MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 149899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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110002	NC_016906	GTC	2	6	4153705	4153710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719133
110003	NC_016906	TCG	2	6	4153742	4153747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719133
110004	NC_016906	GAG	2	6	4153759	4153764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378719133
110005	NC_016906	CGG	2	6	4153779	4153784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719133
110006	NC_016906	CCG	2	6	4153835	4153840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719133
110007	NC_016906	CGGT	2	8	4153895	4153902	0 %	25 %	50 %	25 %	378719133
110008	NC_016906	AGC	2	6	4153928	4153933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719133
110009	NC_016906	CG	3	6	4154001	4154006	0 %	0 %	50 %	50 %	378719133
110010	NC_016906	CCG	2	6	4154028	4154033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719133
110011	NC_016906	GCC	2	6	4154053	4154058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719133
110012	NC_016906	CCG	2	6	4154080	4154085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719133
110013	NC_016906	CGA	2	6	4154115	4154120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719133
110014	NC_016906	GGTC	2	8	4154124	4154131	0 %	25 %	50 %	25 %	378719133
110015	NC_016906	CTG	2	6	4154137	4154142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719133
110016	NC_016906	CGG	2	6	4154226	4154231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719133
110017	NC_016906	GCGG	2	8	4154242	4154249	0 %	0 %	75 %	25 %	378719133
110018	NC_016906	GTGTCG	2	12	4154276	4154287	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378719133
110019	NC_016906	CGG	2	6	4154346	4154351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719133
110020	NC_016906	GCG	2	6	4154420	4154425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110021	NC_016906	GTC	2	6	4154440	4154445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110022	NC_016906	CAA	2	6	4154559	4154564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110023	NC_016906	GAGG	2	8	4154579	4154586	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110024	NC_016906	CAG	2	6	4154597	4154602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719134
110025	NC_016906	CCA	2	6	4154612	4154617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378719134
110026	NC_016906	GGCCCG	2	12	4154671	4154682	0 %	0 %	50 %	50 %	378719134
110027	NC_016906	GAT	2	6	4154691	4154696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378719134
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110030	NC_016906	GAT	2	6	4154917	4154922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378719134
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110032	NC_016906	GGC	2	6	4155103	4155108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719134
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110034	NC_016906	CGC	2	6	4155183	4155188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719134
110035	NC_016906	GAT	2	6	4155219	4155224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378719134
110036	NC_016906	TAC	2	6	4155295	4155300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719134
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110038	NC_016906	GACTCG	2	12	4155380	4155391	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378719134
110039	NC_016906	ACG	2	6	4155416	4155421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719134
110040	NC_016906	AAG	2	6	4155442	4155447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378719134
110041	NC_016906	CGA	2	6	4155480	4155485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719134
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110043	NC_016906	CAC	2	6	4155620	4155625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378719134
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110047	NC_016906	CGA	2	6	4155741	4155746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110048	NC_016906	CGT	2	6	4155747	4155752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110049	NC_016906	CGT	2	6	4155763	4155768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110050	NC_016906	CCG	2	6	4155925	4155930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110051	NC_016906	GTC	2	6	4155978	4155983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719135
110052	NC_016906	ATC	2	6	4156053	4156058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719135
110053	NC_016906	CGA	2	6	4156124	4156129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719135
110054	NC_016906	TCG	2	6	4156141	4156146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719135
110055	NC_016906	CGG	2	6	4156154	4156159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719135
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110066	NC_016906	GC	4	8	4156716	4156723	0 %	0 %	50 %	50 %	378719135
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110072	NC_016906	TGC	2	6	4156924	4156929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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110099	NC_016906	GAG	2	6	4158025	4158030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378719136
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110102	NC_016906	TG	3	6	4158123	4158128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110103	NC_016906	CCTA	2	8	4158131	4158138	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110104	NC_016906	TCG	2	6	4158153	4158158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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110106	NC_016906	CGA	2	6	4158195	4158200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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110112	NC_016906	CTC	2	6	4158379	4158384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378719137
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110231	NC_016906	GAG	2	6	4163216	4163221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378719143
110232	NC_016906	GGCA	2	8	4163275	4163282	25 %	0 %	50 %	25 %	378719143
110233	NC_016906	GCC	2	6	4163292	4163297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719143
110234	NC_016906	TCG	2	6	4163301	4163306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719143
110235	NC_016906	TCG	2	6	4163322	4163327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719143
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110250	NC_016906	TTC	2	6	4163792	4163797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378719143
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110258	NC_016906	CG	3	6	4164035	4164040	0 %	0 %	50 %	50 %	378719144
110259	NC_016906	GC	3	6	4164048	4164053	0 %	0 %	50 %	50 %	378719144
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110287	NC_016906	CG	3	6	4164752	4164757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110288	NC_016906	TCA	2	6	4164809	4164814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719145
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110327	NC_016906	ACCA	2	8	4166119	4166126	50 %	0 %	0 %	50 %	378719146
110328	NC_016906	ATGT	2	8	4166138	4166145	25 %	50 %	25 %	0 %	378719146
110329	NC_016906	CGC	2	6	4166147	4166152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719146
110330	NC_016906	CACCGT	2	12	4166190	4166201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378719146
110331	NC_016906	CGT	2	6	4166228	4166233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719146
110332	NC_016906	CGT	2	6	4166330	4166335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719146
110333	NC_016906	AGC	2	6	4166344	4166349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719146
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110335	NC_016906	G	6	6	4166386	4166391	0 %	0 %	100 %	0 %	378719146
110336	NC_016906	CCG	2	6	4166398	4166403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719146
110337	NC_016906	TCA	2	6	4166408	4166413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719146
110338	NC_016906	TCG	2	6	4166429	4166434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719146
110339	NC_016906	CGG	2	6	4166507	4166512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719146
110340	NC_016906	ACC	2	6	4166515	4166520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378719146
110341	NC_016906	GGTCAG	2	12	4166526	4166537	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378719146
110342	NC_016906	CGC	2	6	4166538	4166543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378719146
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110344	NC_016906	GC	3	6	4166566	4166571	0 %	0 %	50 %	50 %	378719146
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110461	NC_016906	CGG	2	6	4170393	4170398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719152
110462	NC_016906	TCA	2	6	4170419	4170424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719152
110463	NC_016906	GC	4	8	4170493	4170500	0 %	0 %	50 %	50 %	378719152
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110465	NC_016906	ACG	2	6	4170604	4170609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719152
110466	NC_016906	TCG	2	6	4170613	4170618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719152
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110481	NC_016906	GGT	2	6	4171025	4171030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378719152
110482	NC_016906	CTC	2	6	4171038	4171043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378719152
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110484	NC_016906	GAA	2	6	4171071	4171076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378719152
110485	NC_016906	TCA	2	6	4171130	4171135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378719152
110486	NC_016906	GCG	2	6	4171162	4171167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378719152
110487	NC_016906	GC	3	6	4171187	4171192	0 %	0 %	50 %	50 %	378719152
110488	NC_016906	CGA	2	6	4171222	4171227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378719152
110489	NC_016906	GTGGCG	2	12	4171322	4171333	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378719152
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110491	NC_016906	GCA	2	6	4171393	4171398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110492	NC_016906	CA	3	6	4171436	4171441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110493	NC_016906	CCGG	2	8	4171489	4171496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110494	NC_016906	CG	4	8	4171523	4171530	0 %	0 %	50 %	50 %	378719153
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110500	NC_016906	CGT	2	6	4171652	4171657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378719153

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