MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_013721	TTAC	2	8	1539730	1539737	25 %	50 %	0 %	25 %	283783723
27503	NC_013721	TAA	2	6	1539792	1539797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783723
27504	NC_013721	AAG	2	6	1539813	1539818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783723
27505	NC_013721	CCA	2	6	1539833	1539838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783723
27506	NC_013721	AGC	2	6	1539884	1539889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783723
27507	NC_013721	CTT	2	6	1539892	1539897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783723
27508	NC_013721	ATC	2	6	1539908	1539913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783723
27509	NC_013721	AGGA	2	8	1539991	1539998	50 %	0 %	50 %	0 %	283783723
27510	NC_013721	TAAT	2	8	1540110	1540117	50 %	50 %	0 %	0 %	283783723
27511	NC_013721	TCA	2	6	1540164	1540169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783723
27512	NC_013721	AAT	2	6	1540183	1540188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783723
27513	NC_013721	CAT	2	6	1540207	1540212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783723
27514	NC_013721	TCA	2	6	1540218	1540223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783723
27515	NC_013721	CAA	2	6	1540323	1540328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783723
27516	NC_013721	AAT	2	6	1540343	1540348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783723
27517	NC_013721	CCA	2	6	1540415	1540420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783723
27518	NC_013721	GAA	2	6	1540454	1540459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783723
27519	NC_013721	AAT	2	6	1540480	1540485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783723
27520	NC_013721	AGAAAA	2	12	1540502	1540513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	283783723
27521	NC_013721	T	6	6	1540573	1540578	0 %	100 %	0 %	0 %	283783723
27522	NC_013721	AAC	3	9	1540606	1540614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783723
27523	NC_013721	CCG	2	6	1540617	1540622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783723
27524	NC_013721	TTA	2	6	1540631	1540636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783723
27525	NC_013721	AATA	2	8	1540866	1540873	75 %	25 %	0 %	0 %	283783724
27526	NC_013721	GAA	2	6	1540908	1540913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783724
27527	NC_013721	GCT	2	6	1540945	1540950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783724
27528	NC_013721	ATA	2	6	1541032	1541037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783724
27529	NC_013721	ATCA	2	8	1541097	1541104	50 %	25 %	0 %	25 %	283783724
27530	NC_013721	ACATCC	2	12	1541123	1541134	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	283783724
27531	NC_013721	CCAAAC	2	12	1541234	1541245	50 %	0 %	0 %	50 %	283783724
27532	NC_013721	AACCC	2	10	1541347	1541356	40 %	0 %	0 %	60 %	283783724
27533	NC_013721	CCAA	2	8	1541368	1541375	50 %	0 %	0 %	50 %	283783724
27534	NC_013721	ATAGG	2	10	1541416	1541425	40 %	20 %	40 %	0 %	283783724
27535	NC_013721	ACC	2	6	1541517	1541522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783724
27536	NC_013721	T	6	6	1541526	1541531	0 %	100 %	0 %	0 %	283783724
27537	NC_013721	GAA	2	6	1541636	1541641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783725
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27539	NC_013721	CTT	2	6	1541707	1541712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783725
27540	NC_013721	TGC	2	6	1541767	1541772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783725
27541	NC_013721	GCC	2	6	1541835	1541840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783725
27542	NC_013721	TTC	2	6	1541883	1541888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783725
27543	NC_013721	CGT	2	6	1541932	1541937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783725
27544	NC_013721	CTTTG	2	10	1541983	1541992	0 %	60 %	20 %	20 %	283783725
27545	NC_013721	TTTC	2	8	1542049	1542056	0 %	75 %	0 %	25 %	283783725
27546	NC_013721	TTTC	2	8	1542103	1542110	0 %	75 %	0 %	25 %	283783725
27547	NC_013721	AGCC	2	8	1542123	1542130	25 %	0 %	25 %	50 %	283783725
27548	NC_013721	CTTTGT	2	12	1542205	1542216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	283783725
27549	NC_013721	CG	3	6	1542247	1542252	0 %	0 %	50 %	50 %	283783725
27550	NC_013721	TGT	2	6	1542259	1542264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783725
27551	NC_013721	CTC	2	6	1542425	1542430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783725
27552	NC_013721	CTT	2	6	1542466	1542471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783725
27553	NC_013721	GTA	2	6	1542488	1542493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783725
27554	NC_013721	TACTT	2	10	1542525	1542534	20 %	60 %	0 %	20 %	283783725
27555	NC_013721	TGC	2	6	1542584	1542589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783725
27556	NC_013721	AAT	2	6	1542703	1542708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783725
27557	NC_013721	ACGTT	2	10	1542736	1542745	20 %	40 %	20 %	20 %	283783725
27558	NC_013721	TAC	2	6	1542793	1542798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783725
27559	NC_013721	GGT	2	6	1542850	1542855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783725
27560	NC_013721	T	6	6	1542902	1542907	0 %	100 %	0 %	0 %	283783725
27561	NC_013721	TGC	2	6	1542931	1542936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783725
27562	NC_013721	AGCA	2	8	1542953	1542960	50 %	0 %	25 %	25 %	283783725
27563	NC_013721	A	6	6	1543296	1543301	100 %	0 %	0 %	0 %	283783726
27564	NC_013721	CCCA	2	8	1543364	1543371	25 %	0 %	0 %	75 %	283783726
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27567	NC_013721	ACT	2	6	1543485	1543490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783726
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27574	NC_013721	GCA	2	6	1543759	1543764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783726
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27602	NC_013721	AGGA	2	8	1545700	1545707	50 %	0 %	50 %	0 %	283783728
27603	NC_013721	AATT	2	8	1545716	1545723	50 %	50 %	0 %	0 %	283783728
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