MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.02

Total Repeats: 3746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020051	ATTG	2	8	190026	190033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020051	TTA	2	6	190104	190109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020051	GAA	2	6	190127	190132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020051	T	7	7	190198	190204	0 %	100 %	0 %	0 %	436736031
3505	NC_020051	TTC	2	6	190208	190213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736031
3506	NC_020051	TCCTT	2	10	190219	190228	0 %	60 %	0 %	40 %	436736031
3507	NC_020051	TGA	2	6	190236	190241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736031
3508	NC_020051	TCGCC	2	10	190261	190270	0 %	20 %	20 %	60 %	436736031
3509	NC_020051	TAA	2	6	190314	190319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736031
3510	NC_020051	ATT	2	6	190342	190347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736031
3511	NC_020051	TTCT	2	8	190390	190397	0 %	75 %	0 %	25 %	436736031
3512	NC_020051	GCA	2	6	190427	190432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736031
3513	NC_020051	GCT	2	6	190505	190510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736031
3514	NC_020051	TC	3	6	190582	190587	0 %	50 %	0 %	50 %	436736031
3515	NC_020051	ATT	2	6	190630	190635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736031
3516	NC_020051	TG	3	6	190708	190713	0 %	50 %	50 %	0 %	436736031
3517	NC_020051	TGG	2	6	190754	190759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736031
3518	NC_020051	GAT	2	6	190801	190806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736031
3519	NC_020051	GCC	2	6	190821	190826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736031
3520	NC_020051	CTCG	2	8	190894	190901	0 %	25 %	25 %	50 %	436736032
3521	NC_020051	T	6	6	190902	190907	0 %	100 %	0 %	0 %	436736032
3522	NC_020051	CAA	2	6	191013	191018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736032
3523	NC_020051	TCAA	2	8	191043	191050	50 %	25 %	0 %	25 %	436736032
3524	NC_020051	GTT	2	6	191055	191060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736032
3525	NC_020051	GTC	2	6	191064	191069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736032
3526	NC_020051	TGG	2	6	191162	191167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736032
3527	NC_020051	AT	3	6	191174	191179	50 %	50 %	0 %	0 %	436736032
3528	NC_020051	TCT	2	6	191271	191276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736032
3529	NC_020051	GCA	2	6	191316	191321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736032
3530	NC_020051	AGC	2	6	191426	191431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_020051	ACAA	2	8	191440	191447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_020051	AGC	2	6	191506	191511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_020051	GCCT	2	8	191534	191541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_020051	GTC	2	6	191575	191580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_020051	AGC	2	6	191583	191588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_020051	GAA	2	6	191641	191646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736033
3537	NC_020051	TTCC	2	8	191659	191666	0 %	50 %	0 %	50 %	436736033
3538	NC_020051	GTT	2	6	191668	191673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736033
3539	NC_020051	ATC	2	6	191694	191699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736033
3540	NC_020051	ATG	2	6	191785	191790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736033
3541	NC_020051	A	6	6	191849	191854	100 %	0 %	0 %	0 %	436736033
3542	NC_020051	TTAA	2	8	192018	192025	50 %	50 %	0 %	0 %	436736033
3543	NC_020051	TCT	2	6	192037	192042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736033
3544	NC_020051	AGGA	2	8	192044	192051	50 %	0 %	50 %	0 %	436736033
3545	NC_020051	CTG	2	6	192204	192209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3546	NC_020051	TC	3	6	192250	192255	0 %	50 %	0 %	50 %	436736034
3547	NC_020051	AG	3	6	192260	192265	50 %	0 %	50 %	0 %	436736034
3548	NC_020051	GCT	2	6	192418	192423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3549	NC_020051	GGC	2	6	192455	192460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736034
3550	NC_020051	GCC	2	6	192474	192479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736034
3551	NC_020051	ACC	2	6	192483	192488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736034
3552	NC_020051	ATT	2	6	192556	192561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736034
3553	NC_020051	ATCA	2	8	192576	192583	50 %	25 %	0 %	25 %	436736034
3554	NC_020051	AGC	2	6	192624	192629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3555	NC_020051	TAAA	2	8	192795	192802	75 %	25 %	0 %	0 %	436736034
3556	NC_020051	GCA	2	6	192832	192837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3557	NC_020051	TAC	2	6	192842	192847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736034
3558	NC_020051	GAA	2	6	192990	192995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736034
3559	NC_020051	GAG	2	6	193020	193025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736034
3560	NC_020051	CCT	2	6	193039	193044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736034
3561	NC_020051	GCA	2	6	193081	193086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3562	NC_020051	TGCT	2	8	193098	193105	0 %	50 %	25 %	25 %	436736034
3563	NC_020051	GTTG	2	8	193134	193141	0 %	50 %	50 %	0 %	436736034
3564	NC_020051	GGA	2	6	193156	193161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736034
3565	NC_020051	AGC	2	6	193194	193199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3566	NC_020051	GTT	2	6	193200	193205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736034
3567	NC_020051	GT	3	6	193223	193228	0 %	50 %	50 %	0 %	436736034
3568	NC_020051	ATC	2	6	193245	193250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736034
3569	NC_020051	AGC	2	6	193267	193272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3570	NC_020051	CAC	2	6	193556	193561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736034
3571	NC_020051	GGGA	2	8	193614	193621	25 %	0 %	75 %	0 %	436736034
3572	NC_020051	CTG	2	6	193622	193627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736034
3573	NC_020051	AG	3	6	193631	193636	50 %	0 %	50 %	0 %	436736034
3574	NC_020051	CAA	2	6	193691	193696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736034
3575	NC_020051	AGG	2	6	193756	193761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736034
3576	NC_020051	AT	3	6	193811	193816	50 %	50 %	0 %	0 %	436736034
3577	NC_020051	C	6	6	193830	193835	0 %	0 %	0 %	100 %	436736035
3578	NC_020051	T	6	6	193838	193843	0 %	100 %	0 %	0 %	436736035
3579	NC_020051	CTGTG	2	10	193877	193886	0 %	40 %	40 %	20 %	436736035
3580	NC_020051	AAG	2	6	193898	193903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736035
3581	NC_020051	GTC	2	6	193994	193999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736035
3582	NC_020051	CAA	2	6	194078	194083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736035
3583	NC_020051	GGTG	2	8	194093	194100	0 %	25 %	75 %	0 %	436736035
3584	NC_020051	ATC	2	6	194174	194179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736035
3585	NC_020051	AG	3	6	194216	194221	50 %	0 %	50 %	0 %	436736035
3586	NC_020051	AG	3	6	194238	194243	50 %	0 %	50 %	0 %	436736035
3587	NC_020051	CGC	2	6	194286	194291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736035
3588	NC_020051	TGA	2	6	194329	194334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736035
3589	NC_020051	TGA	2	6	194398	194403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736035
3590	NC_020051	GTA	2	6	194405	194410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736035
3591	NC_020051	GGT	2	6	194425	194430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736035
3592	NC_020051	CAT	2	6	194572	194577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736035
3593	NC_020051	AGGA	2	8	194600	194607	50 %	0 %	50 %	0 %	436736035
3594	NC_020051	TGA	2	6	194608	194613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736035
3595	NC_020051	TCA	2	6	194617	194622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736035
3596	NC_020051	TGAA	2	8	194623	194630	50 %	25 %	25 %	0 %	436736035
3597	NC_020051	A	6	6	194652	194657	100 %	0 %	0 %	0 %	436736035
3598	NC_020051	GAT	2	6	194750	194755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736035
3599	NC_020051	ATG	2	6	194806	194811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736036
3600	NC_020051	ATG	2	6	194893	194898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736036
3601	NC_020051	TAA	2	6	194930	194935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736036
3602	NC_020051	GAA	2	6	194950	194955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736036
3603	NC_020051	CAA	2	6	195017	195022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736036
3604	NC_020051	AT	3	6	195034	195039	50 %	50 %	0 %	0 %	436736036
3605	NC_020051	A	7	7	195051	195057	100 %	0 %	0 %	0 %	436736036
3606	NC_020051	TCCAG	2	10	195077	195086	20 %	20 %	20 %	40 %	436736036
3607	NC_020051	CAA	2	6	195107	195112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736036
3608	NC_020051	GCT	2	6	195161	195166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736036
3609	NC_020051	CTT	2	6	195171	195176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736036
3610	NC_020051	ACC	2	6	195243	195248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736036
3611	NC_020051	GGTG	2	8	195300	195307	0 %	25 %	75 %	0 %	436736036
3612	NC_020051	TTG	2	6	195314	195319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736036
3613	NC_020051	CTG	2	6	195355	195360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736036
3614	NC_020051	GGT	2	6	195374	195379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736036
3615	NC_020051	AACA	2	8	195433	195440	75 %	0 %	0 %	25 %	436736036
3616	NC_020051	AAG	2	6	195520	195525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736036
3617	NC_020051	TTGC	2	8	195570	195577	0 %	50 %	25 %	25 %	436736036
3618	NC_020051	TAG	2	6	195586	195591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736036
3619	NC_020051	CCT	2	6	195646	195651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736036
3620	NC_020051	AGT	2	6	195677	195682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736036
3621	NC_020051	CAA	2	6	195691	195696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736036
3622	NC_020051	CTA	2	6	195836	195841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3624	NC_020051	GTG	2	6	195980	195985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.