MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_017456	CAG	2	6	1237016	1237021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801949
21503	NC_017456	TAA	2	6	1237025	1237030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801949
21504	NC_017456	GAT	2	6	1237056	1237061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801949
21505	NC_017456	CTG	2	6	1237085	1237090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801949
21506	NC_017456	ACG	2	6	1237093	1237098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801949
21507	NC_017456	AAG	2	6	1237115	1237120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801949
21508	NC_017456	TAGT	2	8	1237186	1237193	25 %	50 %	25 %	0 %	385801949
21509	NC_017456	AGA	2	6	1237199	1237204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801949
21510	NC_017456	ACA	2	6	1237300	1237305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801949
21511	NC_017456	AGA	2	6	1237349	1237354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801949
21512	NC_017456	CAA	2	6	1237362	1237367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801949
21513	NC_017456	CCA	2	6	1237414	1237419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801949
21514	NC_017456	CAG	2	6	1237523	1237528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801949
21515	NC_017456	AAGG	2	8	1237626	1237633	50 %	0 %	50 %	0 %	385801949
21516	NC_017456	CAG	2	6	1237655	1237660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801949
21517	NC_017456	AAT	2	6	1237677	1237682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801949
21518	NC_017456	AGA	2	6	1237706	1237711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801949
21519	NC_017456	TA	3	6	1237807	1237812	50 %	50 %	0 %	0 %	385801949
21520	NC_017456	AAT	2	6	1237833	1237838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801949
21521	NC_017456	TAA	2	6	1237850	1237855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801949
21522	NC_017456	CAA	2	6	1237953	1237958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801949
21523	NC_017456	ATA	2	6	1238041	1238046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801949
21524	NC_017456	CAGC	2	8	1238154	1238161	25 %	0 %	25 %	50 %	385801950
21525	NC_017456	GCAACA	2	12	1238355	1238366	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385801950
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21527	NC_017456	GTAA	2	8	1238501	1238508	50 %	25 %	25 %	0 %	385801950
21528	NC_017456	GAATA	2	10	1238564	1238573	60 %	20 %	20 %	0 %	385801950
21529	NC_017456	GCA	2	6	1238577	1238582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801950
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21531	NC_017456	GCA	3	9	1238703	1238711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801950
21532	NC_017456	AAT	2	6	1238774	1238779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801950
21533	NC_017456	TCT	2	6	1238799	1238804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801950
21534	NC_017456	GAG	2	6	1238812	1238817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801950
21535	NC_017456	ATCAAG	2	12	1239083	1239094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385801950
21536	NC_017456	CTT	2	6	1239101	1239106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801950
21537	NC_017456	GAC	2	6	1239543	1239548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801951
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21539	NC_017456	CGT	2	6	1239720	1239725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801951
21540	NC_017456	ATC	2	6	1239746	1239751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801951
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21542	NC_017456	CAA	2	6	1239781	1239786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801951
21543	NC_017456	GC	3	6	1239825	1239830	0 %	0 %	50 %	50 %	385801951
21544	NC_017456	GCA	2	6	1239995	1240000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801951
21545	NC_017456	GC	3	6	1240027	1240032	0 %	0 %	50 %	50 %	385801951
21546	NC_017456	AAC	2	6	1240189	1240194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801951
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21549	NC_017456	ACG	2	6	1240333	1240338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801951
21550	NC_017456	CTT	2	6	1240355	1240360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801951
21551	NC_017456	TCA	2	6	1240385	1240390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801951
21552	NC_017456	GCC	2	6	1240585	1240590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801951
21553	NC_017456	GTC	2	6	1240639	1240644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801951
21554	NC_017456	CTG	2	6	1240719	1240724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801951
21555	NC_017456	TAA	2	6	1240776	1240781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801951
21556	NC_017456	TTG	2	6	1240822	1240827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801951
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21559	NC_017456	TCA	2	6	1241033	1241038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801952
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21565	NC_017456	TTA	2	6	1241204	1241209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801952
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21569	NC_017456	TCT	2	6	1241447	1241452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801952
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21588	NC_017456	TTC	2	6	1242395	1242400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801953
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21598	NC_017456	GGAT	2	8	1243233	1243240	25 %	25 %	50 %	0 %	385801953
21599	NC_017456	TAGT	2	8	1243278	1243285	25 %	50 %	25 %	0 %	385801953
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21601	NC_017456	AT	3	6	1243336	1243341	50 %	50 %	0 %	0 %	385801953
21602	NC_017456	AAG	2	6	1243430	1243435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801953
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21606	NC_017456	CTT	2	6	1243723	1243728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801953
21607	NC_017456	CG	3	6	1243777	1243782	0 %	0 %	50 %	50 %	385801953
21608	NC_017456	TCA	2	6	1243806	1243811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801953
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21611	NC_017456	T	6	6	1243870	1243875	0 %	100 %	0 %	0 %	385801953
21612	NC_017456	ATT	2	6	1243899	1243904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801953
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