MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 149899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016906	CGC	2	6	539580	539585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715999
14003	NC_016906	CGA	2	6	539595	539600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715999
14004	NC_016906	CGT	3	9	539761	539769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715999
14005	NC_016906	AGC	2	6	539804	539809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715999
14006	NC_016906	TGG	2	6	539859	539864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715999
14007	NC_016906	ACCC	2	8	539888	539895	25 %	0 %	0 %	75 %	378715999
14008	NC_016906	GCG	2	6	539906	539911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715999
14009	NC_016906	CAG	2	6	539923	539928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715999
14010	NC_016906	TGA	2	6	539964	539969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715999
14011	NC_016906	TGT	2	6	540005	540010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715999
14012	NC_016906	CGA	2	6	540078	540083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715999
14013	NC_016906	CGG	2	6	540107	540112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715999
14014	NC_016906	GCGG	2	8	540121	540128	0 %	0 %	75 %	25 %	378715999
14015	NC_016906	GCG	2	6	540133	540138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_016906	TGG	2	6	540147	540152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_016906	CGCCC	2	10	540185	540194	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14018	NC_016906	GTC	2	6	540265	540270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_016906	CGC	2	6	540271	540276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_016906	CGG	2	6	540340	540345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_016906	ACT	2	6	540372	540377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716000
14022	NC_016906	GCCG	2	8	540402	540409	0 %	0 %	50 %	50 %	378716000
14023	NC_016906	CGT	2	6	540447	540452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716000
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14110	NC_016906	GC	3	6	543694	543699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_016906	CTCG	2	8	543760	543767	0 %	25 %	25 %	50 %	378716004
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14240	NC_016906	GTG	2	6	548680	548685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716009
14241	NC_016906	CGG	2	6	548690	548695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716009
14242	NC_016906	CGA	2	6	548853	548858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716009
14243	NC_016906	TCG	2	6	548860	548865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716009
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14245	NC_016906	CGT	2	6	548895	548900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716009
14246	NC_016906	ACG	2	6	548903	548908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716009
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14248	NC_016906	GCC	2	6	548941	548946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716009
14249	NC_016906	CCTG	2	8	548989	548996	0 %	25 %	25 %	50 %	378716009
14250	NC_016906	CTG	2	6	549123	549128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716009
14251	NC_016906	ACG	2	6	549148	549153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716009
14252	NC_016906	GGGC	2	8	549170	549177	0 %	0 %	75 %	25 %	378716009
14253	NC_016906	CAC	2	6	549190	549195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716009
14254	NC_016906	CGGG	2	8	549240	549247	0 %	0 %	75 %	25 %	378716009
14255	NC_016906	TCG	3	9	549253	549261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716009
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14257	NC_016906	TGG	2	6	549287	549292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716009
14258	NC_016906	CGA	2	6	549341	549346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716009
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14261	NC_016906	CGC	2	6	549444	549449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716009
14262	NC_016906	CACT	2	8	549470	549477	25 %	25 %	0 %	50 %	378716009
14263	NC_016906	CG	3	6	549500	549505	0 %	0 %	50 %	50 %	378716009
14264	NC_016906	GGGT	2	8	549703	549710	0 %	25 %	75 %	0 %	378716009
14265	NC_016906	GTC	2	6	549807	549812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716010
14266	NC_016906	GGT	2	6	549845	549850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716010
14267	NC_016906	GCC	2	6	549876	549881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716010
14268	NC_016906	ATC	2	6	549921	549926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716010
14269	NC_016906	TCG	2	6	549952	549957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716010
14270	NC_016906	TCG	2	6	550006	550011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716010
14271	NC_016906	CCG	2	6	550027	550032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716010
14272	NC_016906	GCC	2	6	550062	550067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716010
14273	NC_016906	AGG	2	6	550108	550113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716010
14274	NC_016906	CGGC	2	8	550132	550139	0 %	0 %	50 %	50 %	378716010
14275	NC_016906	TCA	2	6	550165	550170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716010
14276	NC_016906	AGC	2	6	550174	550179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716010
14277	NC_016906	CTG	2	6	550282	550287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716011
14278	NC_016906	TCA	2	6	550295	550300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716011
14279	NC_016906	GCCG	2	8	550327	550334	0 %	0 %	50 %	50 %	378716011
14280	NC_016906	CAA	2	6	550347	550352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378716011
14281	NC_016906	GCG	3	9	550358	550366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716011
14282	NC_016906	CCA	2	6	550374	550379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716011
14283	NC_016906	GTT	3	9	550398	550406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378716011
14284	NC_016906	CGGTG	2	10	550410	550419	0 %	20 %	60 %	20 %	378716011
14285	NC_016906	GC	3	6	550451	550456	0 %	0 %	50 %	50 %	378716011
14286	NC_016906	TCGGCG	2	12	550475	550486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378716011
14287	NC_016906	CGA	2	6	550500	550505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716011
14288	NC_016906	GGT	2	6	550569	550574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716011
14289	NC_016906	CGA	2	6	550626	550631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716011
14290	NC_016906	CAC	2	6	550632	550637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716011
14291	NC_016906	CGC	2	6	550638	550643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716011
14292	NC_016906	AC	3	6	550649	550654	50 %	0 %	0 %	50 %	378716011
14293	NC_016906	TGG	2	6	550679	550684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716011
14294	NC_016906	TGC	2	6	550685	550690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716011
14295	NC_016906	CCG	2	6	550742	550747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716011
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14297	NC_016906	GCCG	2	8	550819	550826	0 %	0 %	50 %	50 %	378716011
14298	NC_016906	AAG	2	6	550843	550848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378716011
14299	NC_016906	GCC	2	6	550855	550860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716011
14300	NC_016906	CG	3	6	550862	550867	0 %	0 %	50 %	50 %	378716011
14301	NC_016906	CGA	2	6	550878	550883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716011
14302	NC_016906	GGT	2	6	551034	551039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716012
14303	NC_016906	TGC	2	6	551069	551074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14304	NC_016906	GT	3	6	551086	551091	0 %	50 %	50 %	0 %	378716012
14305	NC_016906	TGC	2	6	551120	551125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14306	NC_016906	ACCC	2	8	551161	551168	25 %	0 %	0 %	75 %	378716012
14307	NC_016906	CG	3	6	551209	551214	0 %	0 %	50 %	50 %	378716012
14308	NC_016906	TGC	2	6	551234	551239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14309	NC_016906	CGC	2	6	551261	551266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716012
14310	NC_016906	CGC	2	6	551302	551307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716012
14311	NC_016906	CGT	2	6	551308	551313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14312	NC_016906	GAC	3	9	551314	551322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14313	NC_016906	CGG	2	6	551393	551398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716012
14314	NC_016906	TCG	2	6	551399	551404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716012
14315	NC_016906	CGC	2	6	551466	551471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716012
14316	NC_016906	CCGCG	2	10	551478	551487	0 %	0 %	40 %	60 %	378716012
14317	NC_016906	TCG	2	6	551617	551622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14318	NC_016906	CG	3	6	551687	551692	0 %	0 %	50 %	50 %	378716013
14319	NC_016906	GAC	2	6	551741	551746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14320	NC_016906	TGC	2	6	551767	551772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14321	NC_016906	CGG	2	6	551775	551780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716013
14322	NC_016906	CGACCG	2	12	551846	551857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378716013
14323	NC_016906	CGA	2	6	551861	551866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14324	NC_016906	CGA	2	6	551882	551887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14325	NC_016906	CGG	2	6	551899	551904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716013
14326	NC_016906	CGA	2	6	551918	551923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14327	NC_016906	GACC	2	8	551927	551934	25 %	0 %	25 %	50 %	378716013
14328	NC_016906	AAC	2	6	551962	551967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378716013
14329	NC_016906	GAG	2	6	551970	551975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378716013
14330	NC_016906	CTG	2	6	552045	552050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716013
14331	NC_016906	CTG	2	6	552069	552074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14332	NC_016906	CGA	2	6	552114	552119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716014
14333	NC_016906	GC	3	6	552183	552188	0 %	0 %	50 %	50 %	378716014
14334	NC_016906	CGC	2	6	552211	552216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716014
14335	NC_016906	TCG	2	6	552254	552259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716014
14336	NC_016906	TCGC	2	8	552344	552351	0 %	25 %	25 %	50 %	378716014
14337	NC_016906	GTC	2	6	552463	552468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716014
14338	NC_016906	GTG	2	6	552480	552485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716014
14339	NC_016906	CAGAT	2	10	552488	552497	40 %	20 %	20 %	20 %	378716014
14340	NC_016906	GGT	2	6	552514	552519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378716014
14341	NC_016906	ATTG	2	8	552589	552596	25 %	50 %	25 %	0 %	378716014
14342	NC_016906	GAT	2	6	552689	552694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378716015
14343	NC_016906	CGC	2	6	552784	552789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716015
14344	NC_016906	CAC	2	6	552800	552805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716015
14345	NC_016906	CGG	2	6	552883	552888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716015
14346	NC_016906	CGA	2	6	552901	552906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716015
14347	NC_016906	CCG	2	6	552912	552917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716015
14348	NC_016906	CAT	2	6	552941	552946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716015
14349	NC_016906	GC	3	6	552948	552953	0 %	0 %	50 %	50 %	378716015
14350	NC_016906	ATG	2	6	552990	552995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378716015
14351	NC_016906	CTC	2	6	553004	553009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378716015
14352	NC_016906	GAC	2	6	553015	553020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716015
14353	NC_016906	CGG	2	6	553030	553035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716015
14354	NC_016906	CAC	2	6	553087	553092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378716015
14355	NC_016906	GAAC	2	8	553109	553116	50 %	0 %	25 %	25 %	378716015
14356	NC_016906	CCG	2	6	553132	553137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716015
14357	NC_016906	CGA	2	6	553138	553143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716015
14358	NC_016906	GCC	2	6	553287	553292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716015
14359	NC_016906	CGCGG	2	10	553303	553312	0 %	0 %	60 %	40 %	378716015
14360	NC_016906	CTC	2	6	553322	553327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378716015
14361	NC_016906	TCG	2	6	553360	553365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716015
14362	NC_016906	GGC	2	6	553373	553378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378716015
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14371	NC_016906	GTC	2	6	553577	553582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378716015
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14376	NC_016906	CACG	2	8	553702	553709	25 %	0 %	25 %	50 %	378716015
14377	NC_016906	CGA	3	9	553729	553737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716015
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14381	NC_016906	CGG	2	6	553811	553816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14382	NC_016906	TCAA	2	8	553865	553872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14383	NC_016906	TG	3	6	553873	553878	0 %	50 %	50 %	0 %	378716016
14384	NC_016906	CG	3	6	553882	553887	0 %	0 %	50 %	50 %	378716016
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14432	NC_016906	GGA	2	6	555930	555935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14433	NC_016906	CGA	2	6	555968	555973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716018
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14472	NC_016906	TCC	2	6	557381	557386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14473	NC_016906	GAA	2	6	557404	557409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14474	NC_016906	GC	3	6	557454	557459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14475	NC_016906	TGC	2	6	557475	557480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14477	NC_016906	CGA	2	6	557577	557582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378716020
14478	NC_016906	GCC	2	6	557611	557616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716020
14479	NC_016906	CGC	2	6	557633	557638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378716020
14480	NC_016906	CTA	2	6	557649	557654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378716020
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14482	NC_016906	TCT	2	6	557735	557740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378716020
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