MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_013721	TTACC	2	10	1369753	1369762	20 %	40 %	0 %	40 %	283783613
24502	NC_013721	AAT	2	6	1369802	1369807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24503	NC_013721	AGA	2	6	1369925	1369930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783613
24504	NC_013721	ATC	2	6	1369937	1369942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783613
24505	NC_013721	AAT	2	6	1369961	1369966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24506	NC_013721	TAA	2	6	1370101	1370106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24507	NC_013721	AGT	2	6	1370126	1370131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783613
24508	NC_013721	TCG	2	6	1370181	1370186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24509	NC_013721	AAT	2	6	1370198	1370203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24510	NC_013721	TAC	2	6	1370222	1370227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783613
24511	NC_013721	CTG	2	6	1370266	1370271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24512	NC_013721	CAA	2	6	1370293	1370298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783613
24513	NC_013721	TAA	2	6	1370314	1370319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24514	NC_013721	CTT	3	9	1370470	1370478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783613
24515	NC_013721	TCG	2	6	1370523	1370528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24516	NC_013721	GTTA	2	8	1370594	1370601	25 %	50 %	25 %	0 %	283783613
24517	NC_013721	ACC	2	6	1370786	1370791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783613
24518	NC_013721	GAC	2	6	1370809	1370814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24519	NC_013721	GAA	2	6	1370879	1370884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783613
24520	NC_013721	GAG	2	6	1370929	1370934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783613
24521	NC_013721	ACG	2	6	1371041	1371046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24522	NC_013721	CGTCAA	2	12	1371067	1371078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	283783613
24523	NC_013721	ATA	2	6	1371165	1371170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24524	NC_013721	CAC	2	6	1371547	1371552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783613
24525	NC_013721	AAT	2	6	1371560	1371565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24526	NC_013721	TGCG	2	8	1371603	1371610	0 %	25 %	50 %	25 %	283783613
24527	NC_013721	CTCG	2	8	1371655	1371662	0 %	25 %	25 %	50 %	283783613
24528	NC_013721	GCC	2	6	1371665	1371670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783613
24529	NC_013721	AAT	2	6	1371671	1371676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783613
24530	NC_013721	GTGGC	2	10	1371824	1371833	0 %	20 %	60 %	20 %	283783613
24531	NC_013721	TCG	2	6	1371912	1371917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24532	NC_013721	TCT	2	6	1371960	1371965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783613
24533	NC_013721	CTT	2	6	1371974	1371979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783613
24534	NC_013721	GAG	2	6	1372028	1372033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283783613
24535	NC_013721	GTG	2	6	1372134	1372139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783613
24536	NC_013721	CAG	2	6	1372156	1372161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783613
24537	NC_013721	AAG	2	6	1373063	1373068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783614
24538	NC_013721	CAG	2	6	1373069	1373074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783614
24539	NC_013721	CA	3	6	1373099	1373104	50 %	0 %	0 %	50 %	283783614
24540	NC_013721	AGC	3	9	1373106	1373114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783614
24541	NC_013721	CAAAT	2	10	1373151	1373160	60 %	20 %	0 %	20 %	283783614
24542	NC_013721	CGA	2	6	1373232	1373237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783614
24543	NC_013721	GC	4	8	1373242	1373249	0 %	0 %	50 %	50 %	283783614
24544	NC_013721	CTC	2	6	1373261	1373266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783614
24545	NC_013721	GTT	2	6	1373428	1373433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783614
24546	NC_013721	ATT	2	6	1373482	1373487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783614
24547	NC_013721	CAA	2	6	1373767	1373772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783615
24548	NC_013721	TC	3	6	1373782	1373787	0 %	50 %	0 %	50 %	283783615
24549	NC_013721	GAA	2	6	1373791	1373796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783615
24550	NC_013721	GAA	2	6	1373806	1373811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783615
24551	NC_013721	CG	3	6	1373846	1373851	0 %	0 %	50 %	50 %	283783615
24552	NC_013721	T	6	6	1373864	1373869	0 %	100 %	0 %	0 %	283783615
24553	NC_013721	TG	4	8	1373931	1373938	0 %	50 %	50 %	0 %	283783615
24554	NC_013721	ATT	2	6	1374046	1374051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783615
24555	NC_013721	GTC	2	6	1374062	1374067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24556	NC_013721	CG	3	6	1374082	1374087	0 %	0 %	50 %	50 %	283783615
24557	NC_013721	CAA	2	6	1374119	1374124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783615
24558	NC_013721	GAA	2	6	1374154	1374159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783615
24559	NC_013721	TTGCC	2	10	1374164	1374173	0 %	40 %	20 %	40 %	283783615
24560	NC_013721	TGAT	2	8	1374236	1374243	25 %	50 %	25 %	0 %	283783615
24561	NC_013721	CGC	2	6	1374253	1374258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783615
24562	NC_013721	GC	3	6	1374267	1374272	0 %	0 %	50 %	50 %	283783615
24563	NC_013721	TGG	2	6	1374294	1374299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783615
24564	NC_013721	TGC	2	6	1374327	1374332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24565	NC_013721	AGA	2	6	1374345	1374350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783615
24566	NC_013721	CTG	2	6	1374362	1374367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24567	NC_013721	CTA	2	6	1374380	1374385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783615
24568	NC_013721	ACC	2	6	1374388	1374393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783615
24569	NC_013721	GCT	2	6	1374514	1374519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24570	NC_013721	GCC	2	6	1374536	1374541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783615
24571	NC_013721	CAG	2	6	1374553	1374558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24572	NC_013721	ATT	2	6	1374592	1374597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783615
24573	NC_013721	A	6	6	1374622	1374627	100 %	0 %	0 %	0 %	283783615
24574	NC_013721	CAG	2	6	1374628	1374633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783615
24575	NC_013721	CAA	2	6	1374654	1374659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783615
24576	NC_013721	CAC	2	6	1374902	1374907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283783616
24577	NC_013721	CGTA	2	8	1374975	1374982	25 %	25 %	25 %	25 %	283783616
24578	NC_013721	GCA	2	6	1374991	1374996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783616
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24583	NC_013721	TTA	2	6	1375076	1375081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783616
24584	NC_013721	CTA	2	6	1375220	1375225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783616
24585	NC_013721	GTTGA	2	10	1375255	1375264	20 %	40 %	40 %	0 %	283783616
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24587	NC_013721	TAG	2	6	1375341	1375346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783616
24588	NC_013721	GAA	2	6	1375348	1375353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783616
24589	NC_013721	AAGC	2	8	1375366	1375373	50 %	0 %	25 %	25 %	283783616
24590	NC_013721	ATA	2	6	1375382	1375387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783616
24591	NC_013721	ATA	2	6	1375397	1375402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783616
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24598	NC_013721	AAT	2	6	1376093	1376098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783617
24599	NC_013721	T	6	6	1376113	1376118	0 %	100 %	0 %	0 %	283783617
24600	NC_013721	AGC	2	6	1376254	1376259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783617
24601	NC_013721	GCA	3	9	1376268	1376276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783617
24602	NC_013721	GCC	2	6	1376348	1376353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283783617
24603	NC_013721	CTT	2	6	1376354	1376359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783617
24604	NC_013721	AGCG	2	8	1376378	1376385	25 %	0 %	50 %	25 %	283783617
24605	NC_013721	CAAC	2	8	1376530	1376537	50 %	0 %	0 %	50 %	283783617
24606	NC_013721	AGC	2	6	1376609	1376614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783617
24607	NC_013721	AAC	2	6	1376630	1376635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783617
24608	NC_013721	GTC	2	6	1376714	1376719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783617
24609	NC_013721	AGC	2	6	1376808	1376813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783617
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24611	NC_013721	CTG	2	6	1376923	1376928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783617
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24613	NC_013721	GT	3	6	1376985	1376990	0 %	50 %	50 %	0 %	283783617
24614	NC_013721	GCT	2	6	1376991	1376996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783617
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