MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 chromosome

Total Repeats: 144697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_018581	CGA	2	6	3997156	3997161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106002	NC_018581	CGGGCA	2	12	3997177	3997188	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404216105
106003	NC_018581	ATCGGC	2	12	3997209	3997220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106004	NC_018581	CGC	2	6	3997238	3997243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216105
106005	NC_018581	CGGTCT	2	12	3997255	3997266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106006	NC_018581	CCA	2	6	3997268	3997273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216105
106007	NC_018581	CGA	2	6	3997279	3997284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106008	NC_018581	GAC	2	6	3997365	3997370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106009	NC_018581	CG	3	6	3997418	3997423	0 %	0 %	50 %	50 %	404216105
106010	NC_018581	CGT	2	6	3997529	3997534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106011	NC_018581	GCG	2	6	3997549	3997554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106012	NC_018581	CGA	2	6	3997576	3997581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106013	NC_018581	CCA	2	6	3997604	3997609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216105
106014	NC_018581	CCG	2	6	3997671	3997676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216105
106015	NC_018581	GAC	2	6	3997685	3997690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106016	NC_018581	GGT	2	6	3997706	3997711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216105
106017	NC_018581	CGG	2	6	3997774	3997779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106018	NC_018581	CCAG	2	8	3997801	3997808	25 %	0 %	25 %	50 %	404216105
106019	NC_018581	CGG	2	6	3997819	3997824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106020	NC_018581	GCG	2	6	3997867	3997872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106021	NC_018581	CCA	2	6	3997900	3997905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216105
106022	NC_018581	GAC	2	6	3997955	3997960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106023	NC_018581	TCG	2	6	3997977	3997982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106024	NC_018581	GCG	2	6	3998004	3998009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106025	NC_018581	ACC	2	6	3998022	3998027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216105
106026	NC_018581	GCACC	2	10	3998032	3998041	20 %	0 %	20 %	60 %	404216105
106027	NC_018581	CG	3	6	3998046	3998051	0 %	0 %	50 %	50 %	404216105
106028	NC_018581	GCC	2	6	3998070	3998075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216105
106029	NC_018581	ATC	2	6	3998082	3998087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404216105
106030	NC_018581	CAC	2	6	3998099	3998104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216105
106031	NC_018581	AGC	2	6	3998166	3998171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106032	NC_018581	CGT	2	6	3998236	3998241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106033	NC_018581	TCG	2	6	3998328	3998333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106034	NC_018581	CGG	2	6	3998345	3998350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106035	NC_018581	CGG	2	6	3998374	3998379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216105
106036	NC_018581	ATC	2	6	3998399	3998404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404216105
106037	NC_018581	TG	3	6	3998412	3998417	0 %	50 %	50 %	0 %	404216105
106038	NC_018581	CCTTC	2	10	3998443	3998452	0 %	40 %	0 %	60 %	404216105
106039	NC_018581	TCG	2	6	3998459	3998464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106040	NC_018581	TCG	2	6	3998524	3998529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216105
106041	NC_018581	TCG	2	6	3998611	3998616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106042	NC_018581	GTC	2	6	3998625	3998630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106043	NC_018581	GGC	2	6	3998673	3998678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216106
106044	NC_018581	CGCA	2	8	3998727	3998734	25 %	0 %	25 %	50 %	404216106
106045	NC_018581	AGA	2	6	3998756	3998761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404216106
106046	NC_018581	TCG	2	6	3998764	3998769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106047	NC_018581	AGT	2	6	3998825	3998830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216106
106048	NC_018581	CGT	2	6	3998834	3998839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106049	NC_018581	CGA	2	6	3998840	3998845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106050	NC_018581	GGC	2	6	3998850	3998855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216106
106051	NC_018581	GAC	2	6	3998889	3998894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106052	NC_018581	GTC	2	6	3998985	3998990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216106
106053	NC_018581	GAT	2	6	3998991	3998996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216106
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106055	NC_018581	CGG	2	6	3999011	3999016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216106
106056	NC_018581	CGG	2	6	3999056	3999061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216106
106057	NC_018581	GGC	2	6	3999084	3999089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216106
106058	NC_018581	CGAT	2	8	3999100	3999107	25 %	25 %	25 %	25 %	404216106
106059	NC_018581	CGA	2	6	3999158	3999163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106060	NC_018581	GCCTC	2	10	3999173	3999182	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106061	NC_018581	GTG	2	6	3999218	3999223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106062	NC_018581	CCGGCG	2	12	3999235	3999246	0 %	0 %	50 %	50 %	404216107
106063	NC_018581	CCG	2	6	3999299	3999304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216107
106064	NC_018581	GACC	2	8	3999314	3999321	25 %	0 %	25 %	50 %	404216107
106065	NC_018581	GGC	2	6	3999367	3999372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216107
106066	NC_018581	CGGG	2	8	3999386	3999393	0 %	0 %	75 %	25 %	404216107
106067	NC_018581	CGC	2	6	3999394	3999399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216107
106068	NC_018581	GAC	2	6	3999410	3999415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106069	NC_018581	CCG	2	6	3999454	3999459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216107
106070	NC_018581	TCG	2	6	3999540	3999545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106071	NC_018581	CGT	2	6	3999589	3999594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106072	NC_018581	CTTC	2	8	3999610	3999617	0 %	50 %	0 %	50 %	404216107
106073	NC_018581	CGG	2	6	3999618	3999623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216107
106074	NC_018581	GATCAG	2	12	3999638	3999649	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404216107
106075	NC_018581	CAG	2	6	3999665	3999670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106076	NC_018581	CCGC	2	8	3999688	3999695	0 %	0 %	25 %	75 %	404216107
106077	NC_018581	CGA	3	9	3999721	3999729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106078	NC_018581	GCT	2	6	3999752	3999757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216107
106079	NC_018581	TCA	2	6	3999862	3999867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404216107
106080	NC_018581	TCC	2	6	3999873	3999878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106081	NC_018581	GCT	2	6	3999895	3999900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106082	NC_018581	CGCAGG	2	12	4000049	4000060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	404216108
106083	NC_018581	CGG	2	6	4000085	4000090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
106084	NC_018581	GTC	2	6	4000124	4000129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106085	NC_018581	TGG	2	6	4000135	4000140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216108
106086	NC_018581	GTG	2	6	4000146	4000151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216108
106087	NC_018581	TGG	2	6	4000185	4000190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216108
106088	NC_018581	CGG	2	6	4000213	4000218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
106089	NC_018581	GCC	2	6	4000244	4000249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216108
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106093	NC_018581	CGC	2	6	4000319	4000324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216108
106094	NC_018581	GGC	2	6	4000346	4000351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
106095	NC_018581	TGA	2	6	4000393	4000398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216108
106096	NC_018581	CGG	2	6	4000436	4000441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
106097	NC_018581	CGAG	2	8	4000550	4000557	25 %	0 %	50 %	25 %	404216108
106098	NC_018581	CGA	2	6	4000574	4000579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106099	NC_018581	ACG	2	6	4000580	4000585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106100	NC_018581	ACG	2	6	4000606	4000611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106101	NC_018581	GC	3	6	4000661	4000666	0 %	0 %	50 %	50 %	404216108
106102	NC_018581	GAG	2	6	4000689	4000694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404216108
106103	NC_018581	ACG	2	6	4000794	4000799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106104	NC_018581	CGA	2	6	4000817	4000822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106105	NC_018581	CGGCG	2	10	4000913	4000922	0 %	0 %	60 %	40 %	404216108
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106107	NC_018581	CGG	2	6	4000969	4000974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
106108	NC_018581	GC	3	6	4000979	4000984	0 %	0 %	50 %	50 %	404216108
106109	NC_018581	TCGGTG	2	12	4000992	4001003	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	404216108
106110	NC_018581	GC	3	6	4001093	4001098	0 %	0 %	50 %	50 %	404216108
106111	NC_018581	CGG	2	6	4001108	4001113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216108
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106113	NC_018581	GCCC	2	8	4001165	4001172	0 %	0 %	25 %	75 %	404216108
106114	NC_018581	GAC	2	6	4001200	4001205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216108
106115	NC_018581	CGG	2	6	4001214	4001219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216109
106116	NC_018581	TCG	2	6	4001250	4001255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216109
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106121	NC_018581	GC	3	6	4001515	4001520	0 %	0 %	50 %	50 %	404216109
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106223	NC_018581	GCC	2	6	4005338	4005343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106224	NC_018581	CA	3	6	4005362	4005367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106225	NC_018581	GT	3	6	4005390	4005395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106226	NC_018581	TGT	2	6	4005458	4005463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106227	NC_018581	GTT	2	6	4005468	4005473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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106229	NC_018581	CGTC	2	8	4005695	4005702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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106355	NC_018581	CTG	2	6	4012143	4012148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216113
106356	NC_018581	GCA	2	6	4012192	4012197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216113
106357	NC_018581	TGC	2	6	4012219	4012224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216113
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106359	NC_018581	CTG	2	6	4012287	4012292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216113
106360	NC_018581	TCG	2	6	4012294	4012299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216113
106361	NC_018581	ACC	2	6	4012303	4012308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216113
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106368	NC_018581	CGG	2	6	4012773	4012778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216113
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106416	NC_018581	GC	3	6	4014726	4014731	0 %	0 %	50 %	50 %	404216113
106417	NC_018581	GAT	2	6	4014804	4014809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216113
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106424	NC_018581	GAT	3	9	4014975	4014983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216113
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106426	NC_018581	CCA	2	6	4015031	4015036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216113
106427	NC_018581	ACC	2	6	4015067	4015072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106428	NC_018581	CTG	2	6	4015086	4015091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106429	NC_018581	GTG	2	6	4015095	4015100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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106432	NC_018581	GGT	2	6	4015169	4015174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106433	NC_018581	CGG	2	6	4015187	4015192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106434	NC_018581	GTC	3	9	4015194	4015202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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106450	NC_018581	CGA	2	6	4015668	4015673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216114
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106456	NC_018581	GCG	2	6	4015961	4015966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216115
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106458	NC_018581	TCG	2	6	4016009	4016014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106459	NC_018581	GGTGCC	2	12	4016020	4016031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404216115
106460	NC_018581	CAT	2	6	4016095	4016100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404216115
106461	NC_018581	CCG	2	6	4016114	4016119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216115
106462	NC_018581	GAC	2	6	4016164	4016169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106463	NC_018581	GAC	2	6	4016176	4016181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106464	NC_018581	CGT	2	6	4016193	4016198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106465	NC_018581	GAT	2	6	4016257	4016262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404216115
106466	NC_018581	CGGG	2	8	4016283	4016290	0 %	0 %	75 %	25 %	404216115
106467	NC_018581	CGA	2	6	4016298	4016303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106468	NC_018581	GCC	2	6	4016345	4016350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216115
106469	NC_018581	GC	3	6	4016366	4016371	0 %	0 %	50 %	50 %	404216115
106470	NC_018581	GTCCG	2	10	4016392	4016401	0 %	20 %	40 %	40 %	404216115
106471	NC_018581	GCG	2	6	4016447	4016452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216115
106472	NC_018581	TCC	2	6	4016465	4016470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404216115
106473	NC_018581	CTG	2	6	4016482	4016487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106474	NC_018581	CTG	2	6	4016497	4016502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106475	NC_018581	GGT	2	6	4016512	4016517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216115
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106477	NC_018581	GGT	2	6	4016620	4016625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404216115
106478	NC_018581	GTC	2	6	4016642	4016647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106479	NC_018581	GCC	2	6	4016657	4016662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404216115
106480	NC_018581	CGA	2	6	4016688	4016693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106481	NC_018581	CGT	2	6	4016700	4016705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106482	NC_018581	TCG	2	6	4016715	4016720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106483	NC_018581	GGTCCG	2	12	4016741	4016752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404216115
106484	NC_018581	GCG	2	6	4016756	4016761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216115
106485	NC_018581	GCACCT	2	12	4016766	4016777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404216115
106486	NC_018581	CAC	2	6	4016785	4016790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404216115
106487	NC_018581	CAG	2	6	4016800	4016805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216115
106488	NC_018581	CCGCGG	2	12	4016820	4016831	0 %	0 %	50 %	50 %	404216115
106489	NC_018581	CGA	3	9	4016887	4016895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106490	NC_018581	GCA	2	6	4016933	4016938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106491	NC_018581	GTC	2	6	4016965	4016970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106492	NC_018581	GC	3	6	4016978	4016983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106493	NC_018581	TCG	2	6	4017033	4017038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404216116
106494	NC_018581	CGA	3	9	4017050	4017058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404216116
106495	NC_018581	GGC	2	6	4017093	4017098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216116
106496	NC_018581	CGG	2	6	4017104	4017109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216116
106497	NC_018581	CGG	2	6	4017119	4017124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216116
106498	NC_018581	GGC	2	6	4017147	4017152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216116
106499	NC_018581	CGGGC	2	10	4017167	4017176	0 %	0 %	60 %	40 %	404216116
106500	NC_018581	CGG	3	9	4017272	4017280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404216116

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