MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 7416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015460	AGCA	2	8	179	186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015460	AAT	2	6	1077	1082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015460	AAAAG	2	10	1098	1107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015460	TTTA	2	8	1115	1122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015460	A	6	6	1131	1136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015460	ACC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_015460	GGTC	2	8	5633	5640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015460	CAA	2	6	5700	5705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015460	A	6	6	5718	5723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015460	GTT	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015460	AGAA	2	8	7083	7090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015460	A	6	6	7089	7094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015460	AG	3	6	7106	7111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015460	G	6	6	7115	7120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015460	AATAA	2	10	7132	7141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015460	A	6	6	7140	7145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015460	ATAAAA	2	12	7191	7202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015460	ATTT	2	8	7231	7238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015460	GTT	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015460	ATT	2	6	9747	9752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015460	T	7	7	10408	10414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015460	T	6	6	10428	10433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015460	CAG	2	6	10462	10467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015460	T	7	7	10479	10485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015460	GAA	2	6	10582	10587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015460	CAA	2	6	10654	10659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015460	CA	3	6	10701	10706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015460	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015460	GCATG	2	10	10785	10794	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015460	CCAA	2	8	10843	10850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015460	TCA	2	6	10872	10877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015460	AAT	2	6	10887	10892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015460	GGT	2	6	10918	10923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015460	ATT	2	6	10978	10983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015460	AAC	2	6	10985	10990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015460	TCA	2	6	11061	11066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015460	TCA	2	6	11153	11158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015460	AAT	2	6	11159	11164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015460	ACC	2	6	11628	11633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015460	ATTTA	2	10	11704	11713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015460	TTA	2	6	11732	11737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015460	ATT	2	6	11764	11769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015460	T	6	6	11816	11821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015460	A	6	6	12913	12918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015460	TAT	2	6	12926	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015460	T	7	7	12956	12962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015460	ATT	2	6	12990	12995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015460	ATC	2	6	13036	13041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015460	AT	3	6	13043	13048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015460	A	6	6	13063	13068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015460	GTG	2	6	13096	13101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015460	AAT	2	6	13119	13124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015460	TTTA	2	8	17635	17642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015460	TGT	2	6	17648	17653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015460	ATT	2	6	19816	19821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015460	TTTA	2	8	19905	19912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015460	AGA	2	6	19938	19943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015460	ATAA	2	8	19967	19974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015460	TAT	2	6	20009	20014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015460	T	6	6	20048	20053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015460	TGT	2	6	20076	20081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015460	AAG	2	6	20114	20119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015460	AG	3	6	20118	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015460	A	7	7	20133	20139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015460	ACAA	2	8	20169	20176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015460	TAT	2	6	20181	20186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015460	ATA	2	6	20192	20197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015460	TA	4	8	20203	20210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015460	GTTA	2	8	20211	20218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015460	ATT	2	6	20258	20263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015460	T	6	6	20267	20272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015460	A	6	6	20347	20352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015460	A	6	6	21879	21884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015460	A	6	6	21921	21926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015460	GGAT	2	8	22294	22301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015460	TAC	2	6	25096	25101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015460	AT	3	6	25103	25108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015460	A	6	6	25158	25163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015460	TAA	2	6	25803	25808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015460	CTT	2	6	25832	25837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015460	ATAGC	2	10	25839	25848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015460	ATA	2	6	25861	25866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015460	AT	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015460	TTC	2	6	25874	25879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015460	CTA	2	6	25897	25902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015460	CAA	2	6	25940	25945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015460	T	6	6	25953	25958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015460	ATT	2	6	26833	26838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015460	TTAA	2	8	26894	26901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015460	AAC	2	6	28390	28395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015460	A	7	7	28403	28409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015460	AATT	2	8	28417	28424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015460	TAA	2	6	28460	28465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015460	T	6	6	28489	28494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015460	ATG	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015460	CAT	2	6	29038	29043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015460	GTT	2	6	31703	31708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015460	ATT	2	6	31723	31728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015460	T	6	6	31727	31732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015460	A	6	6	31737	31742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015460	A	6	6	31758	31763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015460	T	7	7	31770	31776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015460	ATT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015460	TTG	2	6	32664	32669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015460	TTA	2	6	32684	32689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015460	ATA	2	6	32691	32696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015460	TCA	2	6	32723	32728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015460	ATG	2	6	32751	32756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015460	GAG	2	6	32767	32772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015460	CTT	2	6	33150	33155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015460	TCTTA	2	10	33157	33166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015460	T	7	7	33617	33623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015460	TTA	2	6	33655	33660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015460	A	6	6	33673	33678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015460	TATC	2	8	33684	33691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015460	A	6	6	33701	33706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015460	TTA	3	9	33707	33715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015460	ATCA	2	8	33716	33723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015460	GT	4	8	33734	33741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015460	AAT	2	6	35102	35107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015460	A	6	6	35108	35113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015460	TGAC	2	8	36505	36512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015460	GTCA	2	8	36526	36533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015460	TTTC	2	8	36969	36976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015460	TC	3	6	37015	37020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015460	ATT	2	6	37059	37064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015460	TGT	2	6	39320	39325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015460	AGTTT	2	10	39327	39336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015460	AGC	2	6	39363	39368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015460	AAT	2	6	39386	39391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015460	ATAAAA	2	12	39428	39439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015460	A	8	8	39457	39464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015460	TAA	2	6	41055	41060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015460	AAGG	2	8	41103	41110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015460	ACC	2	6	41122	41127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015460	A	7	7	41155	41161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015460	CCAA	2	8	41200	41207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015460	CGG	2	6	41231	41236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015460	CTT	2	6	41249	41254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015460	AAG	2	6	41273	41278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015460	TAA	2	6	41286	41291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015460	ACA	2	6	41322	41327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015460	A	7	7	41334	41340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015460	TATT	2	8	41359	41366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015460	ATT	2	6	41372	41377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015460	TTA	2	6	41381	41386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015460	TTCTT	2	10	41432	41441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015460	ATT	2	6	41472	41477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015460	CTAT	2	8	41899	41906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015460	CTTT	2	8	41937	41944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_015460	TAA	2	6	41989	41994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_015460	A	6	6	65775	65780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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