MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacter bemidjiensis Bem chromosome

Total Repeats: 11649

< Previous12...12131415161718192021222324Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011146	CTCTT	2	10	4533284	4533293	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11502	NC_011146	CTCAAT	2	12	4533323	4533334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_011146	ATCTTT	2	12	4533351	4533362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11504	NC_011146	ATCTTT	2	12	4533369	4533380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11505	NC_011146	ATA	2	6	4534438	4534443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_011146	CGGCG	2	10	4534797	4534806	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11507	NC_011146	TGT	2	6	4534837	4534842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_011146	GCT	2	6	4534848	4534853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_011146	CGC	2	6	4538433	4538438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11510	NC_011146	AGG	2	6	4539892	4539897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_011146	T	6	6	4539931	4539936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_011146	TCC	2	6	4542731	4542736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11513	NC_011146	CTC	2	6	4542744	4542749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11514	NC_011146	CTC	2	6	4548656	4548661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_011146	CTC	2	6	4549289	4549294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11516	NC_011146	GA	3	6	4549376	4549381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_011146	CCTTTT	2	12	4549474	4549485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_011146	AGAGGG	2	12	4549532	4549543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_011146	GA	3	6	4549550	4549555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_011146	CGC	2	6	4549580	4549585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_011146	CTC	2	6	4552071	4552076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_011146	T	6	6	4552139	4552144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_011146	AGTC	2	8	4552156	4552163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11524	NC_011146	AGA	2	6	4552168	4552173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_011146	T	9	9	4552222	4552230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_011146	GCA	2	6	4552345	4552350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_011146	GCG	2	6	4552364	4552369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_011146	AAG	2	6	4552374	4552379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_011146	CCG	2	6	4552387	4552392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_011146	AG	3	6	4552463	4552468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_011146	A	6	6	4552765	4552770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_011146	T	7	7	4552798	4552804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_011146	C	6	6	4552839	4552844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11534	NC_011146	GCA	2	6	4553290	4553295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_011146	ATTTT	2	10	4553345	4553354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_011146	GGA	2	6	4553360	4553365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_011146	T	6	6	4553926	4553931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_011146	GTT	2	6	4553932	4553937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_011146	GCT	2	6	4553938	4553943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_011146	CCT	2	6	4554567	4554572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11541	NC_011146	GA	3	6	4554835	4554840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_011146	CGG	2	6	4557310	4557315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_011146	TAA	2	6	4557339	4557344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_011146	ATC	2	6	4557348	4557353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_011146	CAG	2	6	4557398	4557403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_011146	TGA	2	6	4558552	4558557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_011146	GTT	2	6	4558562	4558567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_011146	TCC	2	6	4558578	4558583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11549	NC_011146	CT	3	6	4558590	4558595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11550	NC_011146	ATT	2	6	4558616	4558621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_011146	ATCCCC	2	12	4560435	4560446	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11552	NC_011146	CG	3	6	4560483	4560488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11553	NC_011146	GGA	2	6	4560495	4560500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_011146	CGGC	2	8	4563763	4563770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_011146	TGC	2	6	4565975	4565980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_011146	A	7	7	4565997	4566003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_011146	T	6	6	4567293	4567298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_011146	ACA	2	6	4567348	4567353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_011146	GAA	2	6	4567386	4567391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_011146	AAAG	2	8	4567410	4567417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_011146	AGAGGG	2	12	4569320	4569331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_011146	AGGGGG	2	12	4569430	4569441	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_011146	AGA	2	6	4569473	4569478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_011146	GTG	2	6	4572949	4572954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_011146	GCC	2	6	4573019	4573024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_011146	TCG	2	6	4573027	4573032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_011146	A	8	8	4573085	4573092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_011146	CGGC	2	8	4573093	4573100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_011146	TGA	2	6	4574525	4574530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_011146	TCC	2	6	4574874	4574879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11571	NC_011146	C	7	7	4574902	4574908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11572	NC_011146	CCG	2	6	4574938	4574943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_011146	T	6	6	4576167	4576172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_011146	CCT	2	6	4577619	4577624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11575	NC_011146	CCT	2	6	4577668	4577673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_011146	CAAA	2	8	4577689	4577696	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11577	NC_011146	TTAT	2	8	4577697	4577704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_011146	GC	3	6	4577736	4577741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_011146	ATT	2	6	4577755	4577760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_011146	GA	4	8	4577814	4577821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_011146	GAAA	2	8	4578023	4578030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_011146	AAAC	2	8	4578084	4578091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_011146	CT	3	6	4578118	4578123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_011146	AGG	2	6	4578125	4578130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_011146	CCG	3	9	4579126	4579134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11586	NC_011146	AAAT	2	8	4579148	4579155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_011146	ATT	2	6	4579178	4579183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_011146	ATG	2	6	4579204	4579209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_011146	CG	3	6	4583027	4583032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11590	NC_011146	GGC	2	6	4584299	4584304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_011146	TC	3	6	4586179	4586184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11592	NC_011146	AAC	2	6	4587594	4587599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_011146	TGC	2	6	4587637	4587642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_011146	GCG	2	6	4587678	4587683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_011146	CTATAG	2	12	4587736	4587747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11596	NC_011146	GCA	2	6	4590899	4590904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_011146	AGC	2	6	4590929	4590934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_011146	GGCCC	2	10	4591111	4591120	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11599	NC_011146	GGAC	2	8	4596617	4596624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_011146	GCCTTC	2	12	4597089	4597100	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_011146	GTT	2	6	4597101	4597106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_011146	C	7	7	4597120	4597126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11603	NC_011146	AATTAA	2	12	4597127	4597138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_011146	GCA	2	6	4597208	4597213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_011146	ATT	2	6	4597216	4597221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_011146	GA	3	6	4597817	4597822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_011146	T	6	6	4599736	4599741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_011146	CTG	2	6	4600930	4600935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_011146	CT	3	6	4600956	4600961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11610	NC_011146	A	8	8	4600971	4600978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_011146	CAGCG	2	10	4601016	4601025	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11612	NC_011146	CTTTT	2	10	4601312	4601321	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11613	NC_011146	T	6	6	4601318	4601323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_011146	T	6	6	4601327	4601332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_011146	CTGG	2	8	4601429	4601436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_011146	TC	3	6	4602427	4602432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_011146	CAC	2	6	4602494	4602499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11618	NC_011146	GCC	2	6	4602506	4602511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11619	NC_011146	AGG	2	6	4602538	4602543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_011146	GAA	2	6	4603061	4603066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_011146	CAC	2	6	4603075	4603080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11622	NC_011146	GTG	2	6	4603182	4603187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_011146	ACAA	2	8	4603207	4603214	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11624	NC_011146	GCC	2	6	4603240	4603245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11625	NC_011146	TCC	2	6	4604513	4604518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11626	NC_011146	A	8	8	4605352	4605359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_011146	CCT	2	6	4606374	4606379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11628	NC_011146	AGCG	2	8	4606469	4606476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11629	NC_011146	A	7	7	4607782	4607788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_011146	ATT	2	6	4607827	4607832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11631	NC_011146	AG	3	6	4607883	4607888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11632	NC_011146	CGA	2	6	4607898	4607903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11633	NC_011146	T	6	6	4607913	4607918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11634	NC_011146	TATC	2	8	4607961	4607968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11635	NC_011146	CAG	2	6	4607978	4607983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11636	NC_011146	AGA	2	6	4607984	4607989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11637	NC_011146	CGT	2	6	4608051	4608056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11638	NC_011146	TAAA	2	8	4608067	4608074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11639	NC_011146	ATT	2	6	4608281	4608286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11640	NC_011146	AAC	2	6	4610946	4610951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11641	NC_011146	CACC	2	8	4610975	4610982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11642	NC_011146	C	6	6	4610981	4610986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11643	NC_011146	AGGG	2	8	4611002	4611009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11644	NC_011146	GGT	2	6	4611025	4611030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11645	NC_011146	A	7	7	4611032	4611038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11646	NC_011146	CCCCT	2	10	4611116	4611125	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11647	NC_011146	AAAC	2	8	4611260	4611267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11648	NC_011146	AC	3	6	4611296	4611301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11649	NC_011146	AT	3	6	4611304	4611309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...12131415161718192021222324Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.