MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017456	ATC	2	6	1100291	1100296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801848
19003	NC_017456	CTT	2	6	1100386	1100391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801848
19004	NC_017456	ATC	2	6	1100528	1100533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801848
19005	NC_017456	AGA	2	6	1100537	1100542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801848
19006	NC_017456	GTT	2	6	1100615	1100620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801848
19007	NC_017456	CAAG	2	8	1100626	1100633	50 %	0 %	25 %	25 %	385801848
19008	NC_017456	CAA	3	9	1100677	1100685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801848
19009	NC_017456	AGC	2	6	1100735	1100740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801848
19010	NC_017456	GCT	2	6	1100748	1100753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801848
19011	NC_017456	ACA	2	6	1100820	1100825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801848
19012	NC_017456	AGCTAA	2	12	1100915	1100926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385801848
19013	NC_017456	AAG	2	6	1100932	1100937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801848
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19015	NC_017456	A	6	6	1101057	1101062	100 %	0 %	0 %	0 %	385801849
19016	NC_017456	A	6	6	1101077	1101082	100 %	0 %	0 %	0 %	385801849
19017	NC_017456	AGA	2	6	1101263	1101268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801850
19018	NC_017456	ATT	2	6	1101277	1101282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801850
19019	NC_017456	TCT	2	6	1101337	1101342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801850
19020	NC_017456	CTC	2	6	1101395	1101400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801850
19021	NC_017456	AGT	2	6	1101420	1101425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801850
19022	NC_017456	GTTG	2	8	1101456	1101463	0 %	50 %	50 %	0 %	385801850
19023	NC_017456	CTG	2	6	1101497	1101502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801850
19024	NC_017456	AGA	2	6	1101504	1101509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801850
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19027	NC_017456	CAAC	2	8	1101692	1101699	50 %	0 %	0 %	50 %	385801850
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19031	NC_017456	GCT	2	6	1101826	1101831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801850
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19033	NC_017456	GCT	2	6	1101865	1101870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801850
19034	NC_017456	GCT	2	6	1101949	1101954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801850
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19051	NC_017456	CAA	2	6	1103005	1103010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801851
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19099	NC_017456	TGC	2	6	1105904	1105909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801853
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19103	NC_017456	CAT	2	6	1106271	1106276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801853
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19106	NC_017456	CAG	2	6	1106398	1106403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801853
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19113	NC_017456	TAT	2	6	1106945	1106950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801854
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19116	NC_017456	GACG	2	8	1107099	1107106	25 %	0 %	50 %	25 %	385801854
19117	NC_017456	TCA	2	6	1107170	1107175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801854
19118	NC_017456	GAT	2	6	1107198	1107203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801854
19119	NC_017456	TGT	2	6	1107215	1107220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801854
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19224	NC_017456	GCA	2	6	1114210	1114215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801860
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19230	NC_017456	GC	3	6	1114477	1114482	0 %	0 %	50 %	50 %	385801860
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19461	NC_017456	TTGT	2	8	1126725	1126732	0 %	75 %	25 %	0 %	385801867
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19465	NC_017456	AT	3	6	1126856	1126861	50 %	50 %	0 %	0 %	385801867
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