MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 136790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016906	CGG	2	6	556381	556386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716018
13002	NC_016906	CGT	2	6	556459	556464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13003	NC_016906	CGC	2	6	556465	556470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716019
13004	NC_016906	GAG	2	6	556475	556480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716019
13005	NC_016906	GCGG	2	8	556481	556488	0 %	0 %	75 %	25 %	378716019
13006	NC_016906	GTGG	2	8	556573	556580	0 %	25 %	75 %	0 %	378716019
13007	NC_016906	CGA	2	6	556627	556632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13008	NC_016906	GCT	3	9	556696	556704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13009	NC_016906	GCGG	2	8	556811	556818	0 %	0 %	75 %	25 %	378716019
13010	NC_016906	CGC	2	6	556836	556841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716019
13011	NC_016906	GC	3	6	556857	556862	0 %	0 %	50 %	50 %	378716019
13012	NC_016906	CGA	2	6	556906	556911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13013	NC_016906	CGT	2	6	556920	556925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13014	NC_016906	CGT	2	6	556960	556965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13015	NC_016906	CAC	2	6	556994	556999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716019
13016	NC_016906	CTG	2	6	557038	557043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13017	NC_016906	CAA	2	6	557078	557083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378716019
13018	NC_016906	GGT	2	6	557105	557110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716019
13019	NC_016906	GCC	2	6	557149	557154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716019
13020	NC_016906	GCC	2	6	557156	557161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716019
13021	NC_016906	GAC	2	6	557162	557167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13022	NC_016906	CAT	2	6	557191	557196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716019
13023	NC_016906	CGT	2	6	557217	557222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13024	NC_016906	CGG	2	6	557267	557272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716019
13025	NC_016906	TCG	2	6	557274	557279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716019
13026	NC_016906	GAG	2	6	557285	557290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716019
13027	NC_016906	ACT	2	6	557319	557324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716019
13028	NC_016906	CGG	2	6	557523	557528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716020
13029	NC_016906	CGA	2	6	557577	557582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716020
13030	NC_016906	GCC	2	6	557611	557616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716020
13031	NC_016906	CGC	2	6	557633	557638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716020
13032	NC_016906	CTA	2	6	557649	557654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716020
13033	NC_016906	TCG	2	6	557669	557674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716020
13034	NC_016906	TCT	2	6	557735	557740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378716020
13035	NC_016906	TCG	2	6	557798	557803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716020
13036	NC_016906	GAC	2	6	557812	557817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716020
13037	NC_016906	TGC	2	6	557840	557845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716020
13038	NC_016906	GCAG	2	8	557867	557874	25 %	0 %	50 %	25 %	378716020
13039	NC_016906	TCGC	2	8	557893	557900	0 %	25 %	25 %	50 %	378716020
13040	NC_016906	GGA	2	6	557929	557934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716020
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13042	NC_016906	CGC	2	6	557964	557969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716021
13043	NC_016906	CGGCC	2	10	558029	558038	0 %	0 %	40 %	60 %	378716021
13044	NC_016906	CAC	2	6	558066	558071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716021
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13046	NC_016906	CGG	3	9	558116	558124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716021
13047	NC_016906	GCT	2	6	558137	558142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716021
13048	NC_016906	CCG	2	6	558161	558166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716021
13049	NC_016906	CGA	2	6	558167	558172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716021
13050	NC_016906	CCA	2	6	558184	558189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716021
13051	NC_016906	TACG	2	8	558252	558259	25 %	25 %	25 %	25 %	378716021
13052	NC_016906	CTA	2	6	558311	558316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716021
13053	NC_016906	GACCC	2	10	558330	558339	20 %	0 %	20 %	60 %	378716021
13054	NC_016906	GAG	2	6	558348	558353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716021
13055	NC_016906	GGCG	2	8	558416	558423	0 %	0 %	75 %	25 %	378716021
13056	NC_016906	CGG	2	6	558435	558440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716021
13057	NC_016906	CGG	2	6	558445	558450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716021
13058	NC_016906	CGC	2	6	558461	558466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716021
13059	NC_016906	GTT	2	6	558485	558490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378716021
13060	NC_016906	CGG	2	6	558520	558525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716021
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13062	NC_016906	GTG	2	6	558546	558551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716021
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13064	NC_016906	GGCA	2	8	558643	558650	25 %	0 %	50 %	25 %	378716021
13065	NC_016906	TCG	2	6	558676	558681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716021
13066	NC_016906	CGACG	2	10	558710	558719	20 %	0 %	40 %	40 %	378716021
13067	NC_016906	CTGGC	2	10	558735	558744	0 %	20 %	40 %	40 %	378716021
13068	NC_016906	GAC	2	6	558759	558764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716021
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13087	NC_016906	CAA	2	6	559357	559362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378716022
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13089	NC_016906	GCT	2	6	559387	559392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716022
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13101	NC_016906	TCGCC	2	10	559776	559785	0 %	20 %	20 %	60 %	378716022
13102	NC_016906	ATC	2	6	559811	559816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716022
13103	NC_016906	CGG	2	6	559825	559830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716022
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13106	NC_016906	CGA	2	6	559907	559912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716023
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13112	NC_016906	GTT	2	6	560174	560179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378716023
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13114	NC_016906	CCGCGT	2	12	560203	560214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378716023
13115	NC_016906	CGT	2	6	560300	560305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716023
13116	NC_016906	CGA	2	6	560414	560419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716023
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13118	NC_016906	ACT	2	6	560520	560525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716024
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13120	NC_016906	TCG	2	6	560553	560558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716024
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13350	NC_016906	GC	3	6	569123	569128	0 %	0 %	50 %	50 %	378716030
13351	NC_016906	ATC	2	6	569134	569139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716030
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13355	NC_016906	ACG	2	6	569446	569451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716030
13356	NC_016906	GTC	2	6	569464	569469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716030
13357	NC_016906	TCG	2	6	569543	569548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716030
13358	NC_016906	TGA	2	6	569552	569557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378716030
13359	NC_016906	CGC	2	6	569658	569663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716030
13360	NC_016906	GCT	2	6	569664	569669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716030
13361	NC_016906	TCG	2	6	569699	569704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716030
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13369	NC_016906	TCG	2	6	570018	570023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716031
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13382	NC_016906	GC	3	6	570352	570357	0 %	0 %	50 %	50 %	378716031
13383	NC_016906	CGG	2	6	570369	570374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716031
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13460	NC_016906	CGGT	2	8	574533	574540	0 %	25 %	50 %	25 %	378716033
13461	NC_016906	ATCCG	2	10	574543	574552	20 %	20 %	20 %	40 %	378716033
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13464	NC_016906	GC	3	6	574591	574596	0 %	0 %	50 %	50 %	378716033
13465	NC_016906	GTCGA	2	10	574628	574637	20 %	20 %	40 %	20 %	378716033
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13467	NC_016906	CACCG	2	10	574717	574726	20 %	0 %	20 %	60 %	378716033
13468	NC_016906	GAC	2	6	574753	574758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716033
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13470	NC_016906	GCCGC	2	10	574925	574934	0 %	0 %	40 %	60 %	378716033
13471	NC_016906	GCCC	2	8	574943	574950	0 %	0 %	25 %	75 %	378716033
13472	NC_016906	GGTC	2	8	574954	574961	0 %	25 %	50 %	25 %	378716033
13473	NC_016906	GAT	2	6	574963	574968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378716033
13474	NC_016906	CGC	2	6	574969	574974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716033
13475	NC_016906	GTT	2	6	574978	574983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378716033
13476	NC_016906	CGCCA	2	10	575111	575120	20 %	0 %	20 %	60 %	378716033
13477	NC_016906	CGGC	2	8	575146	575153	0 %	0 %	50 %	50 %	378716033
13478	NC_016906	ACG	2	6	575191	575196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716033
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13481	NC_016906	ACCAC	2	10	575295	575304	40 %	0 %	0 %	60 %	378716033
13482	NC_016906	GGC	2	6	575489	575494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716034
13483	NC_016906	CGT	2	6	575497	575502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716034
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13485	NC_016906	ACG	2	6	575527	575532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716034
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13499	NC_016906	GCA	2	6	576036	576041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716034
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