MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3503	NC_017456	TCA	2	6	954343	954348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_017456	ATC	2	6	954351	954356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017456	CTA	2	6	954494	954499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017456	GCCT	2	8	954502	954509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3508	NC_017456	CTT	2	6	954559	954564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_017456	AGAA	2	8	954582	954589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017456	TGA	2	6	954591	954596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3512	NC_017456	T	6	6	954667	954672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3523	NC_017456	ACTT	2	8	955344	955351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3542	NC_017456	TGT	2	6	955995	956000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_017456	TA	3	6	967119	967124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_017456	TGCAC	2	10	977272	977281	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3597	NC_017456	TTTA	2	8	986560	986567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017456	TA	3	6	986605	986610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017456	ACC	2	6	989274	989279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_017456	TATT	2	8	989295	989302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017456	TAAA	2	8	989312	989319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017456	A	8	8	989317	989324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017456	T	6	6	992476	992481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017456	TAC	2	6	992541	992546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3606	NC_017456	GTTA	2	8	992602	992609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017456	AAC	2	6	993067	993072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017456	AAT	2	6	993578	993583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017456	GT	3	6	993611	993616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017456	CTA	2	6	993635	993640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3612	NC_017456	ACT	2	6	994535	994540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_017456	TAA	2	6	998115	998120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_017456	TTA	2	6	998151	998156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017456	ATTTT	2	10	998940	998949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_017456	ATT	2	6	999000	999005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017456	T	7	7	999047	999053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017456	T	6	6	999062	999067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017456	CA	3	6	999189	999194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_017456	ACC	2	6	999294	999299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_017456	TGG	2	6	999308	999313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017456	T	7	7	999314	999320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017456	ATTT	2	8	999328	999335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_017456	ATC	2	6	999383	999388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_017456	GTT	2	6	999443	999448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017456	GAT	2	6	999490	999495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_017456	A	7	7	1000515	1000521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_017456	T	6	6	1000547	1000552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_017456	TCC	2	6	1002015	1002020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_017456	GCA	2	6	1002079	1002084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_017456	TGC	2	6	1002097	1002102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_017456	TTA	2	6	1002116	1002121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_017456	AGAA	2	8	1002145	1002152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_017456	TTG	2	6	1002226	1002231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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