MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 chromosome

Total Repeats: 144697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_018581	TTC	2	6	597405	597410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404213153
16002	NC_018581	CGA	2	6	597418	597423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213153
16003	NC_018581	TCG	2	6	597424	597429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213153
16004	NC_018581	CGGTC	2	10	597473	597482	0 %	20 %	40 %	40 %	404213153
16005	NC_018581	ATC	2	6	597489	597494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213153
16006	NC_018581	ACGAGG	2	12	597499	597510	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	404213153
16007	NC_018581	ACG	2	6	597511	597516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213153
16008	NC_018581	CCGGA	2	10	597608	597617	20 %	0 %	40 %	40 %	404213153
16009	NC_018581	CGTGAA	2	12	597620	597631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404213153
16010	NC_018581	CGG	2	6	597662	597667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213153
16011	NC_018581	GAG	2	6	597714	597719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213153
16012	NC_018581	TTC	2	6	597720	597725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404213153
16013	NC_018581	CGC	2	6	597817	597822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16014	NC_018581	GCTCG	2	10	597908	597917	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16015	NC_018581	GCT	2	6	597961	597966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_018581	GTG	2	6	598006	598011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_018581	GGCG	2	8	598022	598029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16018	NC_018581	CACC	2	8	598055	598062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16019	NC_018581	CG	3	6	598074	598079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_018581	GGC	2	6	598108	598113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_018581	CT	3	6	598119	598124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16022	NC_018581	TCA	2	6	598175	598180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213154
16023	NC_018581	GGCA	2	8	598201	598208	25 %	0 %	50 %	25 %	404213154
16024	NC_018581	GTC	2	6	598209	598214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16025	NC_018581	CGC	2	6	598224	598229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213154
16026	NC_018581	TCG	2	6	598250	598255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16027	NC_018581	TCG	2	6	598292	598297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16028	NC_018581	AGC	2	6	598298	598303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16029	NC_018581	GCCATC	2	12	598315	598326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404213154
16030	NC_018581	GTG	2	6	598423	598428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213154
16031	NC_018581	CGG	2	6	598434	598439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16032	NC_018581	CGG	2	6	598455	598460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16033	NC_018581	GAA	2	6	598489	598494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404213154
16034	NC_018581	AAC	2	6	598501	598506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404213154
16035	NC_018581	GCG	2	6	598526	598531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16036	NC_018581	GGC	2	6	598548	598553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16037	NC_018581	CGG	2	6	598575	598580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16038	NC_018581	CAT	2	6	598587	598592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213154
16039	NC_018581	TCG	2	6	598600	598605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16040	NC_018581	ACC	2	6	598625	598630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404213154
16041	NC_018581	GTC	2	6	598780	598785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213154
16042	NC_018581	CCG	2	6	598858	598863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213154
16043	NC_018581	CCTCG	2	10	598896	598905	0 %	20 %	20 %	60 %	404213154
16044	NC_018581	GGTCA	2	10	598927	598936	20 %	20 %	40 %	20 %	404213154
16045	NC_018581	CGG	2	6	598943	598948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213154
16046	NC_018581	AGA	2	6	599000	599005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404213154
16047	NC_018581	CTGAT	2	10	599098	599107	20 %	40 %	20 %	20 %	404213155
16048	NC_018581	GAT	2	6	599115	599120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404213155
16049	NC_018581	GTG	2	6	599133	599138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213155
16050	NC_018581	AAG	2	6	599179	599184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404213155
16051	NC_018581	ACC	2	6	599223	599228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404213155
16052	NC_018581	TGA	2	6	599253	599258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404213155
16053	NC_018581	CGAT	3	12	599328	599339	25 %	25 %	25 %	25 %	404213156
16054	NC_018581	GCA	2	6	599351	599356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16055	NC_018581	GGT	2	6	599377	599382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213156
16056	NC_018581	CGG	2	6	599398	599403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213156
16057	NC_018581	CAA	2	6	599476	599481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404213156
16058	NC_018581	CCG	2	6	599531	599536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213156
16059	NC_018581	CGCA	2	8	599581	599588	25 %	0 %	25 %	50 %	404213156
16060	NC_018581	CGT	2	6	599764	599769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16061	NC_018581	GAG	3	9	599795	599803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213156
16062	NC_018581	GC	3	6	599813	599818	0 %	0 %	50 %	50 %	404213156
16063	NC_018581	AGA	2	6	599853	599858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404213156
16064	NC_018581	CGA	2	6	599863	599868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16065	NC_018581	CG	3	6	599873	599878	0 %	0 %	50 %	50 %	404213156
16066	NC_018581	GAC	2	6	599888	599893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16067	NC_018581	GGA	2	6	599929	599934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213156
16068	NC_018581	CCT	2	6	599944	599949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404213156
16069	NC_018581	CGA	2	6	599953	599958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16070	NC_018581	TTC	2	6	599975	599980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404213156
16071	NC_018581	CTG	2	6	599981	599986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16072	NC_018581	AAC	2	6	600047	600052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404213156
16073	NC_018581	AGC	2	6	600057	600062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16074	NC_018581	TCG	2	6	600072	600077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213156
16075	NC_018581	GAG	2	6	600107	600112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213156
16076	NC_018581	GCC	2	6	600128	600133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213156
16077	NC_018581	GCG	2	6	600145	600150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213156
16078	NC_018581	CG	3	6	600156	600161	0 %	0 %	50 %	50 %	404213156
16079	NC_018581	GAG	2	6	600239	600244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213156
16080	NC_018581	AACCG	2	10	600279	600288	40 %	0 %	20 %	40 %	404213156
16081	NC_018581	CGG	3	9	600301	600309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213156
16082	NC_018581	GAG	2	6	600365	600370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213156
16083	NC_018581	CCG	2	6	600413	600418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213156
16084	NC_018581	TG	3	6	600446	600451	0 %	50 %	50 %	0 %	404213156
16085	NC_018581	CCG	2	6	600485	600490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16086	NC_018581	CGA	2	6	600498	600503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_018581	GTC	2	6	600507	600512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_018581	ACC	2	6	600514	600519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16089	NC_018581	GCG	2	6	600523	600528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16090	NC_018581	CGCC	2	8	600541	600548	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16091	NC_018581	TTA	2	6	600610	600615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_018581	GTC	2	6	600633	600638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_018581	CAA	2	6	600667	600672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_018581	GAC	2	6	600757	600762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16095	NC_018581	CGA	2	6	600772	600777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16096	NC_018581	CGA	2	6	600796	600801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16097	NC_018581	TCG	2	6	600864	600869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16098	NC_018581	CAA	2	6	600925	600930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404213157
16099	NC_018581	CAT	2	6	600931	600936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213157
16100	NC_018581	GTG	2	6	600938	600943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213157
16101	NC_018581	TCT	2	6	601035	601040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404213157
16102	NC_018581	ACC	2	6	601050	601055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404213157
16103	NC_018581	GGT	2	6	601056	601061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213157
16104	NC_018581	ACGCG	2	10	601096	601105	20 %	0 %	40 %	40 %	404213157
16105	NC_018581	GTG	2	6	601181	601186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404213157
16106	NC_018581	GT	3	6	601274	601279	0 %	50 %	50 %	0 %	404213157
16107	NC_018581	CGA	2	6	601297	601302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16108	NC_018581	CCA	2	6	601305	601310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404213157
16109	NC_018581	CCG	2	6	601374	601379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213157
16110	NC_018581	ATC	2	6	601385	601390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213157
16111	NC_018581	CGGC	2	8	601420	601427	0 %	0 %	50 %	50 %	404213157
16112	NC_018581	CGC	2	6	601443	601448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213157
16113	NC_018581	ATCG	2	8	601453	601460	25 %	25 %	25 %	25 %	404213157
16114	NC_018581	CCGAC	2	10	601596	601605	20 %	0 %	20 %	60 %	404213157
16115	NC_018581	AGC	2	6	601620	601625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16116	NC_018581	TGC	2	6	601716	601721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16117	NC_018581	AGG	2	6	601725	601730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213157
16118	NC_018581	CTG	2	6	601739	601744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16119	NC_018581	TGC	2	6	601788	601793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213157
16120	NC_018581	CCG	2	6	601825	601830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213157
16121	NC_018581	AAG	2	6	601838	601843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404213157
16122	NC_018581	TCG	2	6	601845	601850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213157
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16125	NC_018581	CCG	2	6	601913	601918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16200	NC_018581	ATCGCG	2	12	605154	605165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404213160
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16205	NC_018581	AGT	2	6	605332	605337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404213160
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16209	NC_018581	GAC	2	6	605459	605464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213160
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16211	NC_018581	TGGTGC	2	12	605550	605561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16212	NC_018581	GCC	2	6	605637	605642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213161
16213	NC_018581	GATC	2	8	605655	605662	25 %	25 %	25 %	25 %	404213161
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16217	NC_018581	TCCG	2	8	605732	605739	0 %	25 %	25 %	50 %	404213161
16218	NC_018581	AGC	2	6	605744	605749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213161
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16221	NC_018581	CGACC	2	10	605845	605854	20 %	0 %	20 %	60 %	404213161
16222	NC_018581	CGA	2	6	605882	605887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213161
16223	NC_018581	CGC	2	6	605910	605915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404213161
16224	NC_018581	TGA	2	6	605933	605938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404213161
16225	NC_018581	TGC	2	6	605948	605953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213161
16226	NC_018581	GC	3	6	606000	606005	0 %	0 %	50 %	50 %	404213161
16227	NC_018581	GTT	2	6	606099	606104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404213161
16228	NC_018581	ACC	2	6	606148	606153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404213161
16229	NC_018581	TCG	2	6	606154	606159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213161
16230	NC_018581	GC	4	8	606197	606204	0 %	0 %	50 %	50 %	404213161
16231	NC_018581	TCG	2	6	606223	606228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213161
16232	NC_018581	CGTC	2	8	606349	606356	0 %	25 %	25 %	50 %	404213161
16233	NC_018581	CCT	2	6	606510	606515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16234	NC_018581	AGG	2	6	606541	606546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16235	NC_018581	CAG	2	6	606557	606562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213162
16236	NC_018581	TCA	2	6	606626	606631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213162
16237	NC_018581	GCG	2	6	606691	606696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213162
16238	NC_018581	GCGG	2	8	606702	606709	0 %	0 %	75 %	25 %	404213162
16239	NC_018581	CGT	3	9	606729	606737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213162
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16354	NC_018581	TCA	2	6	610796	610801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213166
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16358	NC_018581	CCCG	2	8	610990	610997	0 %	0 %	25 %	75 %	404213166
16359	NC_018581	CG	3	6	611008	611013	0 %	0 %	50 %	50 %	404213166
16360	NC_018581	CAA	2	6	611043	611048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404213166
16361	NC_018581	CGG	3	9	611096	611104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213166
16362	NC_018581	GCT	2	6	611105	611110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213166
16363	NC_018581	GTCT	2	8	611178	611185	0 %	50 %	25 %	25 %	404213166
16364	NC_018581	ATC	2	6	611323	611328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404213166
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16366	NC_018581	GC	3	6	611348	611353	0 %	0 %	50 %	50 %	404213166
16367	NC_018581	TCTGC	2	10	611378	611387	0 %	40 %	20 %	40 %	404213166
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16371	NC_018581	CGT	2	6	611576	611581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213166
16372	NC_018581	CGT	2	6	611621	611626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213166
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16392	NC_018581	GC	4	8	612394	612401	0 %	0 %	50 %	50 %	404213167
16393	NC_018581	CGA	2	6	612425	612430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213167
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16399	NC_018581	CGGT	2	8	612644	612651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16400	NC_018581	CCAGA	2	10	612736	612745	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16401	NC_018581	AGG	2	6	612788	612793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16430	NC_018581	CCGTC	2	10	614179	614188	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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16465	NC_018581	GAG	2	6	615494	615499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404213172
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16467	NC_018581	CACG	2	8	615530	615537	25 %	0 %	25 %	50 %	404213172
16468	NC_018581	GCG	2	6	615550	615555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213172
16469	NC_018581	GCCG	2	8	615602	615609	0 %	0 %	50 %	50 %	404213172
16470	NC_018581	TGA	3	9	615613	615621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404213172
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16472	NC_018581	CGA	2	6	615637	615642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213172
16473	NC_018581	TCG	3	9	615657	615665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213172
16474	NC_018581	AGCC	2	8	615690	615697	25 %	0 %	25 %	50 %	404213172
16475	NC_018581	TCG	2	6	615702	615707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213172
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16477	NC_018581	GCA	2	6	615766	615771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213172
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16479	NC_018581	GC	3	6	615868	615873	0 %	0 %	50 %	50 %	404213172
16480	NC_018581	AGC	2	6	615969	615974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404213172
16481	NC_018581	CACC	2	8	616033	616040	25 %	0 %	0 %	75 %	404213172
16482	NC_018581	GCT	2	6	616075	616080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213172
16483	NC_018581	GTCC	2	8	616135	616142	0 %	25 %	25 %	50 %	404213172
16484	NC_018581	CG	3	6	616172	616177	0 %	0 %	50 %	50 %	404213172
16485	NC_018581	GCG	2	6	616236	616241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404213172
16486	NC_018581	GTC	2	6	616248	616253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404213172
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