MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013721	CAT	2	6	352648	352653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782823
6502	NC_013721	GGA	2	6	352720	352725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782824
6503	NC_013721	CAA	2	6	352775	352780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782824
6504	NC_013721	TTA	2	6	352798	352803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782824
6505	NC_013721	TCG	2	6	352804	352809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782824
6506	NC_013721	ATT	2	6	352818	352823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782824
6507	NC_013721	TTC	2	6	352908	352913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782824
6508	NC_013721	GC	3	6	352920	352925	0 %	0 %	50 %	50 %	283782824
6509	NC_013721	GCA	2	6	352966	352971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782824
6510	NC_013721	TACA	2	8	352995	353002	50 %	25 %	0 %	25 %	283782824
6511	NC_013721	TTC	2	6	353046	353051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782824
6512	NC_013721	CAG	2	6	353229	353234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782824
6513	NC_013721	TTG	2	6	353268	353273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782824
6514	NC_013721	TACG	2	8	353298	353305	25 %	25 %	25 %	25 %	283782825
6515	NC_013721	CAA	2	6	353349	353354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782825
6516	NC_013721	CGC	2	6	353436	353441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782825
6517	NC_013721	CTT	2	6	353579	353584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782826
6518	NC_013721	AGC	2	6	353625	353630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782826
6519	NC_013721	AGCTTC	2	12	353661	353672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	283782826
6520	NC_013721	CGCCAA	2	12	353810	353821	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	283782826
6521	NC_013721	GC	3	6	353833	353838	0 %	0 %	50 %	50 %	283782826
6522	NC_013721	AATC	2	8	353843	353850	50 %	25 %	0 %	25 %	283782826
6523	NC_013721	GCT	2	6	353864	353869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782826
6524	NC_013721	TTG	2	6	353917	353922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782826
6525	NC_013721	CTT	2	6	353961	353966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782826
6526	NC_013721	TAT	2	6	354121	354126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782827
6527	NC_013721	GC	3	6	354131	354136	0 %	0 %	50 %	50 %	283782827
6528	NC_013721	TGC	2	6	354170	354175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782827
6529	NC_013721	GT	3	6	354226	354231	0 %	50 %	50 %	0 %	283782827
6530	NC_013721	T	6	6	354243	354248	0 %	100 %	0 %	0 %	283782827
6531	NC_013721	AGCG	2	8	354360	354367	25 %	0 %	50 %	25 %	283782827
6532	NC_013721	GGT	2	6	354376	354381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782827
6533	NC_013721	AGT	2	6	354488	354493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782827
6534	NC_013721	AGC	2	6	354533	354538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782827
6535	NC_013721	CCG	2	6	354708	354713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782827
6536	NC_013721	TTA	2	6	354714	354719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782827
6537	NC_013721	T	6	6	354783	354788	0 %	100 %	0 %	0 %	283782827
6538	NC_013721	T	6	6	354836	354841	0 %	100 %	0 %	0 %	283782827
6539	NC_013721	TAT	2	6	354851	354856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782827
6540	NC_013721	TCA	2	6	354895	354900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782827
6541	NC_013721	CGA	2	6	354938	354943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782827
6542	NC_013721	GCA	2	6	355097	355102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782827
6543	NC_013721	A	6	6	355113	355118	100 %	0 %	0 %	0 %	283782827
6544	NC_013721	CTG	2	6	355213	355218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782827
6545	NC_013721	AAG	2	6	355244	355249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782827
6546	NC_013721	ATC	2	6	355287	355292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782827
6547	NC_013721	GTT	2	6	355407	355412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782828
6548	NC_013721	TCG	2	6	355442	355447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782828
6549	NC_013721	TAG	2	6	355449	355454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782828
6550	NC_013721	CG	3	6	355480	355485	0 %	0 %	50 %	50 %	283782828
6551	NC_013721	CTT	3	9	355528	355536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782828
6552	NC_013721	GCC	2	6	355591	355596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782828
6553	NC_013721	TCA	2	6	355632	355637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782828
6554	NC_013721	CAG	2	6	355701	355706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782828
6555	NC_013721	CG	3	6	355714	355719	0 %	0 %	50 %	50 %	283782828
6556	NC_013721	AAT	2	6	355732	355737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782828
6557	NC_013721	GAG	2	6	355758	355763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782828
6558	NC_013721	AAT	2	6	355774	355779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782828
6559	NC_013721	CAT	2	6	355849	355854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782828
6560	NC_013721	CTT	2	6	355864	355869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782828
6561	NC_013721	A	6	6	355907	355912	100 %	0 %	0 %	0 %	283782828
6562	NC_013721	CCAAA	2	10	355917	355926	60 %	0 %	0 %	40 %	283782828
6563	NC_013721	GCA	2	6	355946	355951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782828
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6565	NC_013721	CAAA	2	8	356091	356098	75 %	0 %	0 %	25 %	283782828
6566	NC_013721	GCA	2	6	356132	356137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782828
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6569	NC_013721	CTT	2	6	356259	356264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782828
6570	NC_013721	AAT	2	6	356341	356346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782828
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6572	NC_013721	CG	3	6	356367	356372	0 %	0 %	50 %	50 %	283782828
6573	NC_013721	TAAT	2	8	356375	356382	50 %	50 %	0 %	0 %	283782828
6574	NC_013721	CG	3	6	356388	356393	0 %	0 %	50 %	50 %	283782828
6575	NC_013721	GC	3	6	356489	356494	0 %	0 %	50 %	50 %	283782828
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6588	NC_013721	GATT	2	8	357265	357272	25 %	50 %	25 %	0 %	283782829
6589	NC_013721	AT	3	6	357351	357356	50 %	50 %	0 %	0 %	283782829
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6602	NC_013721	CAG	2	6	357809	357814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782829
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6605	NC_013721	GC	3	6	357966	357971	0 %	0 %	50 %	50 %	283782829
6606	NC_013721	TAA	2	6	358238	358243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782829
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6985	NC_013721	GAA	2	6	381897	381902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782850
6986	NC_013721	CGT	2	6	382067	382072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782851
6987	NC_013721	CTG	2	6	382079	382084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782851
6988	NC_013721	TAA	2	6	382199	382204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782851
6989	NC_013721	AGC	2	6	382245	382250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782851
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6998	NC_013721	TACC	2	8	382742	382749	25 %	25 %	0 %	50 %	283782851
6999	NC_013721	AAG	2	6	382782	382787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782851
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