MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 149899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016906	AGGC	2	8	502276	502283	25 %	0 %	50 %	25 %	378715973
13002	NC_016906	GCA	2	6	502287	502292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715973
13003	NC_016906	GCG	2	6	502341	502346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715973
13004	NC_016906	TGC	2	6	502385	502390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715973
13005	NC_016906	CA	4	8	502441	502448	50 %	0 %	0 %	50 %	378715973
13006	NC_016906	ACA	2	6	502460	502465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715973
13007	NC_016906	GACG	2	8	502584	502591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_016906	GCG	2	6	502610	502615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016906	ACT	2	6	502632	502637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_016906	ACT	2	6	502661	502666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_016906	CCA	2	6	502705	502710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715974
13012	NC_016906	GTG	2	6	502797	502802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715974
13013	NC_016906	CGT	2	6	502817	502822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13014	NC_016906	CGC	2	6	502823	502828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13015	NC_016906	GTC	2	6	503004	503009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13016	NC_016906	CGA	2	6	503014	503019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13017	NC_016906	CG	3	6	503023	503028	0 %	0 %	50 %	50 %	378715974
13018	NC_016906	TCA	2	6	503059	503064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715974
13019	NC_016906	CGG	2	6	503075	503080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715974
13020	NC_016906	AAC	2	6	503128	503133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715974
13021	NC_016906	CGG	2	6	503180	503185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715974
13022	NC_016906	CACG	2	8	503193	503200	25 %	0 %	25 %	50 %	378715974
13023	NC_016906	TCG	2	6	503203	503208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13024	NC_016906	CGC	2	6	503222	503227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13025	NC_016906	CCG	2	6	503236	503241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13026	NC_016906	GCC	2	6	503244	503249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13027	NC_016906	GCC	2	6	503304	503309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13028	NC_016906	ACC	2	6	503337	503342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715974
13029	NC_016906	TGA	2	6	503365	503370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715974
13030	NC_016906	CGC	2	6	503384	503389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13031	NC_016906	TCG	2	6	503392	503397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13032	NC_016906	GCCGTC	2	12	503400	503411	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378715974
13033	NC_016906	CGG	2	6	503429	503434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715974
13034	NC_016906	CCG	2	6	503465	503470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13035	NC_016906	CTG	2	6	503472	503477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
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13037	NC_016906	GCAG	2	8	503538	503545	25 %	0 %	50 %	25 %	378715974
13038	NC_016906	CGA	2	6	503549	503554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13039	NC_016906	ACT	2	6	503608	503613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715974
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13042	NC_016906	TGC	3	9	503758	503766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
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13044	NC_016906	TCG	2	6	503827	503832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13045	NC_016906	ATC	2	6	503874	503879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715974
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13047	NC_016906	CTG	2	6	503892	503897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
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13050	NC_016906	GCC	2	6	503964	503969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
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13053	NC_016906	TGC	2	6	504040	504045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13054	NC_016906	CGC	2	6	504062	504067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13055	NC_016906	GTC	2	6	504120	504125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
13056	NC_016906	ATC	2	6	504126	504131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715974
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13060	NC_016906	CGC	2	6	504270	504275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715974
13061	NC_016906	TGC	2	6	504286	504291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
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13068	NC_016906	GC	3	6	504507	504512	0 %	0 %	50 %	50 %	378715974
13069	NC_016906	CTG	2	6	504549	504554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715974
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13089	NC_016906	CCT	2	6	505312	505317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715974
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13093	NC_016906	GTCG	2	8	505451	505458	0 %	25 %	50 %	25 %	378715974
13094	NC_016906	CGGAC	2	10	505472	505481	20 %	0 %	40 %	40 %	378715974
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13119	NC_016906	GCC	2	6	506518	506523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715975
13120	NC_016906	CGA	2	6	506550	506555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715975
13121	NC_016906	CG	3	6	506562	506567	0 %	0 %	50 %	50 %	378715975
13122	NC_016906	ATC	2	6	506575	506580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715975
13123	NC_016906	GT	3	6	506582	506587	0 %	50 %	50 %	0 %	378715975
13124	NC_016906	CTC	2	6	506631	506636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715975
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13126	NC_016906	GAT	2	6	506721	506726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715975
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13128	NC_016906	CGC	3	9	506764	506772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715975
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13130	NC_016906	ACG	2	6	506807	506812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715975
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13132	NC_016906	GCC	2	6	506835	506840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715975
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13134	NC_016906	GTC	2	6	506884	506889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715975
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13139	NC_016906	TGGC	2	8	507027	507034	0 %	25 %	50 %	25 %	378715975
13140	NC_016906	GCT	2	6	507090	507095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715975
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13142	NC_016906	GCCTTC	2	12	507199	507210	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378715975
13143	NC_016906	TGGC	2	8	507220	507227	0 %	25 %	50 %	25 %	378715975
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13149	NC_016906	CGG	2	6	507389	507394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715975
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13151	NC_016906	CTG	2	6	507496	507501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715975
13152	NC_016906	TCG	2	6	507569	507574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715975
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13158	NC_016906	GTGCTG	2	12	507697	507708	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378715975
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13190	NC_016906	CGT	2	6	508971	508976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715975
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13201	NC_016906	GC	3	6	509449	509454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13202	NC_016906	GAG	2	6	509490	509495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13211	NC_016906	GGCCG	2	10	509786	509795	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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13231	NC_016906	TGG	2	6	510312	510317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715977
13232	NC_016906	CGA	2	6	510363	510368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715977
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13234	NC_016906	CGA	2	6	510483	510488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715977
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13473	NC_016906	CA	3	6	519628	519633	50 %	0 %	0 %	50 %	378715984
13474	NC_016906	CG	3	6	519648	519653	0 %	0 %	50 %	50 %	378715984
13475	NC_016906	CGT	2	6	519675	519680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13476	NC_016906	CGA	2	6	519682	519687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13477	NC_016906	CAT	2	6	519697	519702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715984
13478	NC_016906	GGA	2	6	519703	519708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715984
13479	NC_016906	CAC	3	9	519739	519747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715984
13480	NC_016906	GCT	2	6	519748	519753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13481	NC_016906	ACG	2	6	519759	519764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13482	NC_016906	ACCT	2	8	519765	519772	25 %	25 %	0 %	50 %	378715984
13483	NC_016906	GCG	2	6	519773	519778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715984
13484	NC_016906	G	6	6	519813	519818	0 %	0 %	100 %	0 %	378715984
13485	NC_016906	GGACG	2	10	519836	519845	20 %	0 %	60 %	20 %	378715984
13486	NC_016906	CG	3	6	519919	519924	0 %	0 %	50 %	50 %	378715984
13487	NC_016906	CAG	2	6	519938	519943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13488	NC_016906	GTC	2	6	519948	519953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715984
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13490	NC_016906	CAC	2	6	519978	519983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715984
13491	NC_016906	CG	3	6	520002	520007	0 %	0 %	50 %	50 %	378715984
13492	NC_016906	TCG	2	6	520012	520017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13493	NC_016906	ACCG	2	8	520022	520029	25 %	0 %	25 %	50 %	378715984
13494	NC_016906	CGC	2	6	520096	520101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715984
13495	NC_016906	GTC	2	6	520109	520114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715984
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13497	NC_016906	CGG	2	6	520222	520227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715984
13498	NC_016906	GCGT	2	8	520277	520284	0 %	25 %	50 %	25 %	378715984
13499	NC_016906	CGA	2	6	520327	520332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715984
13500	NC_016906	CGA	2	6	520396	520401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715984

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