MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017456	GAC	2	6	1376391	1376396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802043
24003	NC_017456	GCT	2	6	1376469	1376474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802043
24004	NC_017456	TGC	2	6	1376492	1376497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802043
24005	NC_017456	GC	3	6	1376540	1376545	0 %	0 %	50 %	50 %	385802043
24006	NC_017456	CG	3	6	1377158	1377163	0 %	0 %	50 %	50 %	385802044
24007	NC_017456	AGGT	2	8	1377181	1377188	25 %	25 %	50 %	0 %	385802044
24008	NC_017456	CTT	2	6	1377203	1377208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802044
24009	NC_017456	CCTCTG	2	12	1377209	1377220	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385802044
24010	NC_017456	GCT	2	6	1377228	1377233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802044
24011	NC_017456	CAA	2	6	1377279	1377284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802044
24012	NC_017456	ACA	2	6	1377395	1377400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802044
24013	NC_017456	GC	4	8	1377416	1377423	0 %	0 %	50 %	50 %	385802044
24014	NC_017456	CAC	2	6	1377478	1377483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802044
24015	NC_017456	TC	3	6	1377578	1377583	0 %	50 %	0 %	50 %	385802044
24016	NC_017456	T	6	6	1377694	1377699	0 %	100 %	0 %	0 %	385802044
24017	NC_017456	ATG	2	6	1377757	1377762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802044
24018	NC_017456	CAT	2	6	1377789	1377794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802044
24019	NC_017456	AAG	2	6	1377821	1377826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802044
24020	NC_017456	AGC	2	6	1377838	1377843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802044
24021	NC_017456	TCT	2	6	1378013	1378018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802044
24022	NC_017456	CTA	2	6	1378035	1378040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802044
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24024	NC_017456	TGC	3	9	1378123	1378131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802044
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24031	NC_017456	CAT	2	6	1378470	1378475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802044
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24033	NC_017456	GTC	2	6	1378574	1378579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802044
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24035	NC_017456	TCAAAA	2	12	1378646	1378657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385802044
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24038	NC_017456	T	6	6	1378852	1378857	0 %	100 %	0 %	0 %	385802044
24039	NC_017456	TTA	2	6	1378868	1378873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802044
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24042	NC_017456	CAG	2	6	1378902	1378907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802044
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24051	NC_017456	TAA	2	6	1379579	1379584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802045
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24054	NC_017456	AGAA	2	8	1379838	1379845	75 %	0 %	25 %	0 %	385802045
24055	NC_017456	CAC	2	6	1379864	1379869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802045
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24116	NC_017456	ACA	2	6	1383445	1383450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802050
24117	NC_017456	AAG	2	6	1383557	1383562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802050
24118	NC_017456	T	6	6	1383570	1383575	0 %	100 %	0 %	0 %	385802050
24119	NC_017456	ATAC	2	8	1383597	1383604	50 %	25 %	0 %	25 %	385802050
24120	NC_017456	TAC	2	6	1383714	1383719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802050
24121	NC_017456	CAA	2	6	1383731	1383736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802050
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24123	NC_017456	GTAT	2	8	1383889	1383896	25 %	50 %	25 %	0 %	385802051
24124	NC_017456	TAC	2	6	1383941	1383946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802051
24125	NC_017456	CAT	2	6	1383954	1383959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802051
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24127	NC_017456	TTGA	2	8	1384027	1384034	25 %	50 %	25 %	0 %	385802052
24128	NC_017456	TCT	2	6	1384040	1384045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802052
24129	NC_017456	CAA	2	6	1384057	1384062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802052
24130	NC_017456	ATAA	2	8	1384078	1384085	75 %	25 %	0 %	0 %	385802052
24131	NC_017456	ATAACC	2	12	1384100	1384111	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385802052
24132	NC_017456	CGC	2	6	1384129	1384134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802052
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24141	NC_017456	TGC	2	6	1384800	1384805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802053
24142	NC_017456	CTT	2	6	1384902	1384907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802053
24143	NC_017456	CTT	2	6	1385034	1385039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802053
24144	NC_017456	GAT	2	6	1385080	1385085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802053
24145	NC_017456	TTGG	2	8	1385092	1385099	0 %	50 %	50 %	0 %	385802053
24146	NC_017456	GCT	2	6	1385186	1385191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802053
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24152	NC_017456	TTC	2	6	1385394	1385399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802053
24153	NC_017456	TGC	2	6	1385400	1385405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802053
24154	NC_017456	TACTTC	2	12	1385460	1385471	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385802053
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24217	NC_017456	TCG	2	6	1388947	1388952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802056
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24224	NC_017456	ATT	2	6	1389401	1389406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802057
24225	NC_017456	A	7	7	1389422	1389428	100 %	0 %	0 %	0 %	385802057
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24229	NC_017456	CAA	2	6	1389614	1389619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802057
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24231	NC_017456	TTG	2	6	1389675	1389680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802057
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24469	NC_017456	CAG	2	6	1403574	1403579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802068
24470	NC_017456	CAA	2	6	1403670	1403675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802068
24471	NC_017456	TTTA	2	8	1403732	1403739	25 %	75 %	0 %	0 %	385802069
24472	NC_017456	AGC	2	6	1403752	1403757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802069
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24480	NC_017456	CGTG	2	8	1404198	1404205	0 %	25 %	50 %	25 %	385802069
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24488	NC_017456	TAG	2	6	1404779	1404784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802070
24489	NC_017456	GTA	2	6	1404789	1404794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802070
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24491	NC_017456	TTC	2	6	1404930	1404935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802070
24492	NC_017456	TCAA	2	8	1404988	1404995	50 %	25 %	0 %	25 %	385802070
24493	NC_017456	CTG	2	6	1405002	1405007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802070
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24495	NC_017456	TATC	2	8	1405030	1405037	25 %	50 %	0 %	25 %	385802070
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24497	NC_017456	AGA	2	6	1405156	1405161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802070
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24500	NC_017456	GTT	2	6	1405223	1405228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802070

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