MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 80725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_016041	CAATG	2	10	1129591	1129600	40 %	20 %	20 %	20 %	348028476
22003	NC_016041	CCG	2	6	1129658	1129663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348028476
22004	NC_016041	GC	3	6	1129678	1129683	0 %	0 %	50 %	50 %	348028476
22005	NC_016041	CAA	2	6	1129748	1129753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348028476
22006	NC_016041	CAA	2	6	1129850	1129855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348028476
22007	NC_016041	GGA	2	6	1129960	1129965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348028476
22008	NC_016041	CAA	2	6	1129986	1129991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348028476
22009	NC_016041	GCA	2	6	1130143	1130148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348028476
22010	NC_016041	CAT	2	6	1130210	1130215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028476
22011	NC_016041	TTG	2	6	1130243	1130248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348028476
22012	NC_016041	AGC	2	6	1130267	1130272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348028476
22013	NC_016041	ATT	3	9	1130328	1130336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22014	NC_016041	CTT	2	6	1130337	1130342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22015	NC_016041	ATA	2	6	1130390	1130395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22016	NC_016041	AGCT	2	8	1130411	1130418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22017	NC_016041	TCA	2	6	1130483	1130488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028477
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22020	NC_016041	T	6	6	1130590	1130595	0 %	100 %	0 %	0 %	348028477
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22041	NC_016041	TTA	2	6	1131612	1131617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22042	NC_016041	TA	4	8	1131667	1131674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22043	NC_016041	CT	3	6	1131687	1131692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22044	NC_016041	TAAA	2	8	1131748	1131755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22045	NC_016041	TAAA	2	8	1131759	1131766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22046	NC_016041	ATT	2	6	1131810	1131815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348028478
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22062	NC_016041	GCTT	2	8	1132823	1132830	0 %	50 %	25 %	25 %	348028478
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22118	NC_016041	CAT	2	6	1135895	1135900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028480
22119	NC_016041	A	6	6	1136072	1136077	100 %	0 %	0 %	0 %	348028480
22120	NC_016041	TTG	2	6	1136090	1136095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348028480
22121	NC_016041	GAA	2	6	1136120	1136125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348028480
22122	NC_016041	CTT	2	6	1136296	1136301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348028480
22123	NC_016041	ATC	2	6	1136321	1136326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028480
22124	NC_016041	AAT	2	6	1136397	1136402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348028480
22125	NC_016041	TAAT	3	12	1136399	1136410	50 %	50 %	0 %	0 %	348028480
22126	NC_016041	T	6	6	1136410	1136415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22127	NC_016041	ACA	2	6	1136450	1136455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22128	NC_016041	CA	3	6	1136454	1136459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22129	NC_016041	AAG	2	6	1136567	1136572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22130	NC_016041	CAAA	2	8	1136737	1136744	75 %	0 %	0 %	25 %	348028481
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22133	NC_016041	C	6	6	1136817	1136822	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22134	NC_016041	TTG	2	6	1136971	1136976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348028482
22135	NC_016041	T	8	8	1136984	1136991	0 %	100 %	0 %	0 %	348028482
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22141	NC_016041	CGTTT	2	10	1137474	1137483	0 %	60 %	20 %	20 %	348028482
22142	NC_016041	GCT	2	6	1137596	1137601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348028483
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22145	NC_016041	TGC	2	6	1137701	1137706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348028483
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22153	NC_016041	GAA	2	6	1138134	1138139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348028483
22154	NC_016041	CAT	2	6	1138151	1138156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028483
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22156	NC_016041	CTT	2	6	1138391	1138396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348028483
22157	NC_016041	ACTCTG	2	12	1138430	1138441	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	348028483
22158	NC_016041	TAT	2	6	1138569	1138574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22159	NC_016041	ATA	2	6	1138583	1138588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22160	NC_016041	ATT	2	6	1138611	1138616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348028484
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22173	NC_016041	T	7	7	1139269	1139275	0 %	100 %	0 %	0 %	348028484
22174	NC_016041	CAATA	2	10	1139321	1139330	60 %	20 %	0 %	20 %	348028484
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22177	NC_016041	T	6	6	1139501	1139506	0 %	100 %	0 %	0 %	348028485
22178	NC_016041	T	6	6	1139521	1139526	0 %	100 %	0 %	0 %	348028485
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22211	NC_016041	AAAT	2	8	1141206	1141213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22212	NC_016041	GC	3	6	1141233	1141238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22213	NC_016041	CAA	2	6	1141246	1141251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22214	NC_016041	GAA	2	6	1141262	1141267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22215	NC_016041	TTTA	2	8	1141272	1141279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22216	NC_016041	T	7	7	1141280	1141286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22217	NC_016041	CCG	2	6	1141324	1141329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22218	NC_016041	TCAATA	2	12	1141348	1141359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	348028486
22219	NC_016041	T	6	6	1141424	1141429	0 %	100 %	0 %	0 %	348028486
22220	NC_016041	GCA	2	6	1141514	1141519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348028486
22221	NC_016041	TTA	2	6	1141522	1141527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348028486
22222	NC_016041	AGT	2	6	1141550	1141555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348028486
22223	NC_016041	TA	3	6	1141629	1141634	50 %	50 %	0 %	0 %	348028486
22224	NC_016041	ATA	2	6	1141648	1141653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348028486
22225	NC_016041	ACG	2	6	1141723	1141728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348028486
22226	NC_016041	CTG	2	6	1141762	1141767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348028486
22227	NC_016041	GCC	2	6	1141791	1141796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348028486
22228	NC_016041	GAG	2	6	1141802	1141807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348028486
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22230	NC_016041	GCAT	2	8	1141893	1141900	25 %	25 %	25 %	25 %	348028486
22231	NC_016041	ATA	2	6	1141927	1141932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348028486
22232	NC_016041	ATA	2	6	1142002	1142007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348028486
22233	NC_016041	TAC	2	6	1142042	1142047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348028486
22234	NC_016041	A	6	6	1142092	1142097	100 %	0 %	0 %	0 %	348028487
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22236	NC_016041	TGG	2	6	1142238	1142243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348028487
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22353	NC_016041	TTAT	2	8	1148423	1148430	25 %	75 %	0 %	0 %	348028492
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22356	NC_016041	CAGA	2	8	1148497	1148504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22357	NC_016041	GACT	2	8	1148513	1148520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22358	NC_016041	T	9	9	1148528	1148536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22359	NC_016041	ATT	2	6	1148542	1148547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22360	NC_016041	T	8	8	1148550	1148557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22361	NC_016041	AG	3	6	1148616	1148621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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22462	NC_016041	ATG	2	6	1153805	1153810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348028496
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22467	NC_016041	GCCA	2	8	1153907	1153914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22468	NC_016041	TAG	2	6	1153915	1153920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22469	NC_016041	GCTA	2	8	1154071	1154078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22470	NC_016041	TCAA	2	8	1154174	1154181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22471	NC_016041	CCTT	2	8	1154198	1154205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22472	NC_016041	A	9	9	1154253	1154261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22473	NC_016041	T	6	6	1154275	1154280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22475	NC_016041	GCT	2	6	1154444	1154449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348028497
22476	NC_016041	CTT	2	6	1154457	1154462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348028497
22477	NC_016041	GCT	2	6	1154468	1154473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348028497
22478	NC_016041	GCG	2	6	1154492	1154497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348028497
22479	NC_016041	ACGT	2	8	1154514	1154521	25 %	25 %	25 %	25 %	348028497
22480	NC_016041	A	6	6	1154696	1154701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22481	NC_016041	TTAT	2	8	1154770	1154777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22482	NC_016041	AAT	2	6	1154851	1154856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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