MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 5994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017456	TCA	2	6	1590322	1590327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017456	TCTTAT	2	12	1590371	1590382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5504	NC_017456	AGC	2	6	1590504	1590509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_017456	CAG	2	6	1590512	1590517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017456	TTG	2	6	1590583	1590588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017456	ACCG	2	8	1590666	1590673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_017456	ATG	2	6	1590737	1590742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017456	ATC	2	6	1590745	1590750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017456	A	6	6	1590778	1590783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017456	TAAC	2	8	1590793	1590800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5512	NC_017456	C	11	11	1590829	1590839	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5513	NC_017456	T	7	7	1590872	1590878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017456	GA	3	6	1591046	1591051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017456	AAT	2	6	1591159	1591164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017456	ACAA	2	8	1591181	1591188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_017456	AAC	2	6	1591224	1591229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017456	CAA	3	9	1591232	1591240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017456	AAGC	2	8	1591378	1591385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_017456	AGGT	2	8	1591429	1591436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017456	CG	3	6	1591440	1591445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_017456	ATGTAA	2	12	1597553	1597564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017456	AATA	2	8	1597608	1597615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017456	GGC	2	6	1597623	1597628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_017456	TGCG	2	8	1599527	1599534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5527	NC_017456	CG	3	6	1599721	1599726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_017456	GC	3	6	1599732	1599737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5529	NC_017456	AAGC	2	8	1599782	1599789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_017456	CG	3	6	1599810	1599815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_017456	TTG	2	6	1601553	1601558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5533	NC_017456	CTTAT	2	10	1601591	1601600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5534	NC_017456	TGACT	2	10	1601612	1601621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_017456	ATTTT	2	10	1601633	1601642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5541	NC_017456	TAC	2	6	1601884	1601889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5548	NC_017456	CGGGG	2	10	1603357	1603366	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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5551	NC_017456	AT	3	6	1605830	1605835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017456	GC	3	6	1607847	1607852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5556	NC_017456	TGA	2	6	1607977	1607982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5561	NC_017456	AC	3	6	1609316	1609321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_017456	TAA	2	6	1613384	1613389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017456	CTAT	2	8	1613410	1613417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_017456	TAAT	2	8	1613442	1613449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017456	TATT	2	8	1613459	1613466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5571	NC_017456	A	6	6	1614676	1614681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5583	NC_017456	TG	3	6	1622482	1622487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_017456	TTGC	2	8	1623994	1624001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5617	NC_017456	A	8	8	1627994	1628001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017456	CTTT	2	8	1628384	1628391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_017456	TTTA	2	8	1628417	1628424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_017456	CAAA	2	8	1633509	1633516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_017456	TAA	2	6	1633540	1633545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_017456	TAA	2	6	1633579	1633584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_017456	AATTT	2	10	1635998	1636007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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