MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 29867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_017456	TGC	2	6	462092	462097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801323
8003	NC_017456	A	8	8	462692	462699	100 %	0 %	0 %	0 %	385801324
8004	NC_017456	CAA	2	6	462705	462710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801324
8005	NC_017456	TA	3	6	462931	462936	50 %	50 %	0 %	0 %	385801324
8006	NC_017456	TGA	2	6	462965	462970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801324
8007	NC_017456	TTC	2	6	462971	462976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801324
8008	NC_017456	TGA	2	6	462998	463003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801324
8009	NC_017456	TAAT	2	8	463015	463022	50 %	50 %	0 %	0 %	385801324
8010	NC_017456	GCTT	2	8	463093	463100	0 %	50 %	25 %	25 %	385801324
8011	NC_017456	AGA	2	6	463177	463182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801325
8012	NC_017456	TGTT	2	8	463208	463215	0 %	75 %	25 %	0 %	385801325
8013	NC_017456	GGT	2	6	463280	463285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801325
8014	NC_017456	GTG	2	6	463290	463295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801325
8015	NC_017456	TAA	2	6	463317	463322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801325
8016	NC_017456	ATA	2	6	463346	463351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801325
8017	NC_017456	TTA	2	6	463387	463392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801325
8018	NC_017456	AAAG	2	8	463418	463425	75 %	0 %	25 %	0 %	385801325
8019	NC_017456	TGA	2	6	463474	463479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801325
8020	NC_017456	A	6	6	463490	463495	100 %	0 %	0 %	0 %	385801325
8021	NC_017456	TAG	2	6	463540	463545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801325
8022	NC_017456	CAA	2	6	463599	463604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801325
8023	NC_017456	ATC	2	6	463692	463697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801325
8024	NC_017456	TAG	2	6	463719	463724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801325
8025	NC_017456	TTG	2	6	463730	463735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801325
8026	NC_017456	TA	3	6	463795	463800	50 %	50 %	0 %	0 %	385801325
8027	NC_017456	TGATTC	2	12	463801	463812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385801325
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8029	NC_017456	CAG	2	6	463836	463841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801325
8030	NC_017456	TGA	2	6	463882	463887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801325
8031	NC_017456	TGAA	2	8	463920	463927	50 %	25 %	25 %	0 %	385801325
8032	NC_017456	GATA	2	8	463939	463946	50 %	25 %	25 %	0 %	385801325
8033	NC_017456	AAC	2	6	464505	464510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801326
8034	NC_017456	ATG	2	6	464642	464647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801326
8035	NC_017456	GTC	2	6	464682	464687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801326
8036	NC_017456	AGT	2	6	464706	464711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801326
8037	NC_017456	CAT	2	6	464747	464752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801326
8038	NC_017456	AAATC	2	10	464788	464797	60 %	20 %	0 %	20 %	385801326
8039	NC_017456	GC	3	6	464845	464850	0 %	0 %	50 %	50 %	385801326
8040	NC_017456	AAGCTT	2	12	464868	464879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385801326
8041	NC_017456	GCA	2	6	464950	464955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801326
8042	NC_017456	CAT	3	9	464966	464974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801326
8043	NC_017456	TCG	2	6	465172	465177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801326
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8047	NC_017456	AAGC	2	8	465503	465510	50 %	0 %	25 %	25 %	385801327
8048	NC_017456	AAC	2	6	465533	465538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801327
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8052	NC_017456	GCT	2	6	465837	465842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801327
8053	NC_017456	CAT	2	6	465856	465861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801327
8054	NC_017456	CAA	2	6	465889	465894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801327
8055	NC_017456	T	6	6	465962	465967	0 %	100 %	0 %	0 %	385801327
8056	NC_017456	AAT	2	6	466242	466247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801328
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8065	NC_017456	TGT	2	6	466661	466666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801328
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8070	NC_017456	CGT	3	9	466943	466951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801328
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8105	NC_017456	GCA	2	6	469063	469068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801330
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8109	NC_017456	GC	3	6	469334	469339	0 %	0 %	50 %	50 %	385801332
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8115	NC_017456	TGGC	2	8	469573	469580	0 %	25 %	50 %	25 %	385801332
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