MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gordonibacter pamelaeae 7-10-1-b draft genome

Total Repeats: 41728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_021021	GC	3	6	898990	898995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12003	NC_021021	GTG	2	6	899030	899035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021021	GGC	2	6	899079	899084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12005	NC_021021	GC	4	8	899178	899185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12006	NC_021021	GC	3	6	899225	899230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12007	NC_021021	GCA	2	6	899234	899239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_021021	GAT	2	6	899356	899361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_021021	CCG	2	6	899388	899393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12010	NC_021021	GC	3	6	899423	899428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12011	NC_021021	CG	3	6	899429	899434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12012	NC_021021	GCC	2	6	899441	899446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12013	NC_021021	ACGA	2	8	899525	899532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12014	NC_021021	GC	3	6	899575	899580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12015	NC_021021	GCGA	2	8	899585	899592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12016	NC_021021	GCA	2	6	899595	899600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_021021	GCG	2	6	899614	899619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_021021	ATG	2	6	899708	899713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_021021	CGTC	2	8	899729	899736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12020	NC_021021	GC	3	6	899742	899747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12021	NC_021021	TTC	2	6	899759	899764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_021021	CG	3	6	899776	899781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12023	NC_021021	CG	4	8	899802	899809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12024	NC_021021	GCACG	2	10	899815	899824	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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12038	NC_021021	GCCGC	2	10	900461	900470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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12055	NC_021021	CG	4	8	901158	901165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12059	NC_021021	GCC	2	6	901434	901439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12098	NC_021021	TCCA	2	8	903379	903386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12103	NC_021021	CAG	2	6	903528	903533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12110	NC_021021	GAG	2	6	903724	903729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12112	NC_021021	CGTG	2	8	903744	903751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12113	NC_021021	TGC	2	6	903803	903808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12117	NC_021021	CCGA	2	8	903882	903889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12118	NC_021021	ACG	2	6	903890	903895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12122	NC_021021	TCGT	2	8	904069	904076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12123	NC_021021	TAC	2	6	904078	904083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12126	NC_021021	CTT	2	6	904277	904282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12127	NC_021021	AGG	2	6	904285	904290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12130	NC_021021	AGG	2	6	904995	905000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12132	NC_021021	GTT	2	6	906251	906256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_021021	CGG	2	6	906274	906279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12134	NC_021021	CGC	2	6	906329	906334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12248	NC_021021	TGA	2	6	918242	918247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12250	NC_021021	CGA	2	6	918282	918287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12252	NC_021021	GAG	2	6	918310	918315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12253	NC_021021	GCG	2	6	918328	918333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12254	NC_021021	CTACCC	2	12	918336	918347	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12256	NC_021021	GC	3	6	918391	918396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12257	NC_021021	CGAG	2	8	918402	918409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12258	NC_021021	AGGA	2	8	918434	918441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_021021	GC	3	6	918899	918904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12260	NC_021021	GGC	3	9	918923	918931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12261	NC_021021	CGAGGC	2	12	918949	918960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12262	NC_021021	CGT	2	6	918982	918987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12263	NC_021021	N	331	331	919015	919345	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_021021	GCG	2	6	919355	919360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12265	NC_021021	CTG	2	6	919404	919409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12266	NC_021021	GCG	2	6	919410	919415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12267	NC_021021	CTG	2	6	919434	919439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12269	NC_021021	CG	3	6	919513	919518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12271	NC_021021	GC	3	6	919524	919529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12272	NC_021021	CCCG	2	8	919532	919539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12273	NC_021021	GCG	2	6	919557	919562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12377	NC_021021	GA	3	6	929962	929967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12378	NC_021021	GAC	3	9	929981	929989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12379	NC_021021	AACGT	2	10	930001	930010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12380	NC_021021	CG	3	6	930031	930036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12381	NC_021021	CAA	2	6	931120	931125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12382	NC_021021	CG	5	10	931162	931171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12383	NC_021021	TCG	2	6	931258	931263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12384	NC_021021	GGC	2	6	931271	931276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12388	NC_021021	CGC	2	6	931391	931396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12389	NC_021021	CGT	2	6	931421	931426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12390	NC_021021	CGT	2	6	931541	931546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12391	NC_021021	TGC	2	6	931555	931560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12392	NC_021021	N	212	212	931568	931779	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12393	NC_021021	CAG	3	9	931847	931855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12394	NC_021021	GAT	2	6	931879	931884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12395	NC_021021	CCA	2	6	931941	931946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12396	NC_021021	CGC	2	6	931948	931953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12397	NC_021021	CGC	2	6	931963	931968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12398	NC_021021	CGC	2	6	932032	932037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12399	NC_021021	CCG	3	9	932040	932048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12400	NC_021021	CTT	2	6	932065	932070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12401	NC_021021	CGG	2	6	932190	932195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12402	NC_021021	CTG	2	6	932270	932275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12403	NC_021021	GC	3	6	932342	932347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12404	NC_021021	GCGCGG	2	12	932352	932363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12406	NC_021021	CGC	2	6	932425	932430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12408	NC_021021	GTG	3	9	932558	932566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12410	NC_021021	TGG	2	6	932727	932732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12411	NC_021021	TGC	2	6	932778	932783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12414	NC_021021	AGC	2	6	933651	933656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12415	NC_021021	CCT	3	9	934462	934470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12416	NC_021021	GCG	2	6	934493	934498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12417	NC_021021	GCGG	2	8	934503	934510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12418	NC_021021	TC	3	6	934588	934593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12419	NC_021021	GGCA	2	8	934640	934647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12420	NC_021021	CTCG	2	8	935909	935916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12421	NC_021021	CG	3	6	935915	935920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12422	NC_021021	A	7	7	936011	936017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12423	NC_021021	GGT	2	6	936035	936040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12424	NC_021021	GCGG	2	8	936044	936051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12425	NC_021021	GCAA	2	8	936124	936131	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12426	NC_021021	GCCG	2	8	936132	936139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12427	NC_021021	ATG	2	6	936182	936187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12428	NC_021021	CTT	2	6	939273	939278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12429	NC_021021	GCG	2	6	939319	939324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12430	NC_021021	CGG	2	6	939352	939357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12431	NC_021021	CAAC	2	8	939361	939368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12432	NC_021021	GTTAC	2	10	939370	939379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12433	NC_021021	AGG	2	6	939409	939414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12434	NC_021021	CTC	2	6	939428	939433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12435	NC_021021	CTG	2	6	939443	939448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12436	NC_021021	CGGA	2	8	941429	941436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12437	NC_021021	GCC	2	6	941439	941444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12438	NC_021021	GCC	2	6	942667	942672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12439	NC_021021	N	125	125	942700	942824	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12440	NC_021021	TCC	2	6	942860	942865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12442	NC_021021	TCC	2	6	942902	942907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12443	NC_021021	TCG	2	6	942962	942967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12446	NC_021021	ACGG	2	8	943034	943041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12447	NC_021021	CGC	2	6	943065	943070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12448	NC_021021	GC	3	6	943069	943074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12449	NC_021021	GAT	2	6	943084	943089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12450	NC_021021	TCC	2	6	943155	943160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12451	NC_021021	TCGC	2	8	943512	943519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12452	NC_021021	GAT	2	6	943525	943530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12454	NC_021021	CGC	2	6	945183	945188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12455	NC_021021	TCG	2	6	945224	945229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12456	NC_021021	CTTG	2	8	945270	945277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12457	NC_021021	ATG	2	6	945278	945283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12464	NC_021021	CGGC	2	8	945573	945580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12465	NC_021021	TCG	2	6	945728	945733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12470	NC_021021	TGAC	2	8	945879	945886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12471	NC_021021	TTCCT	2	10	945909	945918	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12472	NC_021021	TGTT	2	8	945923	945930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12473	NC_021021	AGG	2	6	945965	945970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12474	NC_021021	TTTG	2	8	946006	946013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12475	NC_021021	GAG	2	6	946049	946054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12477	NC_021021	CGT	2	6	946146	946151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12478	NC_021021	CCG	2	6	946172	946177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12482	NC_021021	GGGA	2	8	946254	946261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12483	NC_021021	TCA	2	6	946275	946280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12485	NC_021021	AAG	2	6	946295	946300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12487	NC_021021	GGC	2	6	946357	946362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12500	NC_021021	GCG	2	6	946835	946840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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