	2	6	30197	30202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611096
593	NC_000921	TATCAA	2	12	30460	30471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15611097
594	NC_000921	AGT	2	6	30531	30536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611097
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596	NC_000921	AGCA	2	8	30659	30666	50 %	0 %	25 %	25 %	15611097
597	NC_000921	CTT	2	6	30691	30696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611097
598	NC_000921	GCTT	2	8	30749	30756	0 %	50 %	25 %	25 %	15611097
599	NC_000921	ACTTTT	2	12	30761	30772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15611097
600	NC_000921	TCA	2	6	30828	30833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611097
601	NC_000921	TAA	2	6	30874	30879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
602	NC_000921	TCA	2	6	30915	30920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611097
603	NC_000921	TCA	2	6	30966	30971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611097
604	NC_000921	TTGA	2	8	31172	31179	25 %	50 %	25 %	0 %	15611097
605	NC_000921	TAA	2	6	31196	31201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
606	NC_000921	CTT	2	6	31258	31263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611097
607	NC_000921	TAA	2	6	31271	31276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
608	NC_000921	T	6	6	31403	31408	0 %	100 %	0 %	0 %	15611097
609	NC_000921	TTA	2	6	31470	31475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611097
610	NC_000921	CT	3	6	31526	31531	0 %	50 %	0 %	50 %	15611097
611	NC_000921	AAG	2	6	31552	31557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611097
612	NC_000921	GTC	2	6	31574	31579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15611097
613	NC_000921	T	6	6	31586	31591	0 %	100 %	0 %	0 %	15611097
614	NC_000921	AAT	2	6	31644	31649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
615	NC_000921	TAA	2	6	31675	31680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611097
616	NC_000921	TTG	2	6	31796	31801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611097
617	NC_000921	TCACTC	2	12	31867	31878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15611097
618	NC_000921	TCA	3	9	31959	31967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611097
619	NC_000921	A	6	6	31977	31982	100 %	0 %	0 %	0 %	15611097
620	NC_000921	GGTT	2	8	32100	32107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_000921	TTTA	2	8	32234	32241	25 %	75 %	0 %	0 %	15611098
622	NC_000921	GAT	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611098
623	NC_000921	AGA	3	9	32284	32292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611098
624	NC_000921	AAGGCT	2	12	32294	32305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15611098
625	NC_000921	A	6	6	32333	32338	100 %	0 %	0 %	0 %	15611098
626	NC_000921	TGATT	2	10	32374	32383	20 %	60 %	20 %	0 %	15611098
627	NC_000921	GCGA	2	8	32432	32439	25 %	0 %	50 %	25 %	15611098
628	NC_000921	TTG	2	6	32484	32489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611098
629	NC_000921	TGT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611098
630	NC_000921	ACCC	2	8	32543	32550	25 %	0 %	0 %	75 %	15611099
631	NC_000921	CCA	2	6	32551	32556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611099
632	NC_000921	T	7	7	32624	32630	0 %	100 %	0 %	0 %	15611099
633	NC_000921	AGA	2	6	32642	32647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611099
634	NC_000921	CATC	2	8	32669	32676	25 %	25 %	0 %	50 %	15611099
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636	NC_000921	AAT	2	6	32794	32799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611099
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