MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017456	AAC	2	6	822824	822829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801634
14002	NC_017456	TG	3	6	822889	822894	0 %	50 %	50 %	0 %	385801634
14003	NC_017456	ACA	2	6	822921	822926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801634
14004	NC_017456	TCGC	2	8	822981	822988	0 %	25 %	25 %	50 %	385801634
14005	NC_017456	AGAA	2	8	823022	823029	75 %	0 %	25 %	0 %	385801634
14006	NC_017456	GCT	2	6	823068	823073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801634
14007	NC_017456	GGT	2	6	823074	823079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801634
14008	NC_017456	TGCGG	2	10	823091	823100	0 %	20 %	60 %	20 %	385801634
14009	NC_017456	TGT	2	6	823115	823120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801634
14010	NC_017456	TGC	2	6	823181	823186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801634
14011	NC_017456	TAT	2	6	823228	823233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801634
14012	NC_017456	AAT	2	6	823337	823342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801634
14013	NC_017456	TCC	2	6	823418	823423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801634
14014	NC_017456	A	6	6	823432	823437	100 %	0 %	0 %	0 %	385801634
14015	NC_017456	AAT	2	6	823518	823523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801634
14016	NC_017456	T	7	7	823567	823573	0 %	100 %	0 %	0 %	385801634
14017	NC_017456	TTA	2	6	823582	823587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801634
14018	NC_017456	GTA	2	6	823633	823638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801634
14019	NC_017456	AAT	2	6	824041	824046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14020	NC_017456	TAA	2	6	824214	824219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14021	NC_017456	TAC	2	6	824233	824238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801635
14022	NC_017456	TAA	2	6	824262	824267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14023	NC_017456	TTC	2	6	824313	824318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801635
14024	NC_017456	TGC	2	6	824431	824436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801635
14025	NC_017456	GTT	2	6	824516	824521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801635
14026	NC_017456	GT	3	6	824531	824536	0 %	50 %	50 %	0 %	385801635
14027	NC_017456	T	6	6	824536	824541	0 %	100 %	0 %	0 %	385801635
14028	NC_017456	A	7	7	824749	824755	100 %	0 %	0 %	0 %	385801635
14029	NC_017456	GCAAAA	2	12	824790	824801	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385801635
14030	NC_017456	TCT	2	6	824939	824944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801635
14031	NC_017456	TGG	2	6	824950	824955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801635
14032	NC_017456	AT	3	6	824974	824979	50 %	50 %	0 %	0 %	385801635
14033	NC_017456	CAG	2	6	825035	825040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801635
14034	NC_017456	TTC	2	6	825052	825057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801635
14035	NC_017456	AAG	2	6	825155	825160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801635
14036	NC_017456	ATT	2	6	825200	825205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801635
14037	NC_017456	A	7	7	825212	825218	100 %	0 %	0 %	0 %	385801635
14038	NC_017456	TTC	2	6	825247	825252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801635
14039	NC_017456	AGT	2	6	825310	825315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801635
14040	NC_017456	AAT	2	6	825356	825361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14041	NC_017456	GCAAAA	2	12	825371	825382	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385801635
14042	NC_017456	CAT	2	6	825414	825419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801635
14043	NC_017456	TGT	2	6	825511	825516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801635
14044	NC_017456	ATC	2	6	825528	825533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801635
14045	NC_017456	AAT	2	6	825569	825574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14046	NC_017456	ACT	2	6	825597	825602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801635
14047	NC_017456	CTT	2	6	825679	825684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801635
14048	NC_017456	TA	3	6	825728	825733	50 %	50 %	0 %	0 %	385801635
14049	NC_017456	CCT	2	6	825776	825781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801635
14050	NC_017456	ATCT	2	8	825830	825837	25 %	50 %	0 %	25 %	385801635
14051	NC_017456	TAA	2	6	825865	825870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801635
14052	NC_017456	ATT	2	6	825892	825897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801635
14053	NC_017456	GTT	2	6	826083	826088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801636
14054	NC_017456	CGT	2	6	826103	826108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14055	NC_017456	GAA	2	6	826141	826146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801636
14056	NC_017456	AAG	2	6	826149	826154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801636
14057	NC_017456	TTC	2	6	826164	826169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801636
14058	NC_017456	ATA	2	6	826188	826193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801636
14059	NC_017456	GAA	2	6	826382	826387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801636
14060	NC_017456	TCG	2	6	826555	826560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14061	NC_017456	GCC	2	6	826593	826598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801636
14062	NC_017456	CGT	2	6	826619	826624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14063	NC_017456	TTC	2	6	826716	826721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801636
14064	NC_017456	AAC	2	6	826725	826730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801636
14065	NC_017456	GAT	2	6	826754	826759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801636
14066	NC_017456	CGA	2	6	826760	826765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14067	NC_017456	CTG	2	6	826787	826792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14068	NC_017456	CAG	2	6	826826	826831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14069	NC_017456	TAA	2	6	826847	826852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801636
14070	NC_017456	AGG	2	6	826916	826921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801636
14071	NC_017456	T	6	6	826951	826956	0 %	100 %	0 %	0 %	385801636
14072	NC_017456	TTTG	2	8	826992	826999	0 %	75 %	25 %	0 %	385801636
14073	NC_017456	CAA	2	6	827036	827041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801636
14074	NC_017456	TAA	2	6	827108	827113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801636
14075	NC_017456	CTG	2	6	827159	827164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801636
14076	NC_017456	CTT	2	6	827195	827200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801636
14077	NC_017456	ACT	2	6	827260	827265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801636
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14079	NC_017456	AAT	2	6	827379	827384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801637
14080	NC_017456	TTTGC	2	10	827428	827437	0 %	60 %	20 %	20 %	385801637
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14083	NC_017456	CCG	2	6	827614	827619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801637
14084	NC_017456	TAA	2	6	827642	827647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801637
14085	NC_017456	AAG	2	6	827700	827705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801637
14086	NC_017456	GCC	2	6	827724	827729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801637
14087	NC_017456	CTT	2	6	827765	827770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801637
14088	NC_017456	CAAA	2	8	827771	827778	75 %	0 %	0 %	25 %	385801637
14089	NC_017456	AG	3	6	827791	827796	50 %	0 %	50 %	0 %	385801637
14090	NC_017456	TGAA	2	8	827805	827812	50 %	25 %	25 %	0 %	385801637
14091	NC_017456	GAA	2	6	827818	827823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801637
14092	NC_017456	CAA	2	6	827867	827872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801637
14093	NC_017456	CAG	2	6	827948	827953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801637
14094	NC_017456	CGC	2	6	827957	827962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801637
14095	NC_017456	GAA	2	6	828063	828068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801637
14096	NC_017456	CAAT	2	8	828118	828125	50 %	25 %	0 %	25 %	385801637
14097	NC_017456	TCA	2	6	828146	828151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801637
14098	NC_017456	CAAAT	2	10	828228	828237	60 %	20 %	0 %	20 %	385801637
14099	NC_017456	GCC	2	6	828240	828245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801637
14100	NC_017456	CCG	2	6	828250	828255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801637
14101	NC_017456	ACG	2	6	828306	828311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801637
14102	NC_017456	TAC	2	6	828312	828317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801637
14103	NC_017456	TA	3	6	828450	828455	50 %	50 %	0 %	0 %	385801638
14104	NC_017456	CTT	2	6	828490	828495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801638
14105	NC_017456	TTC	2	6	828509	828514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801638
14106	NC_017456	TTC	2	6	828536	828541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801638
14107	NC_017456	AC	3	6	828588	828593	50 %	0 %	0 %	50 %	385801638
14108	NC_017456	T	6	6	828615	828620	0 %	100 %	0 %	0 %	385801638
14109	NC_017456	CTA	2	6	828634	828639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801638
14110	NC_017456	TTC	2	6	828692	828697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801638
14111	NC_017456	TGC	2	6	828710	828715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801638
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14113	NC_017456	AGA	2	6	828776	828781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801638
14114	NC_017456	ATAACG	2	12	828870	828881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385801638
14115	NC_017456	CAG	2	6	828907	828912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801638
14116	NC_017456	GTTG	2	8	828951	828958	0 %	50 %	50 %	0 %	385801638
14117	NC_017456	GTGC	2	8	828966	828973	0 %	25 %	50 %	25 %	385801638
14118	NC_017456	AATC	2	8	828989	828996	50 %	25 %	0 %	25 %	385801638
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14480	NC_017456	TGT	2	6	849137	849142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801653
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14482	NC_017456	GCT	2	6	849240	849245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801653
14483	NC_017456	TGG	2	6	849260	849265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801653
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