MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 13109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016906	CGA	2	6	4228556	4228561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_016906	ACGG	2	8	4228598	4228605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_016906	ACA	2	6	4228654	4228659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_016906	GT	3	6	4230070	4230075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016906	CGA	2	6	4230077	4230082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_016906	AAG	2	6	4230095	4230100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_016906	TGG	2	6	4230122	4230127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016906	GGC	2	6	4230131	4230136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_016906	TGGT	2	8	4230180	4230187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016906	CGC	2	6	4230231	4230236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_016906	GGA	2	6	4230261	4230266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_016906	G	6	6	4230283	4230288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016906	CGGG	2	8	4230298	4230305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_016906	G	6	6	4230355	4230360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016906	G	6	6	4230383	4230388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_016906	GACGTC	2	12	4230474	4230485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_016906	GTC	2	6	4230538	4230543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_016906	CAC	2	6	4231944	4231949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_016906	CGC	2	6	4231970	4231975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_016906	CG	3	6	4232709	4232714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_016906	C	6	6	4233711	4233716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10022	NC_016906	TCGG	2	8	4235006	4235013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10023	NC_016906	CCG	3	9	4235744	4235752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_016906	GTT	2	6	4238949	4238954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_016906	TCCCCC	2	12	4244642	4244653	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10026	NC_016906	CGA	2	6	4244692	4244697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_016906	TCCGGT	2	12	4244726	4244737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_016906	TCCGG	2	10	4244740	4244749	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10029	NC_016906	CGG	2	6	4244782	4244787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_016906	CGGT	2	8	4244846	4244853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_016906	CAC	3	9	4244856	4244864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_016906	TCG	2	6	4244891	4244896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_016906	GCG	3	9	4244907	4244915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_016906	GA	3	6	4244927	4244932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_016906	GGC	2	6	4244934	4244939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_016906	TTC	2	6	4248071	4248076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_016906	CGG	2	6	4248113	4248118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_016906	TC	3	6	4249841	4249846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_016906	GTG	2	6	4252565	4252570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_016906	GGT	2	6	4252587	4252592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_016906	TCA	3	9	4254284	4254292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_016906	ACA	2	6	4254313	4254318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_016906	GAC	2	6	4254836	4254841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_016906	GTT	2	6	4254857	4254862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016906	GCC	2	6	4255490	4255495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_016906	TCG	2	6	4255535	4255540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_016906	CTC	2	6	4255547	4255552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_016906	ATC	2	6	4255562	4255567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_016906	GAA	2	6	4255572	4255577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016906	GTT	2	6	4259979	4259984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016906	GGGT	2	8	4260001	4260008	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_016906	GGGT	2	8	4260018	4260025	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016906	GATA	2	8	4262576	4262583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016906	GATA	2	8	4262608	4262615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_016906	CTC	2	6	4262699	4262704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_016906	GAG	2	6	4262710	4262715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016906	GAG	2	6	4262724	4262729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_016906	GCC	2	6	4262733	4262738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_016906	CGG	2	6	4263372	4263377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_016906	CGGGCG	2	12	4263381	4263392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_016906	TCTG	2	8	4265087	4265094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_016906	ACT	2	6	4265172	4265177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_016906	TCAT	2	8	4265184	4265191	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_016906	TTC	2	6	4265204	4265209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_016906	CGC	3	9	4265263	4265271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_016906	GGT	2	6	4265799	4265804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016906	CGT	2	6	4265805	4265810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_016906	TGT	2	6	4265820	4265825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_016906	CGT	2	6	4265870	4265875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_016906	TGT	2	6	4266791	4266796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_016906	TC	3	6	4267727	4267732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10072	NC_016906	CGG	2	6	4270531	4270536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_016906	AGC	2	6	4270548	4270553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_016906	CGGAC	2	10	4270555	4270564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10075	NC_016906	GCGA	2	8	4270578	4270585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_016906	CGAGG	2	10	4272057	4272066	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10077	NC_016906	CGT	2	6	4272073	4272078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_016906	CGG	2	6	4273014	4273019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_016906	CGA	2	6	4273083	4273088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_016906	GAG	2	6	4273095	4273100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_016906	GTG	2	6	4273527	4273532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_016906	CCA	2	6	4273591	4273596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10083	NC_016906	CGC	3	9	4273606	4273614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_016906	GCA	2	6	4273635	4273640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_016906	CGG	2	6	4273650	4273655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_016906	CGA	2	6	4273657	4273662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_016906	CCA	2	6	4273737	4273742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10088	NC_016906	CAG	2	6	4273754	4273759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_016906	CA	3	6	4273795	4273800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_016906	GAG	2	6	4273801	4273806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_016906	GCG	2	6	4275487	4275492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_016906	CCG	2	6	4275607	4275612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_016906	CCG	2	6	4276808	4276813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10094	NC_016906	CGT	2	6	4276815	4276820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_016906	CCG	2	6	4277665	4277670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_016906	GAG	2	6	4277712	4277717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_016906	GCA	2	6	4277851	4277856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_016906	CGA	2	6	4277858	4277863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_016906	TCAGC	2	10	4277889	4277898	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10100	NC_016906	CGA	2	6	4280561	4280566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_016906	TCCG	2	8	4280567	4280574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_016906	AC	3	6	4280588	4280593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_016906	CCA	2	6	4280675	4280680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10104	NC_016906	TTTGG	2	10	4284525	4284534	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016906	GAG	2	6	4284586	4284591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_016906	ACC	2	6	4284612	4284617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_016906	TTC	2	6	4285102	4285107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_016906	GCA	2	6	4285125	4285130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_016906	GAC	2	6	4285726	4285731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_016906	GGT	2	6	4285735	4285740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_016906	AGA	2	6	4286446	4286451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_016906	GCG	2	6	4286507	4286512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_016906	CCG	2	6	4290526	4290531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_016906	CGG	2	6	4290544	4290549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_016906	TG	3	6	4294094	4294099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_016906	CA	3	6	4294156	4294161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_016906	AGG	2	6	4294193	4294198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_016906	CAGC	2	8	4294199	4294206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_016906	AAG	2	6	4294230	4294235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_016906	GCAG	2	8	4294262	4294269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_016906	TG	3	6	4294294	4294299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_016906	CCG	2	6	4294336	4294341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10123	NC_016906	CGTCA	2	10	4294346	4294355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10124	NC_016906	GAA	2	6	4294377	4294382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_016906	GT	3	6	4294386	4294391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_016906	CTG	2	6	4294397	4294402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_016906	ACCGC	2	10	4294437	4294446	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10128	NC_016906	GTG	2	6	4294448	4294453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10130	NC_016906	CA	3	6	4294483	4294488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10242	NC_016906	GTCTG	2	10	4362614	4362623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10243	NC_016906	CGTG	2	8	4362624	4362631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10244	NC_016906	CGG	2	6	4364376	4364381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10246	NC_016906	GA	3	6	4365285	4365290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_016906	CG	3	6	4365318	4365323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10248	NC_016906	TGA	2	6	4365326	4365331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_016906	CG	4	8	4365341	4365348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10250	NC_016906	CGA	2	6	4365373	4365378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_016906	CGGA	2	8	4365426	4365433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10252	NC_016906	GCG	2	6	4365442	4365447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_016906	CA	3	6	4365924	4365929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10254	NC_016906	CGCA	2	8	4369349	4369356	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10255	NC_016906	GGA	2	6	4369371	4369376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10257	NC_016906	CAC	2	6	4369424	4369429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10382	NC_016906	GATCA	2	10	4443602	4443611	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10383	NC_016906	TCG	3	9	4443621	4443629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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