MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013721	ATA	2	6	860457	860462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15503	NC_013721	TCA	2	6	860464	860469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783229
15504	NC_013721	TTCT	2	8	860490	860497	0 %	75 %	0 %	25 %	283783229
15505	NC_013721	TTG	2	6	860529	860534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783229
15506	NC_013721	TCA	2	6	860539	860544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783229
15507	NC_013721	AAT	2	6	860558	860563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15508	NC_013721	TAA	2	6	860581	860586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15509	NC_013721	AGAA	2	8	860683	860690	75 %	0 %	25 %	0 %	283783229
15510	NC_013721	TGT	2	6	860745	860750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783229
15511	NC_013721	GATTG	2	10	860771	860780	20 %	40 %	40 %	0 %	283783229
15512	NC_013721	TTGA	2	8	860825	860832	25 %	50 %	25 %	0 %	283783229
15513	NC_013721	GAA	2	6	860840	860845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783229
15514	NC_013721	TTG	2	6	860911	860916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783229
15515	NC_013721	TTTC	2	8	860953	860960	0 %	75 %	0 %	25 %	283783229
15516	NC_013721	ATA	2	6	860964	860969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15517	NC_013721	ATG	2	6	860985	860990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15518	NC_013721	CTT	2	6	861060	861065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783229
15519	NC_013721	TGC	2	6	861070	861075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283783229
15520	NC_013721	GAA	2	6	861099	861104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783229
15521	NC_013721	TTC	2	6	861113	861118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283783229
15522	NC_013721	CTGAA	2	10	861234	861243	40 %	20 %	20 %	20 %	283783229
15523	NC_013721	GCA	2	6	861262	861267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283783229
15524	NC_013721	ATGA	2	8	861281	861288	50 %	25 %	25 %	0 %	283783229
15525	NC_013721	ATG	2	6	861315	861320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15526	NC_013721	ATA	2	6	861324	861329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15527	NC_013721	TGGT	2	8	861390	861397	0 %	50 %	50 %	0 %	283783229
15528	NC_013721	A	6	6	861467	861472	100 %	0 %	0 %	0 %	283783229
15529	NC_013721	ATT	2	6	861479	861484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783229
15530	NC_013721	GAA	2	6	861527	861532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783229
15531	NC_013721	GGC	2	6	861547	861552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283783229
15532	NC_013721	TG	3	6	861627	861632	0 %	50 %	50 %	0 %	283783229
15533	NC_013721	GA	3	6	861652	861657	50 %	0 %	50 %	0 %	283783229
15534	NC_013721	AAT	2	6	861689	861694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15535	NC_013721	TACA	2	8	861706	861713	50 %	25 %	0 %	25 %	283783229
15536	NC_013721	ATG	2	6	861750	861755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15537	NC_013721	TTG	2	6	861816	861821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783229
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15539	NC_013721	GGT	2	6	861848	861853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783229
15540	NC_013721	GT	3	6	861907	861912	0 %	50 %	50 %	0 %	283783229
15541	NC_013721	TGA	2	6	861913	861918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15542	NC_013721	TGA	2	6	861925	861930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15543	NC_013721	AGTTAT	2	12	861934	861945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	283783229
15544	NC_013721	AAT	2	6	862036	862041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
15545	NC_013721	TGTTT	2	10	862087	862096	0 %	80 %	20 %	0 %	283783229
15546	NC_013721	TTA	2	6	862118	862123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783229
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15550	NC_013721	TTG	2	6	862496	862501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283783229
15551	NC_013721	TGA	2	6	862525	862530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15552	NC_013721	GTG	2	6	862557	862562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783229
15553	NC_013721	TGA	2	6	862645	862650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15554	NC_013721	TGA	2	6	862726	862731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783229
15555	NC_013721	ATA	2	6	862833	862838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783229
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15558	NC_013721	TGTA	2	8	862888	862895	25 %	50 %	25 %	0 %	283783229
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15562	NC_013721	GCAT	2	8	863028	863035	25 %	25 %	25 %	25 %	283783230
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15565	NC_013721	ATT	2	6	863180	863185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783230
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15569	NC_013721	ATA	2	6	863450	863455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783230
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15572	NC_013721	TGG	2	6	863586	863591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283783230
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15593	NC_013721	A	7	7	864582	864588	100 %	0 %	0 %	0 %	283783230
15594	NC_013721	A	7	7	864594	864600	100 %	0 %	0 %	0 %	283783230
15595	NC_013721	TAT	2	6	864621	864626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283783231
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15597	NC_013721	TGCT	2	8	864725	864732	0 %	50 %	25 %	25 %	283783231
15598	NC_013721	CA	3	6	864742	864747	50 %	0 %	0 %	50 %	283783231
15599	NC_013721	AGTC	2	8	864763	864770	25 %	25 %	25 %	25 %	283783231
15600	NC_013721	AT	3	6	864874	864879	50 %	50 %	0 %	0 %	283783231
15601	NC_013721	AAG	2	6	864993	864998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783231
15602	NC_013721	TGA	2	6	864999	865004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783231
15603	NC_013721	TAC	3	9	865072	865080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783231
15604	NC_013721	ACT	2	6	865098	865103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283783231
15605	NC_013721	CAA	2	6	865126	865131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283783231
15606	NC_013721	GATT	2	8	865134	865141	25 %	50 %	25 %	0 %	283783231
15607	NC_013721	TCC	2	6	865371	865376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283783232
15608	NC_013721	TGA	2	6	865392	865397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283783232
15609	NC_013721	CTAGAG	2	12	865436	865447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283783232
15610	NC_013721	AAG	2	6	865589	865594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283783232
15611	NC_013721	AAT	2	6	865621	865626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283783232
15612	NC_013721	TAAAAC	2	12	865635	865646	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	283783232
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