MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 149899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016906	AGC	2	6	424740	424745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_016906	CTGC	2	8	424766	424773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_016906	TC	3	6	424922	424927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_016906	GAT	2	6	425035	425040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715912
11005	NC_016906	GTC	2	6	425053	425058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11006	NC_016906	GCG	2	6	425072	425077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715912
11007	NC_016906	GATGGT	2	12	425101	425112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378715912
11008	NC_016906	GGT	2	6	425128	425133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715912
11009	NC_016906	GCG	2	6	425192	425197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715912
11010	NC_016906	GGT	2	6	425235	425240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715912
11011	NC_016906	TGG	2	6	425306	425311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715912
11012	NC_016906	TGG	2	6	425352	425357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715912
11013	NC_016906	TGC	2	6	425517	425522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11014	NC_016906	ACC	2	6	425555	425560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715912
11015	NC_016906	GGC	2	6	425565	425570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715912
11016	NC_016906	TCT	2	6	425685	425690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715912
11017	NC_016906	ATGA	2	8	425699	425706	50 %	25 %	25 %	0 %	378715912
11018	NC_016906	CGC	2	6	425737	425742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715912
11019	NC_016906	ATC	2	6	425747	425752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715912
11020	NC_016906	ACC	2	6	425765	425770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715912
11021	NC_016906	CAT	2	6	425818	425823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715912
11022	NC_016906	TTG	2	6	425840	425845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715912
11023	NC_016906	CAT	2	6	425860	425865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715912
11024	NC_016906	GTC	2	6	425984	425989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11025	NC_016906	GTG	2	6	426008	426013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715912
11026	NC_016906	ACG	2	6	426063	426068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11027	NC_016906	CGAGT	2	10	426148	426157	20 %	20 %	40 %	20 %	378715912
11028	NC_016906	GAT	2	6	426172	426177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715912
11029	NC_016906	TCG	2	6	426239	426244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11030	NC_016906	TGC	3	9	426341	426349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715912
11031	NC_016906	GCC	2	6	426386	426391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715912
11032	NC_016906	CAC	2	6	426441	426446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715912
11033	NC_016906	CCG	2	6	426468	426473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715912
11034	NC_016906	CAG	2	6	426516	426521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_016906	CCGT	2	8	426531	426538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_016906	GAA	2	6	426673	426678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_016906	GGA	2	6	426697	426702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_016906	TCA	2	6	426727	426732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715913
11039	NC_016906	CGA	2	6	426736	426741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715913
11040	NC_016906	TCA	2	6	426759	426764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715913
11041	NC_016906	GCA	2	6	426792	426797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715913
11042	NC_016906	CGA	2	6	427040	427045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_016906	TGG	2	6	427155	427160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_016906	TGC	2	6	427197	427202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_016906	CGG	2	6	427242	427247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_016906	TTG	2	6	427272	427277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_016906	CCG	2	6	427318	427323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_016906	GCGGT	2	10	427340	427349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11049	NC_016906	GA	3	6	427355	427360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_016906	TCG	2	6	427404	427409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_016906	TTG	2	6	427423	427428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_016906	GGA	2	6	427507	427512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_016906	CGAC	2	8	427529	427536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_016906	ACG	2	6	427654	427659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_016906	GACG	2	8	427668	427675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_016906	TCG	2	6	427688	427693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_016906	GTT	2	6	427731	427736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_016906	TGGC	2	8	427828	427835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11059	NC_016906	CGC	2	6	427879	427884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_016906	TTG	2	6	427901	427906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_016906	GTG	2	6	427912	427917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_016906	AG	3	6	428105	428110	50 %	0 %	50 %	0 %	378715914
11063	NC_016906	CGG	2	6	428122	428127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715914
11064	NC_016906	TGA	2	6	428265	428270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715914
11065	NC_016906	CCA	2	6	428288	428293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715914
11066	NC_016906	CGA	2	6	428419	428424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_016906	CTCA	2	8	428491	428498	25 %	25 %	0 %	50 %	378715915
11068	NC_016906	GTG	2	6	428591	428596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715915
11069	NC_016906	TGG	2	6	428608	428613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715915
11070	NC_016906	TCTG	2	8	428674	428681	0 %	50 %	25 %	25 %	378715915
11071	NC_016906	AGC	2	6	428709	428714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715915
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11073	NC_016906	TGG	2	6	428759	428764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715915
11074	NC_016906	TCA	2	6	428808	428813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715915
11075	NC_016906	TCG	2	6	428877	428882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715915
11076	NC_016906	GTC	2	6	428897	428902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715915
11077	NC_016906	CAA	2	6	429071	429076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715915
11078	NC_016906	CGA	2	6	429109	429114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715915
11079	NC_016906	AG	3	6	429231	429236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_016906	GCC	2	6	429240	429245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11081	NC_016906	CAG	3	9	429281	429289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_016906	ACC	2	6	429330	429335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_016906	GTC	2	6	429367	429372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715916
11084	NC_016906	CCGG	2	8	429409	429416	0 %	0 %	50 %	50 %	378715916
11085	NC_016906	CTGC	2	8	429484	429491	0 %	25 %	25 %	50 %	378715916
11086	NC_016906	ATC	2	6	429515	429520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715916
11087	NC_016906	TGA	2	6	429522	429527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715916
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11089	NC_016906	GAT	2	6	429666	429671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715916
11090	NC_016906	TGA	2	6	429703	429708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715916
11091	NC_016906	GCG	2	6	429731	429736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_016906	CG	4	8	430000	430007	0 %	0 %	50 %	50 %	378715917
11093	NC_016906	GGT	3	9	430047	430055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715917
11094	NC_016906	TGC	2	6	430065	430070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715917
11095	NC_016906	CGGA	2	8	430180	430187	25 %	0 %	50 %	25 %	378715917
11096	NC_016906	CTG	2	6	430227	430232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715917
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11101	NC_016906	TTGA	2	8	430628	430635	25 %	50 %	25 %	0 %	378715917
11102	NC_016906	CGT	2	6	430640	430645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715917
11103	NC_016906	CGC	2	6	430657	430662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715917
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11105	NC_016906	CAGA	2	8	430685	430692	50 %	0 %	25 %	25 %	378715917
11106	NC_016906	GC	3	6	430751	430756	0 %	0 %	50 %	50 %	378715917
11107	NC_016906	ACTG	2	8	430763	430770	25 %	25 %	25 %	25 %	378715917
11108	NC_016906	GGTT	2	8	430774	430781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_016906	TGC	2	6	430782	430787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_016906	CTG	2	6	430812	430817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715918
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11112	NC_016906	CTCG	2	8	430866	430873	0 %	25 %	25 %	50 %	378715918
11113	NC_016906	CGG	2	6	430890	430895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715918
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11117	NC_016906	CGA	2	6	430974	430979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715918
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11119	NC_016906	CTGA	2	8	431027	431034	25 %	25 %	25 %	25 %	378715918
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11121	NC_016906	TCG	2	6	431082	431087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715918
11122	NC_016906	CCG	2	6	431102	431107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715918
11123	NC_016906	GCT	2	6	431140	431145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715918
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11242	NC_016906	GGC	2	6	435820	435825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715923
11243	NC_016906	TG	3	6	435830	435835	0 %	50 %	50 %	0 %	378715923
11244	NC_016906	CGT	2	6	435840	435845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715923
11245	NC_016906	CGA	2	6	435900	435905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715923
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11255	NC_016906	GGTT	2	8	436336	436343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_016906	GTTGG	2	10	436375	436384	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11257	NC_016906	AGCGC	2	10	436463	436472	20 %	0 %	40 %	40 %	378715924
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11481	NC_016906	GCG	2	6	444574	444579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11482	NC_016906	G	6	6	444628	444633	0 %	0 %	100 %	0 %	378715933
11483	NC_016906	GGCCG	2	10	444640	444649	0 %	0 %	60 %	40 %	378715933
11484	NC_016906	GCC	2	6	444661	444666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715933
11485	NC_016906	CCG	2	6	444671	444676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715933
11486	NC_016906	AC	3	6	444693	444698	50 %	0 %	0 %	50 %	378715933
11487	NC_016906	TCG	2	6	444713	444718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11488	NC_016906	TGT	2	6	444801	444806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715933
11489	NC_016906	GAC	2	6	444811	444816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11490	NC_016906	CGT	2	6	444834	444839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11491	NC_016906	ACC	2	6	444848	444853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715933
11492	NC_016906	ATC	2	6	444854	444859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715933
11493	NC_016906	TGC	2	6	444871	444876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11494	NC_016906	CGT	2	6	444945	444950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11495	NC_016906	GCG	2	6	444977	444982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715933
11496	NC_016906	GAT	2	6	444997	445002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715933
11497	NC_016906	CAC	2	6	445003	445008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715933
11498	NC_016906	CGC	2	6	445015	445020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715933
11499	NC_016906	CGT	2	6	445030	445035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715933
11500	NC_016906	GCG	2	6	445094	445099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715933

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