MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017456	CACC	2	8	1486563	1486570	25 %	0 %	0 %	75 %	385802134
26003	NC_017456	GAA	2	6	1486603	1486608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802134
26004	NC_017456	AGAGA	2	10	1486616	1486625	60 %	0 %	40 %	0 %	385802134
26005	NC_017456	TTGC	2	8	1486686	1486693	0 %	50 %	25 %	25 %	385802134
26006	NC_017456	AAC	2	6	1486703	1486708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802134
26007	NC_017456	GCA	2	6	1486750	1486755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802134
26008	NC_017456	AAC	2	6	1486763	1486768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802134
26009	NC_017456	AGCA	2	8	1486817	1486824	50 %	0 %	25 %	25 %	385802134
26010	NC_017456	T	6	6	1486854	1486859	0 %	100 %	0 %	0 %	385802134
26011	NC_017456	CAC	2	6	1486861	1486866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802134
26012	NC_017456	TAT	2	6	1486954	1486959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802134
26013	NC_017456	TGC	2	6	1487064	1487069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802135
26014	NC_017456	TCT	2	6	1487082	1487087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802135
26015	NC_017456	CAC	2	6	1487273	1487278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802135
26016	NC_017456	GAGGAA	2	12	1487600	1487611	50 %	0 %	50 %	0 %	385802135
26017	NC_017456	A	6	6	1487662	1487667	100 %	0 %	0 %	0 %	385802135
26018	NC_017456	ATTTG	2	10	1487812	1487821	20 %	60 %	20 %	0 %	385802135
26019	NC_017456	AGA	2	6	1487865	1487870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802135
26020	NC_017456	ATT	2	6	1487877	1487882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802135
26021	NC_017456	GAA	2	6	1487896	1487901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802135
26022	NC_017456	TTC	2	6	1487943	1487948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802135
26023	NC_017456	T	7	7	1488051	1488057	0 %	100 %	0 %	0 %	385802135
26024	NC_017456	AGA	2	6	1488393	1488398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802135
26025	NC_017456	GTAACT	2	12	1489086	1489097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385802136
26026	NC_017456	GCA	2	6	1489143	1489148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26027	NC_017456	CTT	2	6	1489163	1489168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802136
26028	NC_017456	CAT	2	6	1489196	1489201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802136
26029	NC_017456	CAA	2	6	1489249	1489254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802136
26030	NC_017456	ACG	2	6	1489286	1489291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26031	NC_017456	GAACGC	2	12	1489333	1489344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26032	NC_017456	TAA	2	6	1489348	1489353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802136
26033	NC_017456	CTT	2	6	1489355	1489360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802136
26034	NC_017456	CCAAA	2	10	1489423	1489432	60 %	0 %	0 %	40 %	385802136
26035	NC_017456	GCA	2	6	1489551	1489556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26036	NC_017456	CTT	2	6	1489576	1489581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802136
26037	NC_017456	GAA	2	6	1489590	1489595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802136
26038	NC_017456	CAG	2	6	1489612	1489617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26039	NC_017456	CAG	2	6	1489621	1489626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26040	NC_017456	TCT	2	6	1489671	1489676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802136
26041	NC_017456	ACA	2	6	1489680	1489685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802136
26042	NC_017456	GCA	2	6	1489692	1489697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26043	NC_017456	GCA	2	6	1489716	1489721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802136
26044	NC_017456	GTCA	2	8	1489793	1489800	25 %	25 %	25 %	25 %	385802136
26045	NC_017456	GAG	2	6	1489949	1489954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385802137
26046	NC_017456	TCA	2	6	1489972	1489977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802137
26047	NC_017456	CTT	2	6	1490022	1490027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802137
26048	NC_017456	GCC	2	6	1490336	1490341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802138
26049	NC_017456	TCA	2	6	1490463	1490468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802138
26050	NC_017456	GAC	2	6	1490490	1490495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26051	NC_017456	AGT	2	6	1490535	1490540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802138
26052	NC_017456	CGA	2	6	1490631	1490636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26053	NC_017456	CCA	2	6	1490679	1490684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802138
26054	NC_017456	GCT	2	6	1490697	1490702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26055	NC_017456	GCG	2	6	1490773	1490778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802138
26056	NC_017456	CCAA	2	8	1490786	1490793	50 %	0 %	0 %	50 %	385802138
26057	NC_017456	AGC	2	6	1490841	1490846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26058	NC_017456	ACG	2	6	1490881	1490886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26059	NC_017456	CGT	2	6	1490896	1490901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26060	NC_017456	TCG	2	6	1490922	1490927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802138
26061	NC_017456	CG	3	6	1490969	1490974	0 %	0 %	50 %	50 %	385802138
26062	NC_017456	AAT	2	6	1491026	1491031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802138
26063	NC_017456	CGTG	2	8	1491038	1491045	0 %	25 %	50 %	25 %	385802138
26064	NC_017456	GCC	2	6	1491054	1491059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802138
26065	NC_017456	ACAGGC	2	12	1491108	1491119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802138
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26067	NC_017456	GCC	2	6	1491233	1491238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802138
26068	NC_017456	ACA	2	6	1491246	1491251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802138
26069	NC_017456	GC	3	6	1491296	1491301	0 %	0 %	50 %	50 %	385802138
26070	NC_017456	AGCCGT	2	12	1491329	1491340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385802138
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26072	NC_017456	GCG	2	6	1491369	1491374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802138
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26074	NC_017456	GCG	2	6	1491397	1491402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802138
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26083	NC_017456	CAG	2	6	1492265	1492270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802139
26084	NC_017456	CAG	2	6	1492272	1492277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802139
26085	NC_017456	GCTT	2	8	1492278	1492285	0 %	50 %	25 %	25 %	385802139
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26088	NC_017456	AAT	2	6	1492323	1492328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802139
26089	NC_017456	TCT	2	6	1492365	1492370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802139
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26095	NC_017456	CGT	2	6	1492742	1492747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802139
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26098	NC_017456	TTGC	2	8	1492931	1492938	0 %	50 %	25 %	25 %	385802139
26099	NC_017456	AGT	2	6	1492975	1492980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802139
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26102	NC_017456	CAC	2	6	1493207	1493212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802140
26103	NC_017456	GTC	2	6	1493241	1493246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802140
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26105	NC_017456	CAT	2	6	1493289	1493294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802140
26106	NC_017456	TC	3	6	1493299	1493304	0 %	50 %	0 %	50 %	385802140
26107	NC_017456	CATC	2	8	1493318	1493325	25 %	25 %	0 %	50 %	385802140
26108	NC_017456	CG	3	6	1493410	1493415	0 %	0 %	50 %	50 %	385802140
26109	NC_017456	CTG	2	6	1493447	1493452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802140
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26112	NC_017456	TCG	2	6	1493593	1493598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802140
26113	NC_017456	GTTT	2	8	1493607	1493614	0 %	75 %	25 %	0 %	385802140
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26115	NC_017456	CAT	2	6	1493717	1493722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802140
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26462	NC_017456	TAC	2	6	1513257	1513262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802154
26463	NC_017456	A	6	6	1513287	1513292	100 %	0 %	0 %	0 %	385802154
26464	NC_017456	GC	3	6	1513373	1513378	0 %	0 %	50 %	50 %	385802154
26465	NC_017456	ATT	2	6	1513597	1513602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802154
26466	NC_017456	TCA	2	6	1513792	1513797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802155
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26468	NC_017456	AGC	2	6	1513842	1513847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802155
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26472	NC_017456	T	7	7	1514033	1514039	0 %	100 %	0 %	0 %	385802155
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26487	NC_017456	CGT	2	6	1514738	1514743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802156
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26490	NC_017456	TATGC	2	10	1514908	1514917	20 %	40 %	20 %	20 %	385802156
26491	NC_017456	T	6	6	1514920	1514925	0 %	100 %	0 %	0 %	385802156
26492	NC_017456	TCT	2	6	1514999	1515004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802156
26493	NC_017456	ACA	3	9	1515076	1515084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802156
26494	NC_017456	CG	3	6	1515086	1515091	0 %	0 %	50 %	50 %	385802156
26495	NC_017456	ATA	2	6	1515096	1515101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802156
26496	NC_017456	T	6	6	1515236	1515241	0 %	100 %	0 %	0 %	385802156
26497	NC_017456	CTG	2	6	1515386	1515391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802156
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26500	NC_017456	TGT	2	6	1515539	1515544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802156

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