MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000907	TACT	2	8	145361	145368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_000907	CTT	2	6	145409	145414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272098
3003	NC_000907	GTT	2	6	145442	145447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272098
3004	NC_000907	GTTA	2	8	145533	145540	25 %	50 %	25 %	0 %	16272098
3005	NC_000907	CTT	2	6	145583	145588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272098
3006	NC_000907	CGA	2	6	145604	145609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272098
3007	NC_000907	ACCC	2	8	145746	145753	25 %	0 %	0 %	75 %	16272098
3008	NC_000907	CTT	2	6	145982	145987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272098
3009	NC_000907	TCA	2	6	146104	146109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272098
3010	NC_000907	GCTTGA	2	12	146152	146163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16272098
3011	NC_000907	CCG	2	6	146176	146181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16272098
3012	NC_000907	T	7	7	146206	146212	0 %	100 %	0 %	0 %	16272098
3013	NC_000907	CAT	2	6	146270	146275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272098
3014	NC_000907	GTG	2	6	146296	146301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272098
3015	NC_000907	AGCCA	2	10	146373	146382	40 %	0 %	20 %	40 %	16272098
3016	NC_000907	TTG	2	6	146419	146424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272098
3017	NC_000907	ATA	2	6	146431	146436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272098
3018	NC_000907	ATA	2	6	146485	146490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_000907	TGA	2	6	146494	146499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000907	A	6	6	146526	146531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_000907	ATC	3	9	146616	146624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272099
3022	NC_000907	TGCATC	2	12	146636	146647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16272099
3023	NC_000907	ATC	2	6	146791	146796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272099
3024	NC_000907	A	6	6	146834	146839	100 %	0 %	0 %	0 %	16272099
3025	NC_000907	A	6	6	146843	146848	100 %	0 %	0 %	0 %	16272099
3026	NC_000907	GCAGT	2	10	146851	146860	20 %	20 %	40 %	20 %	16272099
3027	NC_000907	AAC	2	6	146906	146911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272099
3028	NC_000907	TTAC	2	8	146955	146962	25 %	50 %	0 %	25 %	16272099
3029	NC_000907	AC	3	6	147007	147012	50 %	0 %	0 %	50 %	16272099
3030	NC_000907	CCG	2	6	147032	147037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16272099
3031	NC_000907	GAA	2	6	147054	147059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272099
3032	NC_000907	CT	3	6	147068	147073	0 %	50 %	0 %	50 %	16272099
3033	NC_000907	TGAT	2	8	147082	147089	25 %	50 %	25 %	0 %	16272099
3034	NC_000907	GTG	2	6	147169	147174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272099
3035	NC_000907	TGA	2	6	147283	147288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272100
3036	NC_000907	ATT	2	6	147293	147298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272100
3037	NC_000907	AAT	2	6	147317	147322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272100
3038	NC_000907	AGA	2	6	147421	147426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272100
3039	NC_000907	ATT	3	9	147464	147472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272100
3040	NC_000907	GCCA	2	8	147544	147551	25 %	0 %	25 %	50 %	16272100
3041	NC_000907	GGTT	2	8	147560	147567	0 %	50 %	50 %	0 %	16272100
3042	NC_000907	TTC	2	6	147577	147582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272100
3043	NC_000907	GGAA	2	8	147640	147647	50 %	0 %	50 %	0 %	16272100
3044	NC_000907	A	6	6	147744	147749	100 %	0 %	0 %	0 %	16272100
3045	NC_000907	CAA	2	6	147789	147794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272100
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3047	NC_000907	TCG	2	6	147865	147870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272101
3048	NC_000907	TCTTT	2	10	147880	147889	0 %	80 %	0 %	20 %	16272101
3049	NC_000907	T	6	6	147887	147892	0 %	100 %	0 %	0 %	16272101
3050	NC_000907	AT	3	6	147893	147898	50 %	50 %	0 %	0 %	16272101
3051	NC_000907	AAC	2	6	147931	147936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272101
3052	NC_000907	CAA	2	6	147942	147947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272101
3053	NC_000907	TCAA	2	8	147963	147970	50 %	25 %	0 %	25 %	16272101
3054	NC_000907	ATT	2	6	147977	147982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272101
3055	NC_000907	A	6	6	148033	148038	100 %	0 %	0 %	0 %	16272101
3056	NC_000907	T	6	6	148055	148060	0 %	100 %	0 %	0 %	16272101
3057	NC_000907	GCA	2	6	148080	148085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272101
3058	NC_000907	TTCA	2	8	148087	148094	25 %	50 %	0 %	25 %	16272101
3059	NC_000907	AC	3	6	148126	148131	50 %	0 %	0 %	50 %	16272101
3060	NC_000907	A	7	7	148190	148196	100 %	0 %	0 %	0 %	16272101
3061	NC_000907	TAA	2	6	148235	148240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272101
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3063	NC_000907	TTTC	2	8	148273	148280	0 %	75 %	0 %	25 %	16272101
3064	NC_000907	AAT	2	6	148347	148352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272101
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3067	NC_000907	TA	3	6	148404	148409	50 %	50 %	0 %	0 %	16272101
3068	NC_000907	CAA	2	6	148452	148457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16272101
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3070	NC_000907	ATTA	2	8	148680	148687	50 %	50 %	0 %	0 %	16272101
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3072	NC_000907	ACAAA	2	10	148703	148712	80 %	0 %	0 %	20 %	16272101
3073	NC_000907	ATT	2	6	148748	148753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272101
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3083	NC_000907	A	6	6	149034	149039	100 %	0 %	0 %	0 %	16272102
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3086	NC_000907	TAC	2	6	149089	149094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272102
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3095	NC_000907	ATT	2	6	149569	149574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272102
3096	NC_000907	CTTG	2	8	149620	149627	0 %	50 %	25 %	25 %	16272102
3097	NC_000907	ATT	2	6	149638	149643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272102
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3099	NC_000907	CTTATA	2	12	149694	149705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16272102
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3104	NC_000907	TTG	2	6	149841	149846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16272102
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3107	NC_000907	GGCGCA	2	12	150050	150061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16272102
3108	NC_000907	GCA	2	6	150119	150124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272102
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3110	NC_000907	TTA	2	6	150150	150155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272102
3111	NC_000907	TCT	2	6	150184	150189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272102
3112	NC_000907	A	7	7	150201	150207	100 %	0 %	0 %	0 %	16272102
3113	NC_000907	TTTA	2	8	150266	150273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_000907	TAA	2	6	150299	150304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272103
3115	NC_000907	TCA	2	6	150308	150313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272103
3116	NC_000907	ACGTTT	2	12	150315	150326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16272103
3117	NC_000907	GAGT	2	8	150341	150348	25 %	25 %	50 %	0 %	16272103
3118	NC_000907	CTT	2	6	150380	150385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272103
3119	NC_000907	AAT	2	6	150411	150416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272103
3120	NC_000907	ATA	2	6	150432	150437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272103
3121	NC_000907	ATAA	2	8	150443	150450	75 %	25 %	0 %	0 %	16272103
3122	NC_000907	CGG	2	6	150504	150509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16272103
3123	NC_000907	ACC	2	6	150516	150521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16272103
3124	NC_000907	CGA	2	6	150547	150552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16272103
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3243	NC_000907	A	6	6	155240	155245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_000907	AT	4	8	155252	155259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3249	NC_000907	CAT	2	6	155542	155547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272107
3250	NC_000907	CTT	2	6	155557	155562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272107
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3252	NC_000907	T	7	7	155665	155671	0 %	100 %	0 %	0 %	16272107
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3373	NC_000907	AAAT	2	8	161318	161325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_000907	T	6	6	161353	161358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3376	NC_000907	ACAT	2	8	161465	161472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3377	NC_000907	CA	3	6	161534	161539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3378	NC_000907	ATG	2	6	161549	161554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_000907	TCT	2	6	161600	161605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272113
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3493	NC_000907	A	7	7	166347	166353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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