MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori J99 chromosome

Total Repeats: 33869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_000921	TGAA	2	8	293957	293964	50 %	25 %	25 %	0 %	15611341
6002	NC_000921	CTT	2	6	293980	293985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611341
6003	NC_000921	CTA	2	6	294079	294084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611341
6004	NC_000921	TTG	2	6	294124	294129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611341
6005	NC_000921	T	7	7	294146	294152	0 %	100 %	0 %	0 %	15611342
6006	NC_000921	TTTG	2	8	294182	294189	0 %	75 %	25 %	0 %	15611342
6007	NC_000921	ATG	2	6	294214	294219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611342
6008	NC_000921	CAA	2	6	294279	294284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611342
6009	NC_000921	TTG	2	6	294303	294308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611342
6010	NC_000921	A	6	6	294444	294449	100 %	0 %	0 %	0 %	15611342
6011	NC_000921	AGA	2	6	294461	294466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15611342
6012	NC_000921	T	6	6	294594	294599	0 %	100 %	0 %	0 %	15611342
6013	NC_000921	TTG	2	6	294642	294647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611342
6014	NC_000921	A	6	6	294658	294663	100 %	0 %	0 %	0 %	15611342
6015	NC_000921	A	6	6	294675	294680	100 %	0 %	0 %	0 %	15611343
6016	NC_000921	CTT	2	6	294702	294707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611343
6017	NC_000921	GGC	2	6	294720	294725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611343
6018	NC_000921	TGAAT	2	10	294788	294797	40 %	40 %	20 %	0 %	15611343
6019	NC_000921	CTA	2	6	294908	294913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611343
6020	NC_000921	TGGCG	2	10	294941	294950	0 %	20 %	60 %	20 %	15611343
6021	NC_000921	T	6	6	294976	294981	0 %	100 %	0 %	0 %	15611343
6022	NC_000921	GGTG	2	8	295013	295020	0 %	25 %	75 %	0 %	15611343
6023	NC_000921	TTGT	2	8	295086	295093	0 %	75 %	25 %	0 %	15611343
6024	NC_000921	GT	3	6	295098	295103	0 %	50 %	50 %	0 %	15611343
6025	NC_000921	T	7	7	295110	295116	0 %	100 %	0 %	0 %	15611343
6026	NC_000921	GTTT	2	8	295120	295127	0 %	75 %	25 %	0 %	15611343
6027	NC_000921	GA	3	6	295166	295171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_000921	A	6	6	295236	295241	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6029	NC_000921	ATCAAA	2	12	295256	295267	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15611344
6030	NC_000921	A	6	6	295265	295270	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6031	NC_000921	G	6	6	295367	295372	0 %	0 %	100 %	0 %	15611344
6032	NC_000921	A	6	6	295373	295378	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6033	NC_000921	A	6	6	295439	295444	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6034	NC_000921	CAA	2	6	295447	295452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6035	NC_000921	TCA	2	6	295469	295474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6036	NC_000921	ACT	2	6	295505	295510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6037	NC_000921	AAC	2	6	295522	295527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6038	NC_000921	A	6	6	295548	295553	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6039	NC_000921	T	6	6	295569	295574	0 %	100 %	0 %	0 %	15611344
6040	NC_000921	G	6	6	295612	295617	0 %	0 %	100 %	0 %	15611344
6041	NC_000921	AGT	2	6	295666	295671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611344
6042	NC_000921	CTT	2	6	295685	295690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6043	NC_000921	GCAC	2	8	295787	295794	25 %	0 %	25 %	50 %	15611344
6044	NC_000921	TAA	2	6	295824	295829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6045	NC_000921	TTA	2	6	295898	295903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611344
6046	NC_000921	GAC	2	6	296007	296012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611344
6047	NC_000921	CTA	2	6	296018	296023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6048	NC_000921	G	7	7	296098	296104	0 %	0 %	100 %	0 %	15611344
6049	NC_000921	AAT	2	6	296137	296142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6050	NC_000921	TAA	2	6	296226	296231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6051	NC_000921	G	6	6	296263	296268	0 %	0 %	100 %	0 %	15611344
6052	NC_000921	ACTTTT	2	12	296269	296280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15611344
6053	NC_000921	GACCA	2	10	296284	296293	40 %	0 %	20 %	40 %	15611344
6054	NC_000921	ACC	2	6	296396	296401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15611344
6055	NC_000921	TAA	2	6	296427	296432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6056	NC_000921	CAA	2	6	296442	296447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6057	NC_000921	TAA	2	6	296484	296489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6058	NC_000921	ACAA	2	8	296515	296522	75 %	0 %	0 %	25 %	15611344
6059	NC_000921	GTG	2	6	296534	296539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611344
6060	NC_000921	TCACTC	2	12	296606	296617	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15611344
6061	NC_000921	GAC	2	6	296622	296627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611344
6062	NC_000921	ATC	2	6	296699	296704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6063	NC_000921	ACGA	2	8	296746	296753	50 %	0 %	25 %	25 %	15611344
6064	NC_000921	TGAA	2	8	296831	296838	50 %	25 %	25 %	0 %	15611344
6065	NC_000921	ATT	3	9	296971	296979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611344
6066	NC_000921	AG	3	6	296988	296993	50 %	0 %	50 %	0 %	15611344
6067	NC_000921	ATATT	2	10	297090	297099	40 %	60 %	0 %	0 %	15611344
6068	NC_000921	AG	3	6	297120	297125	50 %	0 %	50 %	0 %	15611344
6069	NC_000921	TTA	2	6	297132	297137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611344
6070	NC_000921	AAAC	2	8	297181	297188	75 %	0 %	0 %	25 %	15611344
6071	NC_000921	TCT	2	6	297253	297258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6072	NC_000921	AATCT	2	10	297430	297439	40 %	40 %	0 %	20 %	15611344
6073	NC_000921	GGAG	2	8	297676	297683	25 %	0 %	75 %	0 %	15611344
6074	NC_000921	GCG	2	6	297695	297700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15611344
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6076	NC_000921	A	6	6	297759	297764	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6077	NC_000921	TAA	2	6	297774	297779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
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6079	NC_000921	CTT	2	6	297800	297805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6080	NC_000921	AAT	2	6	297814	297819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6081	NC_000921	CTA	2	6	297905	297910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6082	NC_000921	TAA	2	6	297936	297941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6083	NC_000921	A	6	6	298050	298055	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6084	NC_000921	ACG	2	6	298187	298192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611344
6085	NC_000921	TCA	2	6	298217	298222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
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6088	NC_000921	T	6	6	298331	298336	0 %	100 %	0 %	0 %	15611344
6089	NC_000921	TAT	2	6	298417	298422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15611344
6090	NC_000921	AAT	2	6	298468	298473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6091	NC_000921	ACA	2	6	298487	298492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6092	NC_000921	ACA	2	6	298508	298513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6093	NC_000921	AT	3	6	298613	298618	50 %	50 %	0 %	0 %	15611344
6094	NC_000921	ATG	2	6	298691	298696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611344
6095	NC_000921	AACG	2	8	298854	298861	50 %	0 %	25 %	25 %	15611344
6096	NC_000921	CGC	2	6	298878	298883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15611344
6097	NC_000921	GTT	2	6	299151	299156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15611344
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6099	NC_000921	ATTTGA	2	12	299276	299287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15611344
6100	NC_000921	GCTC	2	8	299297	299304	0 %	25 %	25 %	50 %	15611344
6101	NC_000921	AAC	2	6	299335	299340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6102	NC_000921	TAC	2	6	299430	299435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6103	NC_000921	AGT	2	6	299443	299448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611344
6104	NC_000921	TTTAA	2	10	299491	299500	40 %	60 %	0 %	0 %	15611344
6105	NC_000921	AAT	2	6	299503	299508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6106	NC_000921	TCT	2	6	299509	299514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6107	NC_000921	AAC	2	6	299659	299664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6108	NC_000921	A	6	6	299682	299687	100 %	0 %	0 %	0 %	15611344
6109	NC_000921	CAGC	2	8	299688	299695	25 %	0 %	25 %	50 %	15611344
6110	NC_000921	TAA	2	6	299760	299765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15611344
6111	NC_000921	GT	3	6	299771	299776	0 %	50 %	50 %	0 %	15611344
6112	NC_000921	CAT	2	6	299781	299786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6113	NC_000921	CTT	2	6	299826	299831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6114	NC_000921	ATG	2	6	299846	299851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15611344
6115	NC_000921	CT	3	6	299953	299958	0 %	50 %	0 %	50 %	15611344
6116	NC_000921	AAC	2	6	300028	300033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15611344
6117	NC_000921	AGC	2	6	300088	300093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611344
6118	NC_000921	CCAA	2	8	300113	300120	50 %	0 %	0 %	50 %	15611344
6119	NC_000921	GCA	2	6	300137	300142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15611344
6120	NC_000921	TCT	2	6	300178	300183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15611344
6121	NC_000921	TCA	2	6	300389	300394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15611344
6122	NC_000921	TTGA	2	8	300424	300431	25 %	50 %	25 %	0 %	15611344
6123	NC_000921	GGT	2	6	300522	300527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15611344
6124	NC_000921	TG	3	6	300573	300578	0 %	50 %	50 %	0 %	15611344
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