MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 chromosome

Total Repeats: 62177

< Previous12...113114115116117118119120121122123124125Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
62001	NC_012793	T	7	7	3455695	3455701	0 %	100 %	0 %	0 %	239828703
62002	NC_012793	GCT	2	6	3455720	3455725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828703
62003	NC_012793	GTC	3	9	3455738	3455746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828703
62004	NC_012793	ATA	2	6	3455960	3455965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828704
62005	NC_012793	TTC	4	12	3455975	3455986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828704
62006	NC_012793	CGC	2	6	3456001	3456006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828704
62007	NC_012793	CCA	2	6	3456013	3456018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828704
62008	NC_012793	GGTTTC	2	12	3456084	3456095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239828704
62009	NC_012793	CGC	2	6	3456101	3456106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828704
62010	NC_012793	AC	3	6	3456121	3456126	50 %	0 %	0 %	50 %	239828704
62011	NC_012793	CAA	2	6	3456173	3456178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828704
62012	NC_012793	CAA	2	6	3456248	3456253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828704
62013	NC_012793	CTT	2	6	3456265	3456270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828704
62014	NC_012793	CAG	2	6	3456281	3456286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828704
62015	NC_012793	TCG	2	6	3456304	3456309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828704
62016	NC_012793	TAA	2	6	3456469	3456474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828704
62017	NC_012793	GC	3	6	3456510	3456515	0 %	0 %	50 %	50 %	239828704
62018	NC_012793	AAT	2	6	3456533	3456538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828704
62019	NC_012793	ACA	2	6	3456567	3456572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828704
62020	NC_012793	TTC	2	6	3456614	3456619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828704
62021	NC_012793	T	6	6	3456622	3456627	0 %	100 %	0 %	0 %	239828704
62022	NC_012793	CTT	3	9	3456694	3456702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828704
62023	NC_012793	GA	3	6	3456757	3456762	50 %	0 %	50 %	0 %	239828704
62024	NC_012793	TTTG	2	8	3456867	3456874	0 %	75 %	25 %	0 %	239828705
62025	NC_012793	TCGT	2	8	3456905	3456912	0 %	50 %	25 %	25 %	239828705
62026	NC_012793	GCA	2	6	3456929	3456934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828705
62027	NC_012793	T	6	6	3456981	3456986	0 %	100 %	0 %	0 %	239828705
62028	NC_012793	TTC	2	6	3456999	3457004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828705
62029	NC_012793	GGC	2	6	3457014	3457019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239828705
62030	NC_012793	T	7	7	3457134	3457140	0 %	100 %	0 %	0 %	239828705
62031	NC_012793	GCT	2	6	3457198	3457203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828705
62032	NC_012793	A	7	7	3457371	3457377	100 %	0 %	0 %	0 %	239828705
62033	NC_012793	CATTC	2	10	3457430	3457439	20 %	40 %	0 %	40 %	239828705
62034	NC_012793	AAC	2	6	3457444	3457449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828705
62035	NC_012793	ATA	2	6	3457452	3457457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828705
62036	NC_012793	AG	4	8	3457485	3457492	50 %	0 %	50 %	0 %	239828705
62037	NC_012793	ATTC	2	8	3457563	3457570	25 %	50 %	0 %	25 %	239828706
62038	NC_012793	TTC	2	6	3457584	3457589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62039	NC_012793	TAA	2	6	3457606	3457611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828706
62040	NC_012793	CAT	2	6	3457722	3457727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828706
62041	NC_012793	TCT	2	6	3457736	3457741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62042	NC_012793	T	7	7	3457761	3457767	0 %	100 %	0 %	0 %	239828706
62043	NC_012793	TTG	2	6	3457780	3457785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828706
62044	NC_012793	AT	3	6	3457799	3457804	50 %	50 %	0 %	0 %	239828706
62045	NC_012793	TCT	2	6	3457856	3457861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62046	NC_012793	CCG	2	6	3457863	3457868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828706
62047	NC_012793	GAC	2	6	3457905	3457910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828706
62048	NC_012793	CAA	2	6	3457912	3457917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828706
62049	NC_012793	TCC	2	6	3457951	3457956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239828706
62050	NC_012793	CTT	2	6	3457980	3457985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62051	NC_012793	TGA	2	6	3457995	3458000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828706
62052	NC_012793	T	6	6	3458017	3458022	0 %	100 %	0 %	0 %	239828706
62053	NC_012793	CT	3	6	3458023	3458028	0 %	50 %	0 %	50 %	239828706
62054	NC_012793	CTT	2	6	3458037	3458042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62055	NC_012793	T	6	6	3458041	3458046	0 %	100 %	0 %	0 %	239828706
62056	NC_012793	GAA	2	6	3458133	3458138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828706
62057	NC_012793	CAA	2	6	3458164	3458169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828706
62058	NC_012793	TCAA	2	8	3458207	3458214	50 %	25 %	0 %	25 %	239828706
62059	NC_012793	TCT	2	6	3458252	3458257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62060	NC_012793	CGC	2	6	3458308	3458313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828706
62061	NC_012793	GCCC	2	8	3458431	3458438	0 %	0 %	25 %	75 %	239828706
62062	NC_012793	TCG	2	6	3458469	3458474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828706
62063	NC_012793	AGC	2	6	3458477	3458482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828706
62064	NC_012793	CTT	2	6	3458532	3458537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828706
62065	NC_012793	TGG	2	6	3458570	3458575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828706
62066	NC_012793	TCG	2	6	3458681	3458686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828706
62067	NC_012793	AT	3	6	3458744	3458749	50 %	50 %	0 %	0 %	239828706
62068	NC_012793	CGT	2	6	3458752	3458757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828706
62069	NC_012793	AATC	2	8	3458814	3458821	50 %	25 %	0 %	25 %	239828706
62070	NC_012793	CG	3	6	3458835	3458840	0 %	0 %	50 %	50 %	239828706
62071	NC_012793	AAT	3	9	3458953	3458961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828706
62072	NC_012793	TAA	2	6	3458988	3458993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828706
62073	NC_012793	ATA	2	6	3459007	3459012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828706
62074	NC_012793	AAC	2	6	3459031	3459036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828706
62075	NC_012793	AAT	2	6	3459086	3459091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828706
62076	NC_012793	T	7	7	3459117	3459123	0 %	100 %	0 %	0 %	239828706
62077	NC_012793	T	6	6	3459230	3459235	0 %	100 %	0 %	0 %	239828706
62078	NC_012793	AAC	2	6	3459268	3459273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828706
62079	NC_012793	CCG	2	6	3459290	3459295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828706
62080	NC_012793	GC	3	6	3459367	3459372	0 %	0 %	50 %	50 %	239828706
62081	NC_012793	CGC	2	6	3459382	3459387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828706
62082	NC_012793	AAT	2	6	3459535	3459540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828707
62083	NC_012793	AAG	2	6	3459547	3459552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828707
62084	NC_012793	TGA	2	6	3459644	3459649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828707
62085	NC_012793	TAA	2	6	3459777	3459782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828707
62086	NC_012793	GGC	2	6	3459786	3459791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239828707
62087	NC_012793	T	6	6	3459827	3459832	0 %	100 %	0 %	0 %	239828707
62088	NC_012793	TAACGA	2	12	3459849	3459860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239828707
62089	NC_012793	ATCC	2	8	3459865	3459872	25 %	25 %	0 %	50 %	239828707
62090	NC_012793	TCT	2	6	3459899	3459904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828707
62091	NC_012793	CTTC	2	8	3459951	3459958	0 %	50 %	0 %	50 %	239828707
62092	NC_012793	CGA	2	6	3459993	3459998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62093	NC_012793	TCC	2	6	3460001	3460006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239828707
62094	NC_012793	CCG	2	6	3460020	3460025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828707
62095	NC_012793	CGC	2	6	3460047	3460052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828707
62096	NC_012793	CG	3	6	3460080	3460085	0 %	0 %	50 %	50 %	239828707
62097	NC_012793	TAA	2	6	3460138	3460143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828707
62098	NC_012793	GAT	2	6	3460145	3460150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828707
62099	NC_012793	TTG	2	6	3460210	3460215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828707
62100	NC_012793	GCA	2	6	3460224	3460229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62101	NC_012793	GCG	2	6	3460278	3460283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239828707
62102	NC_012793	CAT	3	9	3460296	3460304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828707
62103	NC_012793	AATT	2	8	3460372	3460379	50 %	50 %	0 %	0 %	239828707
62104	NC_012793	TGC	2	6	3460400	3460405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62105	NC_012793	AATCA	2	10	3460441	3460450	60 %	20 %	0 %	20 %	239828707
62106	NC_012793	CCGCTT	2	12	3460455	3460466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	239828707
62107	NC_012793	TCCG	2	8	3460479	3460486	0 %	25 %	25 %	50 %	239828707
62108	NC_012793	GCA	2	6	3460554	3460559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62109	NC_012793	ACC	2	6	3460579	3460584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828707
62110	NC_012793	AATT	2	8	3460590	3460597	50 %	50 %	0 %	0 %	239828707
62111	NC_012793	CAA	2	6	3460599	3460604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828707
62112	NC_012793	TCG	2	6	3460778	3460783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62113	NC_012793	GCA	2	6	3460835	3460840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828707
62114	NC_012793	TAC	2	6	3461109	3461114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828708
62115	NC_012793	TTC	2	6	3461130	3461135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828708
62116	NC_012793	AGT	2	6	3461148	3461153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828708
62117	NC_012793	T	6	6	3461157	3461162	0 %	100 %	0 %	0 %	239828708
62118	NC_012793	AAT	2	6	3461184	3461189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828708
62119	NC_012793	CTT	2	6	3461225	3461230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828708
62120	NC_012793	T	6	6	3461282	3461287	0 %	100 %	0 %	0 %	239828708
62121	NC_012793	CGA	2	6	3461315	3461320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828708
62122	NC_012793	AAT	2	6	3461368	3461373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828708
62123	NC_012793	TTG	2	6	3461460	3461465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828708
62124	NC_012793	TGC	2	6	3461478	3461483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828708
62125	NC_012793	ACA	2	6	3461503	3461508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828708
62126	NC_012793	T	6	6	3461509	3461514	0 %	100 %	0 %	0 %	239828708
62127	NC_012793	CTT	2	6	3461528	3461533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828708
62128	NC_012793	TTC	2	6	3461603	3461608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828708
62129	NC_012793	CGG	2	6	3461693	3461698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239828708
62130	NC_012793	CTT	2	6	3461708	3461713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828708
62131	NC_012793	TCC	2	6	3461726	3461731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239828709
62132	NC_012793	AGC	2	6	3461819	3461824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828709
62133	NC_012793	CAT	2	6	3461861	3461866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828709
62134	NC_012793	CAT	2	6	3461873	3461878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828709
62135	NC_012793	TGT	2	6	3461895	3461900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828709
62136	NC_012793	GCCA	2	8	3461906	3461913	25 %	0 %	25 %	50 %	239828709
62137	NC_012793	ATT	2	6	3461916	3461921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828709
62138	NC_012793	T	6	6	3461920	3461925	0 %	100 %	0 %	0 %	239828709
62139	NC_012793	TAAAA	2	10	3461960	3461969	80 %	20 %	0 %	0 %	239828709
62140	NC_012793	TC	3	6	3462021	3462026	0 %	50 %	0 %	50 %	239828709
62141	NC_012793	AAC	2	6	3462085	3462090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828709
62142	NC_012793	ACA	3	9	3462121	3462129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828709
62143	NC_012793	TGT	2	6	3462150	3462155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828709
62144	NC_012793	T	6	6	3462231	3462236	0 %	100 %	0 %	0 %	239828709
62145	NC_012793	AG	3	6	3462347	3462352	50 %	0 %	50 %	0 %	239828709
62146	NC_012793	GCAA	2	8	3462435	3462442	50 %	0 %	25 %	25 %	239828709
62147	NC_012793	TAC	2	6	3462733	3462738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828710
62148	NC_012793	TGTTT	2	10	3462779	3462788	0 %	80 %	20 %	0 %	239828710
62149	NC_012793	CGC	2	6	3462824	3462829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828710
62150	NC_012793	CAAG	2	8	3462844	3462851	50 %	0 %	25 %	25 %	239828710
62151	NC_012793	GCT	2	6	3462889	3462894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828710
62152	NC_012793	TTC	2	6	3462901	3462906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828710
62153	NC_012793	CCG	2	6	3462982	3462987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239828710
62154	NC_012793	GTC	2	6	3463064	3463069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828710
62155	NC_012793	TAC	2	6	3463172	3463177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828710
62156	NC_012793	ACG	2	6	3463251	3463256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828710
62157	NC_012793	TGA	2	6	3463275	3463280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828710
62158	NC_012793	GAA	2	6	3463421	3463426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828710
62159	NC_012793	A	6	6	3463436	3463441	100 %	0 %	0 %	0 %	239828710
62160	NC_012793	TTG	2	6	3463547	3463552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828710
62161	NC_012793	TTTAT	2	10	3463612	3463621	20 %	80 %	0 %	0 %	239828711
62162	NC_012793	GC	3	6	3463633	3463638	0 %	0 %	50 %	50 %	239828711
62163	NC_012793	GCA	2	6	3463657	3463662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828711
62164	NC_012793	TTC	2	6	3463668	3463673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828711
62165	NC_012793	AAT	2	6	3463712	3463717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828711
62166	NC_012793	ATA	2	6	3463737	3463742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828711
62167	NC_012793	A	7	7	3463758	3463764	100 %	0 %	0 %	0 %	239828711
62168	NC_012793	GTT	2	6	3463849	3463854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828711
62169	NC_012793	ATAA	2	8	3463871	3463878	75 %	25 %	0 %	0 %	239828711
62170	NC_012793	CTT	2	6	3463918	3463923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828711
62171	NC_012793	TTC	2	6	3463956	3463961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828711
62172	NC_012793	ATA	2	6	3464051	3464056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828712
62173	NC_012793	TTC	2	6	3464060	3464065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828712
62174	NC_012793	ACG	4	12	3464070	3464081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828712
62175	NC_012793	GC	3	6	3464115	3464120	0 %	0 %	50 %	50 %	239828712
62176	NC_012793	TGC	2	6	3464138	3464143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828712
62177	NC_012793	TGGT	2	8	3464157	3464164	0 %	50 %	50 %	0 %	239828712

< Previous12...113114115116117118119120121122123124125Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.