MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_000907	GAA	2	6	1611843	1611848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16273440
34003	NC_000907	CAT	2	6	1611861	1611866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273440
34004	NC_000907	AAG	2	6	1611871	1611876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16273440
34005	NC_000907	ATT	2	6	1611924	1611929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16273440
34006	NC_000907	AT	3	6	1611993	1611998	50 %	50 %	0 %	0 %	16273441
34007	NC_000907	TAAC	2	8	1612047	1612054	50 %	25 %	0 %	25 %	16273441
34008	NC_000907	T	6	6	1612069	1612074	0 %	100 %	0 %	0 %	16273441
34009	NC_000907	ATC	2	6	1612111	1612116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273441
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34011	NC_000907	TGCA	2	8	1612432	1612439	25 %	25 %	25 %	25 %	16273441
34012	NC_000907	AAT	2	6	1612522	1612527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16273441
34013	NC_000907	ACC	2	6	1612555	1612560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16273441
34014	NC_000907	TGC	2	6	1612564	1612569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16273441
34015	NC_000907	GAA	2	6	1612719	1612724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16273441
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34017	NC_000907	TCA	2	6	1612757	1612762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273441
34018	NC_000907	AAT	2	6	1612774	1612779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16273441
34019	NC_000907	ATC	2	6	1612858	1612863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273441
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34041	NC_000907	ATA	2	6	1613865	1613870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_000907	CAAA	2	8	1613907	1613914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34043	NC_000907	A	6	6	1613912	1613917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34044	NC_000907	GCACCT	2	12	1613924	1613935	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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34051	NC_000907	CTAT	2	8	1614418	1614425	25 %	50 %	0 %	25 %	16273442
34052	NC_000907	TTGC	2	8	1614432	1614439	0 %	50 %	25 %	25 %	16273442
34053	NC_000907	CTT	2	6	1614480	1614485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16273442
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34055	NC_000907	A	6	6	1614602	1614607	100 %	0 %	0 %	0 %	16273443
34056	NC_000907	TTG	2	6	1614622	1614627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16273443
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34084	NC_000907	TCGC	2	8	1615580	1615587	0 %	25 %	25 %	50 %	16273444
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34086	NC_000907	A	7	7	1615717	1615723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34087	NC_000907	CT	3	6	1615738	1615743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34088	NC_000907	CAT	3	9	1615750	1615758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34090	NC_000907	TTC	3	9	1615776	1615784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34091	NC_000907	CATA	2	8	1615785	1615792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34092	NC_000907	ATA	2	6	1615805	1615810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34093	NC_000907	TGA	2	6	1615818	1615823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34103	NC_000907	ATAGTA	2	12	1616062	1616073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16273445
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34117	NC_000907	CAA	3	9	1616915	1616923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16273445
34118	NC_000907	ACC	2	6	1616961	1616966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16273445
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34243	NC_000907	CAA	2	6	1622351	1622356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16273451
34244	NC_000907	ATTAA	2	10	1622439	1622448	60 %	40 %	0 %	0 %	16273451
34245	NC_000907	CTG	2	6	1622716	1622721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16273452
34246	NC_000907	ATC	2	6	1622723	1622728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273452
34247	NC_000907	TGA	2	6	1622750	1622755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16273452
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34249	NC_000907	AAT	2	6	1622780	1622785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16273452
34250	NC_000907	ATC	2	6	1622902	1622907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273452
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34253	NC_000907	TCATA	2	10	1623183	1623192	40 %	40 %	0 %	20 %	16273452
34254	NC_000907	CGG	2	6	1623286	1623291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16273453
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34258	NC_000907	TTCT	2	8	1623459	1623466	0 %	75 %	0 %	25 %	16273453
34259	NC_000907	AAAAT	2	10	1623491	1623500	80 %	20 %	0 %	0 %	16273453
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34265	NC_000907	ATCA	2	8	1623931	1623938	50 %	25 %	0 %	25 %	16273453
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34271	NC_000907	AAT	2	6	1624203	1624208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16273453
34272	NC_000907	AT	3	6	1624250	1624255	50 %	50 %	0 %	0 %	16273453
34273	NC_000907	TGA	2	6	1624262	1624267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16273453
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34275	NC_000907	T	6	6	1624338	1624343	0 %	100 %	0 %	0 %	16273453
34276	NC_000907	TCA	2	6	1624405	1624410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34296	NC_000907	A	6	6	1625310	1625315	100 %	0 %	0 %	0 %	16273454
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34354	NC_000907	TGA	2	6	1627837	1627842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16273456
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