MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25004	NC_017456	GAT	2	6	1434437	1434442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802091
25005	NC_017456	GAA	2	6	1434556	1434561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802091
25006	NC_017456	GAT	2	6	1434592	1434597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802091
25007	NC_017456	GGTT	2	8	1434603	1434610	0 %	50 %	50 %	0 %	385802091
25008	NC_017456	ATT	2	6	1434642	1434647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802091
25009	NC_017456	AAT	2	6	1434650	1434655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802091
25010	NC_017456	CTT	2	6	1434737	1434742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802091
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25017	NC_017456	AGC	3	9	1434945	1434953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802092
25018	NC_017456	CAA	2	6	1435046	1435051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802092
25019	NC_017456	CAT	2	6	1435125	1435130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802092
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25021	NC_017456	GT	3	6	1435192	1435197	0 %	50 %	50 %	0 %	385802092
25022	NC_017456	ACT	2	6	1435198	1435203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802092
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25113	NC_017456	T	6	6	1439430	1439435	0 %	100 %	0 %	0 %	385802096
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25232	NC_017456	CAG	3	9	1445171	1445179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802100
25233	NC_017456	AGC	2	6	1445184	1445189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802100
25234	NC_017456	CAG	2	6	1445231	1445236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802100
25235	NC_017456	TTCCTT	2	12	1445238	1445249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802100
25236	NC_017456	GCA	2	6	1445257	1445262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802100
25237	NC_017456	GTA	2	6	1445266	1445271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802100
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25241	NC_017456	AGCATC	2	12	1445382	1445393	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385802100
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25345	NC_017456	ACG	2	6	1450164	1450169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802104
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25347	NC_017456	CA	3	6	1450316	1450321	50 %	0 %	0 %	50 %	385802104
25348	NC_017456	CCAAG	2	10	1450348	1450357	40 %	0 %	20 %	40 %	385802104
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25354	NC_017456	TGC	2	6	1450529	1450534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802104
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25363	NC_017456	GCA	2	6	1450922	1450927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802105
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25374	NC_017456	TCG	2	6	1451495	1451500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802105
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25454	NC_017456	CTGC	2	8	1455639	1455646	0 %	25 %	25 %	50 %	385802110
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25460	NC_017456	TGC	2	6	1455806	1455811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802110
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25462	NC_017456	CGCGC	2	10	1455874	1455883	0 %	0 %	40 %	60 %	385802110
25463	NC_017456	GTC	2	6	1455901	1455906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802110
25464	NC_017456	ATT	2	6	1455931	1455936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802110
25465	NC_017456	TTG	2	6	1455975	1455980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802110
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25467	NC_017456	CG	3	6	1456325	1456330	0 %	0 %	50 %	50 %	385802111
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25489	NC_017456	GCT	2	6	1457430	1457435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802112
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25491	NC_017456	GC	3	6	1457536	1457541	0 %	0 %	50 %	50 %	385802112
25492	NC_017456	GACCAA	2	12	1457542	1457553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385802112
25493	NC_017456	ATC	2	6	1457607	1457612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802112
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