MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000907	CGCAT	2	10	234976	234985	20 %	20 %	20 %	40 %	16272179
5002	NC_000907	TAA	2	6	235035	235040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16272179
5003	NC_000907	TGA	2	6	235104	235109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272179
5004	NC_000907	TATT	2	8	235137	235144	25 %	75 %	0 %	0 %	16272179
5005	NC_000907	GTA	2	6	235174	235179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16272179
5006	NC_000907	TTC	2	6	235194	235199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16272179
5007	NC_000907	AT	3	6	235274	235279	50 %	50 %	0 %	0 %	16272179
5008	NC_000907	ATG	2	6	235369	235374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_000907	AAT	2	6	235459	235464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_000907	ATA	2	6	235484	235489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_000907	GAA	2	6	235498	235503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_000907	TAA	2	6	235593	235598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_000907	T	6	6	235680	235685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_000907	GAT	2	6	235744	235749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_000907	AAT	2	6	235822	235827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_000907	TCA	2	6	235838	235843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_000907	ATG	2	6	235880	235885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_000907	A	7	7	235924	235930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_000907	AAAG	2	8	235979	235986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_000907	TC	3	6	236003	236008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_000907	AT	3	6	236014	236019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_000907	A	6	6	236122	236127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_000907	GTT	2	6	236230	236235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_000907	CTTA	2	8	236295	236302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_000907	A	6	6	236305	236310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_000907	GTG	2	6	236328	236333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_000907	T	6	6	236426	236431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_000907	GAT	2	6	236546	236551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_000907	ACC	2	6	236567	236572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_000907	AAT	2	6	236585	236590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_000907	GAA	2	6	236603	236608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_000907	GGT	2	6	236632	236637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_000907	A	7	7	236682	236688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_000907	A	6	6	236705	236710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_000907	GT	3	6	236781	236786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_000907	TGA	2	6	236830	236835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5038	NC_000907	TTA	2	6	237082	237087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_000907	CAA	2	6	237138	237143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_000907	GCC	2	6	237155	237160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_000907	GAA	2	6	237164	237169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_000907	TGA	2	6	237256	237261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_000907	ACT	2	6	237270	237275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_000907	GAA	2	6	237580	237585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_000907	A	6	6	237597	237602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_000907	TGA	2	6	237625	237630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_000907	A	6	6	237713	237718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_000907	ATT	2	6	237730	237735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_000907	GCA	2	6	237785	237790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_000907	CAAG	2	8	237844	237851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_000907	ATG	2	6	237864	237869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_000907	AAAGA	2	10	237966	237975	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_000907	GAT	2	6	238010	238015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_000907	TTA	2	6	238034	238039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_000907	CAT	2	6	238088	238093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5058	NC_000907	CCG	2	6	238132	238137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_000907	GTTC	2	8	238142	238149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_000907	AG	3	6	238171	238176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_000907	CAAA	2	8	238199	238206	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_000907	GAT	2	6	238211	238216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_000907	TTC	2	6	238247	238252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_000907	AAG	2	6	238278	238283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_000907	AAG	2	6	238299	238304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_000907	GCA	2	6	238322	238327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_000907	ACGGC	2	10	238374	238383	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5068	NC_000907	AGA	2	6	238443	238448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_000907	A	6	6	238455	238460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_000907	TGC	2	6	238462	238467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_000907	GGA	2	6	238493	238498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_000907	ATTTAA	2	12	238502	238513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_000907	CAA	2	6	238519	238524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_000907	TTA	2	6	238534	238539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5076	NC_000907	ATA	2	6	238609	238614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_000907	T	6	6	238644	238649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_000907	ACTT	2	8	238660	238667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_000907	CTG	2	6	238697	238702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30995362
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5083	NC_000907	CCT	2	6	238882	238887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30995362
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5087	NC_000907	T	6	6	239005	239010	0 %	100 %	0 %	0 %	30995362
5088	NC_000907	CATA	2	8	239099	239106	50 %	25 %	0 %	25 %	30995362
5089	NC_000907	A	6	6	239112	239117	100 %	0 %	0 %	0 %	30995362
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5095	NC_000907	TAA	2	6	239373	239378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_000907	TAAAA	2	10	239417	239426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_000907	TAT	2	6	239453	239458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_000907	AAT	2	6	239475	239480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_000907	TCC	2	6	239529	239534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16273674
5101	NC_000907	TCT	2	6	239538	239543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16273674
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5103	NC_000907	TCT	2	6	239688	239693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16273674
5104	NC_000907	TTTC	2	8	239695	239702	0 %	75 %	0 %	25 %	16273674
5105	NC_000907	GTTT	2	8	239742	239749	0 %	75 %	25 %	0 %	16273674
5106	NC_000907	ATC	2	6	239831	239836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16273674
5107	NC_000907	A	6	6	239870	239875	100 %	0 %	0 %	0 %	16273674
5108	NC_000907	CCAT	2	8	239928	239935	25 %	25 %	0 %	50 %	16273674
5109	NC_000907	A	6	6	240000	240005	100 %	0 %	0 %	0 %	16273674
5110	NC_000907	TC	3	6	240028	240033	0 %	50 %	0 %	50 %	16273674
5111	NC_000907	CAACAT	2	12	240145	240156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16273674
5112	NC_000907	ATA	2	6	240192	240197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16273674
5113	NC_000907	GGC	2	6	240404	240409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_000907	TTTC	2	8	240410	240417	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_000907	ATA	2	6	240423	240428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_000907	TTC	2	6	240450	240455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_000907	AAT	2	6	240525	240530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_000907	A	6	6	240644	240649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_000907	T	7	7	240655	240661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_000907	TAA	2	6	240699	240704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_000907	TGGC	2	8	240720	240727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_000907	AATTC	2	10	240733	240742	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_000907	T	6	6	240755	240760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_000907	AAT	2	6	240768	240773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_000907	AAT	2	6	240824	240829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_000907	ATC	2	6	240840	240845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_000907	TCA	3	9	240850	240858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_000907	T	7	7	240949	240955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_000907	T	6	6	240981	240986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_000907	AGC	2	6	240990	240995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_000907	CTA	2	6	241070	241075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_000907	A	6	6	241084	241089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_000907	CGAA	2	8	241128	241135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_000907	TGA	2	6	241156	241161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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