MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017456	TTG	2	6	575845	575850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801428
10002	NC_017456	AGC	2	6	575865	575870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801428
10003	NC_017456	CACC	2	8	575915	575922	25 %	0 %	0 %	75 %	385801428
10004	NC_017456	ACA	2	6	575987	575992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801428
10005	NC_017456	TAA	2	6	576056	576061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801428
10006	NC_017456	ATTGT	2	10	576077	576086	20 %	60 %	20 %	0 %	385801428
10007	NC_017456	TGC	2	6	576088	576093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801428
10008	NC_017456	AGAA	2	8	576117	576124	75 %	0 %	25 %	0 %	385801428
10009	NC_017456	TGT	2	6	576132	576137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801428
10010	NC_017456	TCA	2	6	576152	576157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801428
10011	NC_017456	CAA	2	6	576176	576181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801428
10012	NC_017456	CAA	2	6	576443	576448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801428
10013	NC_017456	TGC	2	6	576454	576459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801428
10014	NC_017456	ACT	3	9	576586	576594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801428
10015	NC_017456	TGAA	2	8	576617	576624	50 %	25 %	25 %	0 %	385801428
10016	NC_017456	GCA	2	6	576634	576639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801428
10017	NC_017456	ATC	2	6	576651	576656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801428
10018	NC_017456	CT	3	6	576662	576667	0 %	50 %	0 %	50 %	385801428
10019	NC_017456	T	6	6	576693	576698	0 %	100 %	0 %	0 %	385801428
10020	NC_017456	ACT	2	6	576720	576725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801429
10021	NC_017456	CA	3	6	576776	576781	50 %	0 %	0 %	50 %	385801429
10022	NC_017456	CAC	2	6	576786	576791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801429
10023	NC_017456	ATA	3	9	576820	576828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801429
10024	NC_017456	GCT	2	6	576935	576940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801429
10025	NC_017456	CCG	2	6	576986	576991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801429
10026	NC_017456	ATC	2	6	577057	577062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801429
10027	NC_017456	ATG	2	6	577107	577112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801429
10028	NC_017456	ATT	2	6	577114	577119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801429
10029	NC_017456	CTT	2	6	577172	577177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801429
10030	NC_017456	CTA	2	6	577229	577234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801429
10031	NC_017456	TCA	2	6	577286	577291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801429
10032	NC_017456	GT	3	6	577308	577313	0 %	50 %	50 %	0 %	385801429
10033	NC_017456	AT	3	6	577329	577334	50 %	50 %	0 %	0 %	385801429
10034	NC_017456	ATT	2	6	577360	577365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801429
10035	NC_017456	TAAA	2	8	577395	577402	75 %	25 %	0 %	0 %	385801429
10036	NC_017456	AGC	2	6	577405	577410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801429
10037	NC_017456	AAC	2	6	577414	577419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801429
10038	NC_017456	ATT	2	6	577436	577441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801429
10039	NC_017456	ATA	2	6	577451	577456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801429
10040	NC_017456	GAA	2	6	578363	578368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801430
10041	NC_017456	AG	3	6	578441	578446	50 %	0 %	50 %	0 %	385801430
10042	NC_017456	TAC	2	6	578450	578455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801430
10043	NC_017456	CTA	2	6	578475	578480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801430
10044	NC_017456	CTG	2	6	578484	578489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801430
10045	NC_017456	AGA	2	6	578518	578523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801430
10046	NC_017456	AT	3	6	578524	578529	50 %	50 %	0 %	0 %	385801430
10047	NC_017456	GAT	2	6	578570	578575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801430
10048	NC_017456	TGC	2	6	578584	578589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801430
10049	NC_017456	TGA	2	6	578692	578697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801430
10050	NC_017456	TTA	2	6	578706	578711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801430
10051	NC_017456	AGA	2	6	578737	578742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801430
10052	NC_017456	TCAG	2	8	578818	578825	25 %	25 %	25 %	25 %	385801430
10053	NC_017456	CTG	2	6	578853	578858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801430
10054	NC_017456	A	9	9	578910	578918	100 %	0 %	0 %	0 %	385801430
10055	NC_017456	TCA	2	6	579232	579237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801431
10056	NC_017456	TGA	2	6	579278	579283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801431
10057	NC_017456	CAGT	2	8	579340	579347	25 %	25 %	25 %	25 %	385801431
10058	NC_017456	GAA	2	6	579407	579412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801431
10059	NC_017456	TCT	2	6	579529	579534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801432
10060	NC_017456	AGA	2	6	579573	579578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801432
10061	NC_017456	ACT	2	6	579592	579597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801432
10062	NC_017456	AGGA	2	8	579611	579618	50 %	0 %	50 %	0 %	385801432
10063	NC_017456	CGG	2	6	579620	579625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801432
10064	NC_017456	GTG	2	6	579633	579638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801432
10065	NC_017456	CTT	2	6	579658	579663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801432
10066	NC_017456	CCGT	2	8	579666	579673	0 %	25 %	25 %	50 %	385801432
10067	NC_017456	ATCCT	2	10	579782	579791	20 %	40 %	0 %	40 %	385801432
10068	NC_017456	ATT	2	6	579856	579861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801432
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10070	NC_017456	AGGCGA	2	12	580119	580130	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385801432
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10072	NC_017456	GAA	2	6	580258	580263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801432
10073	NC_017456	TGA	2	6	580299	580304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801432
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10075	NC_017456	TAAAT	2	10	580642	580651	60 %	40 %	0 %	0 %	385801433
10076	NC_017456	CGG	2	6	580723	580728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801433
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10080	NC_017456	GCT	2	6	580859	580864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801433
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10085	NC_017456	A	6	6	581097	581102	100 %	0 %	0 %	0 %	385801433
10086	NC_017456	CGG	2	6	581122	581127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801433
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10088	NC_017456	AGA	2	6	581161	581166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801433
10089	NC_017456	TGA	2	6	581167	581172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801433
10090	NC_017456	CTT	2	6	581250	581255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801434
10091	NC_017456	AGA	2	6	581320	581325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801434
10092	NC_017456	GAT	2	6	581493	581498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801435
10093	NC_017456	TTA	2	6	581851	581856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801435
10094	NC_017456	CTGC	2	8	581864	581871	0 %	25 %	25 %	50 %	385801435
10095	NC_017456	GAA	2	6	581899	581904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801435
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10100	NC_017456	CTTGG	2	10	582638	582647	0 %	40 %	40 %	20 %	385801435
10101	NC_017456	GGC	2	6	582804	582809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801435
10102	NC_017456	TTG	2	6	582877	582882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801435
10103	NC_017456	ATC	2	6	582893	582898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801435
10104	NC_017456	TGG	2	6	582921	582926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801435
10105	NC_017456	GT	3	6	582950	582955	0 %	50 %	50 %	0 %	385801435
10106	NC_017456	AC	3	6	582978	582983	50 %	0 %	0 %	50 %	385801435
10107	NC_017456	ATC	2	6	583017	583022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801435
10108	NC_017456	GAA	2	6	583068	583073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801435
10109	NC_017456	TGG	2	6	583082	583087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801435
10110	NC_017456	CTA	2	6	583117	583122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801435
10111	NC_017456	A	6	6	583122	583127	100 %	0 %	0 %	0 %	385801435
10112	NC_017456	ATCGT	2	10	583228	583237	20 %	40 %	20 %	20 %	385801435
10113	NC_017456	ATG	2	6	583249	583254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801435
10114	NC_017456	GT	3	6	583296	583301	0 %	50 %	50 %	0 %	385801435
10115	NC_017456	GAA	2	6	583312	583317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801435
10116	NC_017456	CAC	2	6	583318	583323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801435
10117	NC_017456	A	6	6	583377	583382	100 %	0 %	0 %	0 %	385801435
10118	NC_017456	A	7	7	583387	583393	100 %	0 %	0 %	0 %	385801435
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10120	NC_017456	AATC	2	8	583838	583845	50 %	25 %	0 %	25 %	385801436
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10124	NC_017456	GAA	2	6	584432	584437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801437
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10231	NC_017456	TGA	2	6	591189	591194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801442
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10233	NC_017456	GAAT	2	8	591215	591222	50 %	25 %	25 %	0 %	385801442
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10479	NC_017456	ACGA	2	8	605763	605770	50 %	0 %	25 %	25 %	385801461
10480	NC_017456	TTG	2	6	605884	605889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801461
10481	NC_017456	TG	3	6	605917	605922	0 %	50 %	50 %	0 %	385801461
10482	NC_017456	A	6	6	606128	606133	100 %	0 %	0 %	0 %	385801461
10483	NC_017456	TCTT	2	8	606153	606160	0 %	75 %	0 %	25 %	385801461
10484	NC_017456	GTATC	2	10	606223	606232	20 %	40 %	20 %	20 %	385801461
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10486	NC_017456	ATC	2	6	606435	606440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801461
10487	NC_017456	TC	3	6	606565	606570	0 %	50 %	0 %	50 %	385801461
10488	NC_017456	GGC	2	6	606684	606689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801461
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10492	NC_017456	CAGG	3	12	607041	607052	25 %	0 %	50 %	25 %	385801462
10493	NC_017456	CAAA	2	8	607131	607138	75 %	0 %	0 %	25 %	385801462
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10497	NC_017456	CA	3	6	607343	607348	50 %	0 %	0 %	50 %	385801462
10498	NC_017456	GAT	2	6	607367	607372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801462
10499	NC_017456	AAC	2	6	607427	607432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801462
10500	NC_017456	AAAC	2	8	607521	607528	75 %	0 %	0 %	25 %	385801462

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