MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000907	AATGG	2	10	120722	120731	40 %	20 %	40 %	0 %	16272087
2502	NC_000907	ATT	2	6	120820	120825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2503	NC_000907	AAG	2	6	120826	120831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272087
2504	NC_000907	ATT	2	6	120852	120857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2505	NC_000907	CTC	2	6	120858	120863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16272087
2506	NC_000907	TGG	2	6	120874	120879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272087
2507	NC_000907	GGT	2	6	120947	120952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16272087
2508	NC_000907	T	6	6	120952	120957	0 %	100 %	0 %	0 %	16272087
2509	NC_000907	ATA	2	6	120969	120974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2510	NC_000907	AAT	2	6	120977	120982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2511	NC_000907	A	6	6	120987	120992	100 %	0 %	0 %	0 %	16272087
2512	NC_000907	A	7	7	121026	121032	100 %	0 %	0 %	0 %	16272087
2513	NC_000907	TTA	2	6	121040	121045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2514	NC_000907	ATA	2	6	121089	121094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2515	NC_000907	T	6	6	121104	121109	0 %	100 %	0 %	0 %	16272087
2516	NC_000907	A	6	6	121111	121116	100 %	0 %	0 %	0 %	16272087
2517	NC_000907	A	6	6	121122	121127	100 %	0 %	0 %	0 %	16272087
2518	NC_000907	TAA	2	6	121134	121139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2519	NC_000907	CCTA	2	8	121237	121244	25 %	25 %	0 %	50 %	16272087
2520	NC_000907	CA	3	6	121408	121413	50 %	0 %	0 %	50 %	16272087
2521	NC_000907	AAG	2	6	121431	121436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272087
2522	NC_000907	ATAA	2	8	121505	121512	75 %	25 %	0 %	0 %	16272087
2523	NC_000907	ACT	2	6	121535	121540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272087
2524	NC_000907	TAT	2	6	121551	121556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2525	NC_000907	A	6	6	121573	121578	100 %	0 %	0 %	0 %	16272087
2526	NC_000907	AAAGT	2	10	121605	121614	60 %	20 %	20 %	0 %	16272087
2527	NC_000907	TAT	2	6	121652	121657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2528	NC_000907	TTTA	2	8	121689	121696	25 %	75 %	0 %	0 %	16272087
2529	NC_000907	GAA	2	6	121714	121719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16272087
2530	NC_000907	AAT	2	6	121757	121762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2531	NC_000907	TGGT	2	8	121837	121844	0 %	50 %	50 %	0 %	16272087
2532	NC_000907	TTA	2	6	121846	121851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2533	NC_000907	ATG	2	6	121866	121871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272087
2534	NC_000907	ATT	2	6	121878	121883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2535	NC_000907	TTTA	2	8	121888	121895	25 %	75 %	0 %	0 %	16272087
2536	NC_000907	TGA	2	6	121930	121935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272087
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2539	NC_000907	ATT	2	6	122027	122032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2540	NC_000907	ATC	2	6	122040	122045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272087
2541	NC_000907	ATG	2	6	122058	122063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272087
2542	NC_000907	ACT	2	6	122078	122083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272087
2543	NC_000907	TGC	2	6	122146	122151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16272087
2544	NC_000907	AAT	2	6	122159	122164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272087
2545	NC_000907	GTTAT	2	10	122208	122217	20 %	60 %	20 %	0 %	16272087
2546	NC_000907	TTA	2	6	122239	122244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16272087
2547	NC_000907	TTAT	2	8	122254	122261	25 %	75 %	0 %	0 %	16272087
2548	NC_000907	ACT	2	6	122369	122374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272087
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2550	NC_000907	GATC	2	8	122444	122451	25 %	25 %	25 %	25 %	16272087
2551	NC_000907	CAT	2	6	122475	122480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16272087
2552	NC_000907	AATA	2	8	122675	122682	75 %	25 %	0 %	0 %	16272087
2553	NC_000907	A	7	7	122730	122736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_000907	ATA	2	6	122744	122749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_000907	ATA	2	6	122799	122804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_000907	ATA	2	6	122880	122885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_000907	AAACT	2	10	122887	122896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2558	NC_000907	AAC	2	6	122933	122938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_000907	TCT	2	6	122955	122960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_000907	CTTT	2	8	122968	122975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_000907	TA	3	6	122996	123001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_000907	TGT	2	6	123005	123010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_000907	CTA	2	6	123025	123030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_000907	GAA	3	9	123056	123064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_000907	TTAT	2	8	123095	123102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_000907	AAC	3	9	123127	123135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_000907	ATTA	2	8	123227	123234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_000907	A	8	8	123239	123246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_000907	AT	3	6	123252	123257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_000907	T	6	6	123314	123319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_000907	ACA	2	6	123328	123333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_000907	A	7	7	123369	123375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_000907	CGC	2	6	123543	123548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_000907	TC	3	6	123586	123591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_000907	TC	3	6	123602	123607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_000907	TTTC	2	8	123668	123675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2577	NC_000907	TCT	2	6	123683	123688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_000907	AC	3	6	123852	123857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2579	NC_000907	CGT	2	6	123870	123875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_000907	ACA	2	6	123881	123886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_000907	AGC	2	6	124047	124052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_000907	CAAT	2	8	124055	124062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2583	NC_000907	ACG	2	6	124101	124106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_000907	TGA	2	6	124181	124186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_000907	CCG	2	6	124209	124214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_000907	ACC	2	6	124296	124301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2587	NC_000907	TGTC	2	8	124337	124344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2588	NC_000907	GCTT	2	8	124355	124362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2589	NC_000907	CTC	2	6	124415	124420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_000907	GAG	2	6	124434	124439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_000907	CCA	2	6	124459	124464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2592	NC_000907	GGT	2	6	124519	124524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_000907	ATTTCA	2	12	124675	124686	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2594	NC_000907	CAT	2	6	124714	124719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_000907	GCC	2	6	124789	124794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_000907	GGCA	2	8	124860	124867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_000907	TAA	2	6	124914	124919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_000907	CAGC	2	8	124927	124934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_000907	TC	3	6	125042	125047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_000907	ACC	2	6	125072	125077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_000907	TCA	2	6	125171	125176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_000907	TC	3	6	125177	125182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_000907	TAACC	2	10	125254	125263	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2604	NC_000907	CTT	2	6	125483	125488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_000907	CGACT	2	10	125582	125591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2606	NC_000907	CTTT	2	8	125606	125613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_000907	ATG	2	6	125616	125621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_000907	GCT	2	6	125622	125627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_000907	GTT	2	6	125712	125717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_000907	ACG	2	6	125727	125732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_000907	GT	3	6	125749	125754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_000907	TCGGT	2	10	125957	125966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2613	NC_000907	GTAC	2	8	126169	126176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_000907	GGA	2	6	126275	126280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_000907	C	6	6	126285	126290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2616	NC_000907	TTC	2	6	126291	126296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_000907	CTTTCG	2	12	126434	126445	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_000907	CGC	2	6	126448	126453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_000907	CAA	2	6	126523	126528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_000907	TTG	2	6	126542	126547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_000907	TAG	2	6	126549	126554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_000907	TTC	2	6	126556	126561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_000907	CTT	2	6	126644	126649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_000907	TTCA	2	8	126766	126773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2625	NC_000907	TCAA	2	8	126797	126804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2626	NC_000907	T	7	7	126807	126813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_000907	GTTTT	2	10	126823	126832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_000907	TC	3	6	126851	126856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_000907	TC	3	6	126888	126893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_000907	T	6	6	126924	126929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_000907	TAA	2	6	126949	126954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2633	NC_000907	TG	3	6	127144	127149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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