MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_017456	CCA	2	6	1210286	1210291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801926
21003	NC_017456	GAA	2	6	1210328	1210333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801926
21004	NC_017456	T	7	7	1210366	1210372	0 %	100 %	0 %	0 %	385801926
21005	NC_017456	CTT	2	6	1210386	1210391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801926
21006	NC_017456	AAC	2	6	1210444	1210449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801926
21007	NC_017456	ATT	2	6	1210514	1210519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801926
21008	NC_017456	ACC	2	6	1210582	1210587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801926
21009	NC_017456	CA	3	6	1210718	1210723	50 %	0 %	0 %	50 %	385801927
21010	NC_017456	GAT	2	6	1210746	1210751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801927
21011	NC_017456	CAA	2	6	1210761	1210766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801927
21012	NC_017456	GCT	2	6	1210851	1210856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801927
21013	NC_017456	TGCT	2	8	1210933	1210940	0 %	50 %	25 %	25 %	385801927
21014	NC_017456	CAT	3	9	1210945	1210953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801927
21015	NC_017456	AAG	2	6	1210968	1210973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801927
21016	NC_017456	GGC	2	6	1211075	1211080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801927
21017	NC_017456	CGA	2	6	1211129	1211134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801927
21018	NC_017456	GAT	2	6	1211142	1211147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801927
21019	NC_017456	TAA	2	6	1211151	1211156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801927
21020	NC_017456	AAG	2	6	1211341	1211346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801927
21021	NC_017456	TTG	2	6	1211422	1211427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801927
21022	NC_017456	TTC	2	6	1211569	1211574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801927
21023	NC_017456	AGA	2	6	1211790	1211795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801928
21024	NC_017456	AGA	2	6	1211813	1211818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801928
21025	NC_017456	TGA	2	6	1211840	1211845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801928
21026	NC_017456	AGC	2	6	1211934	1211939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801928
21027	NC_017456	AGA	2	6	1212011	1212016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801928
21028	NC_017456	ACTT	2	8	1212021	1212028	25 %	50 %	0 %	25 %	385801928
21029	NC_017456	CAA	2	6	1212128	1212133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801928
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21031	NC_017456	A	7	7	1212367	1212373	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21032	NC_017456	TTG	2	6	1212401	1212406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801929
21033	NC_017456	CTT	2	6	1212475	1212480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801929
21034	NC_017456	A	6	6	1212529	1212534	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21035	NC_017456	A	6	6	1212613	1212618	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21036	NC_017456	TTAT	2	8	1212632	1212639	25 %	75 %	0 %	0 %	385801929
21037	NC_017456	CAA	2	6	1212749	1212754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801929
21038	NC_017456	TTA	2	6	1212755	1212760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801929
21039	NC_017456	A	6	6	1212811	1212816	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21040	NC_017456	GTT	3	9	1212817	1212825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801929
21041	NC_017456	A	6	6	1212898	1212903	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21042	NC_017456	GAA	2	6	1212944	1212949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801929
21043	NC_017456	GTT	2	6	1213027	1213032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801929
21044	NC_017456	GGA	2	6	1213039	1213044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801929
21045	NC_017456	AGA	2	6	1213053	1213058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801929
21046	NC_017456	TAGC	2	8	1213073	1213080	25 %	25 %	25 %	25 %	385801929
21047	NC_017456	CTAC	2	8	1213101	1213108	25 %	25 %	0 %	50 %	385801929
21048	NC_017456	AC	3	6	1213122	1213127	50 %	0 %	0 %	50 %	385801929
21049	NC_017456	ACT	2	6	1213157	1213162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801929
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21051	NC_017456	ATT	2	6	1213267	1213272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801929
21052	NC_017456	AGA	2	6	1213305	1213310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801929
21053	NC_017456	GAA	2	6	1213348	1213353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801929
21054	NC_017456	AGCA	2	8	1213355	1213362	50 %	0 %	25 %	25 %	385801929
21055	NC_017456	AAGC	2	8	1213411	1213418	50 %	0 %	25 %	25 %	385801929
21056	NC_017456	A	6	6	1213477	1213482	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21057	NC_017456	GCT	2	6	1213486	1213491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801929
21058	NC_017456	A	6	6	1213496	1213501	100 %	0 %	0 %	0 %	385801929
21059	NC_017456	AGC	2	6	1213703	1213708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801930
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21061	NC_017456	CTG	2	6	1213790	1213795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801930
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21070	NC_017456	CAG	2	6	1214077	1214082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801930
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21088	NC_017456	A	6	6	1214955	1214960	100 %	0 %	0 %	0 %	385801931
21089	NC_017456	TAA	2	6	1215003	1215008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801931
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21091	NC_017456	CAGC	2	8	1215182	1215189	25 %	0 %	25 %	50 %	385801931
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21098	NC_017456	CAG	2	6	1215405	1215410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801931
21099	NC_017456	CTG	2	6	1215546	1215551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801931
21100	NC_017456	TTC	2	6	1215553	1215558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801931
21101	NC_017456	CAAG	2	8	1215575	1215582	50 %	0 %	25 %	25 %	385801931
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21105	NC_017456	ATC	2	6	1215656	1215661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801931
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21107	NC_017456	CAA	2	6	1215962	1215967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801932
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21109	NC_017456	CCA	2	6	1216152	1216157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801932
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21112	NC_017456	AGA	2	6	1216278	1216283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801932
21113	NC_017456	TAG	2	6	1216352	1216357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801932
21114	NC_017456	CTG	2	6	1216396	1216401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801932
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21230	NC_017456	GC	3	6	1222964	1222969	0 %	0 %	50 %	50 %	385801939
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21457	NC_017456	TGC	2	6	1233956	1233961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801948
21458	NC_017456	CG	3	6	1234000	1234005	0 %	0 %	50 %	50 %	385801948
21459	NC_017456	AGAT	2	8	1234034	1234041	50 %	25 %	25 %	0 %	385801948
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