MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_017456	TGC	2	6	1322057	1322062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802007
23003	NC_017456	AG	3	6	1322070	1322075	50 %	0 %	50 %	0 %	385802007
23004	NC_017456	CAT	2	6	1322214	1322219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802007
23005	NC_017456	ATTA	2	8	1322280	1322287	50 %	50 %	0 %	0 %	385802007
23006	NC_017456	AAG	2	6	1322299	1322304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802007
23007	NC_017456	TGC	2	6	1322312	1322317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802007
23008	NC_017456	AAC	2	6	1322331	1322336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802007
23009	NC_017456	TAGA	2	8	1322422	1322429	50 %	25 %	25 %	0 %	385802007
23010	NC_017456	AGA	2	6	1322474	1322479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802007
23011	NC_017456	ATA	2	6	1322499	1322504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802007
23012	NC_017456	AAG	2	6	1322698	1322703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802007
23013	NC_017456	CAG	3	9	1322719	1322727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802007
23014	NC_017456	CA	3	6	1322780	1322785	50 %	0 %	0 %	50 %	385802007
23015	NC_017456	GAT	2	6	1322787	1322792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802007
23016	NC_017456	CTT	2	6	1323022	1323027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802008
23017	NC_017456	ACC	2	6	1323144	1323149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802008
23018	NC_017456	AGT	2	6	1323203	1323208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802008
23019	NC_017456	CA	3	6	1323232	1323237	50 %	0 %	0 %	50 %	385802008
23020	NC_017456	CGA	2	6	1323255	1323260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802008
23021	NC_017456	TA	3	6	1323389	1323394	50 %	50 %	0 %	0 %	385802009
23022	NC_017456	T	6	6	1323405	1323410	0 %	100 %	0 %	0 %	385802009
23023	NC_017456	AATA	2	8	1323445	1323452	75 %	25 %	0 %	0 %	385802009
23024	NC_017456	GTT	2	6	1323497	1323502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802009
23025	NC_017456	AT	3	6	1323505	1323510	50 %	50 %	0 %	0 %	385802009
23026	NC_017456	ACA	2	6	1323527	1323532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802009
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23028	NC_017456	ATCCA	2	10	1323569	1323578	40 %	20 %	0 %	40 %	385802009
23029	NC_017456	ATC	2	6	1323628	1323633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802010
23030	NC_017456	CTG	2	6	1323672	1323677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802010
23031	NC_017456	ATT	2	6	1323685	1323690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802010
23032	NC_017456	TTTG	2	8	1323733	1323740	0 %	75 %	25 %	0 %	385802010
23033	NC_017456	CTG	2	6	1323819	1323824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802010
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23036	NC_017456	CAA	2	6	1323864	1323869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802010
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23039	NC_017456	TA	3	6	1323957	1323962	50 %	50 %	0 %	0 %	385802010
23040	NC_017456	ACA	2	6	1324205	1324210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802011
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23055	NC_017456	CA	3	6	1324802	1324807	50 %	0 %	0 %	50 %	385802011
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23059	NC_017456	ATT	2	6	1325142	1325147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802012
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23062	NC_017456	AG	3	6	1325259	1325264	50 %	0 %	50 %	0 %	385802012
23063	NC_017456	CTC	2	6	1325360	1325365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802012
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23098	NC_017456	CA	3	6	1326987	1326992	50 %	0 %	0 %	50 %	385802014
23099	NC_017456	CA	3	6	1327009	1327014	50 %	0 %	0 %	50 %	385802014
23100	NC_017456	AAGC	2	8	1327058	1327065	50 %	0 %	25 %	25 %	385802014
23101	NC_017456	T	6	6	1327104	1327109	0 %	100 %	0 %	0 %	385802014
23102	NC_017456	GAA	2	6	1327168	1327173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802014
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23107	NC_017456	CAACC	2	10	1327263	1327272	40 %	0 %	0 %	60 %	385802014
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23114	NC_017456	GAA	2	6	1327705	1327710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802014
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23116	NC_017456	AGA	2	6	1327917	1327922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802015
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23230	NC_017456	AT	3	6	1334102	1334107	50 %	50 %	0 %	0 %	385802018
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