MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 1856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015665	GGC	2	6	45245	45250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233508
1002	NC_015665	CCA	3	9	45261	45269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233508
1003	NC_015665	CGAA	2	8	45372	45379	50 %	0 %	25 %	25 %	336233508
1004	NC_015665	TGCC	2	8	45465	45472	0 %	25 %	25 %	50 %	336233508
1005	NC_015665	T	6	6	45478	45483	0 %	100 %	0 %	0 %	336233508
1006	NC_015665	A	6	6	45531	45536	100 %	0 %	0 %	0 %	336233508
1007	NC_015665	GAT	2	6	45593	45598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233508
1008	NC_015665	CTC	2	6	45621	45626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233508
1009	NC_015665	GAGC	2	8	45634	45641	25 %	0 %	50 %	25 %	336233508
1010	NC_015665	GCGA	2	8	45662	45669	25 %	0 %	50 %	25 %	336233508
1011	NC_015665	CGT	3	9	45673	45681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233508
1012	NC_015665	GTT	2	6	45682	45687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233508
1013	NC_015665	GAA	2	6	45845	45850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233508
1014	NC_015665	CGAA	2	8	45858	45865	50 %	0 %	25 %	25 %	336233508
1015	NC_015665	TGA	2	6	45925	45930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233508
1016	NC_015665	A	6	6	46033	46038	100 %	0 %	0 %	0 %	336233509
1017	NC_015665	GTT	2	6	46089	46094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233509
1018	NC_015665	GAA	2	6	46101	46106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233509
1019	NC_015665	AAC	2	6	46107	46112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233509
1020	NC_015665	AAGA	2	8	46114	46121	75 %	0 %	25 %	0 %	336233509
1021	NC_015665	GAA	2	6	46125	46130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233509
1022	NC_015665	AAG	2	6	46131	46136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233509
1023	NC_015665	GAAA	2	8	46140	46147	75 %	0 %	25 %	0 %	336233509
1024	NC_015665	TTC	2	6	46204	46209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233509
1025	NC_015665	ATTT	2	8	46221	46228	25 %	75 %	0 %	0 %	336233509
1026	NC_015665	TGAA	2	8	46258	46265	50 %	25 %	25 %	0 %	336233509
1027	NC_015665	A	6	6	46268	46273	100 %	0 %	0 %	0 %	336233509
1028	NC_015665	TGC	2	6	46286	46291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015665	CGC	2	6	46301	46306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015665	TGC	2	6	46308	46313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015665	CGTTT	2	10	46348	46357	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_015665	GCT	2	6	46394	46399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015665	CAAC	2	8	46478	46485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_015665	TCT	2	6	46493	46498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015665	TTC	2	6	46500	46505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015665	TCT	2	6	46517	46522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015665	C	6	6	46578	46583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_015665	TCA	2	6	46652	46657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233510
1039	NC_015665	CGGG	2	8	46678	46685	0 %	0 %	75 %	25 %	336233510
1040	NC_015665	GCC	2	6	46723	46728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233510
1041	NC_015665	GAG	2	6	46780	46785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233510
1042	NC_015665	AGA	2	6	46808	46813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233510
1043	NC_015665	AGAA	2	8	46868	46875	75 %	0 %	25 %	0 %	336233510
1044	NC_015665	AGA	2	6	46889	46894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233510
1045	NC_015665	AGA	2	6	46970	46975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233510
1046	NC_015665	GAAA	2	8	47061	47068	75 %	0 %	25 %	0 %	336233510
1047	NC_015665	AAC	2	6	47102	47107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233510
1048	NC_015665	AGGA	2	8	47138	47145	50 %	0 %	50 %	0 %	336233510
1049	NC_015665	TGC	2	6	47274	47279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233510
1050	NC_015665	GACC	2	8	47307	47314	25 %	0 %	25 %	50 %	336233510
1051	NC_015665	CAA	2	6	47315	47320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233510
1052	NC_015665	A	6	6	47323	47328	100 %	0 %	0 %	0 %	336233510
1053	NC_015665	A	6	6	47367	47372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015665	AATA	2	8	47375	47382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015665	TATT	2	8	47401	47408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015665	TTTTC	2	10	47423	47432	0 %	80 %	0 %	20 %	336233511
1057	NC_015665	TTCT	2	8	47438	47445	0 %	75 %	0 %	25 %	336233511
1058	NC_015665	T	7	7	47445	47451	0 %	100 %	0 %	0 %	336233511
1059	NC_015665	TAAT	2	8	47501	47508	50 %	50 %	0 %	0 %	336233511
1060	NC_015665	T	6	6	47536	47541	0 %	100 %	0 %	0 %	336233511
1061	NC_015665	T	6	6	47545	47550	0 %	100 %	0 %	0 %	336233511
1062	NC_015665	ATT	2	6	47552	47557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233511
1063	NC_015665	TC	3	6	47558	47563	0 %	50 %	0 %	50 %	336233511
1064	NC_015665	GAA	2	6	47634	47639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233511
1065	NC_015665	AATA	2	8	47657	47664	75 %	25 %	0 %	0 %	336233511
1066	NC_015665	ATTT	2	8	47677	47684	25 %	75 %	0 %	0 %	336233511
1067	NC_015665	ATC	3	9	47743	47751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233511
1068	NC_015665	A	6	6	47769	47774	100 %	0 %	0 %	0 %	336233511
1069	NC_015665	TTC	2	6	47788	47793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233511
1070	NC_015665	A	7	7	47868	47874	100 %	0 %	0 %	0 %	336233511
1071	NC_015665	TTC	2	6	47875	47880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233511
1072	NC_015665	ATAAA	2	10	47885	47894	80 %	20 %	0 %	0 %	336233511
1073	NC_015665	A	7	7	47946	47952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015665	CTT	2	6	47968	47973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015665	T	6	6	47972	47977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015665	ATT	2	6	48081	48086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015665	TAAT	2	8	48123	48130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015665	ATC	2	6	48215	48220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015665	T	7	7	48251	48257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015665	TTC	2	6	48294	48299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015665	TCAT	2	8	48326	48333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_015665	TAA	2	6	48374	48379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015665	TCC	2	6	48527	48532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015665	GAAC	2	8	48594	48601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_015665	TTG	2	6	48634	48639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015665	TTA	2	6	48660	48665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015665	ATGA	2	8	48760	48767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015665	AAAAAG	2	12	48815	48826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015665	TCA	2	6	48972	48977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015665	CTA	2	6	49066	49071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015665	AATC	2	8	49117	49124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_015665	AGATAT	2	12	49151	49162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015665	TAA	2	6	49166	49171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015665	TAC	2	6	49268	49273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015665	AAT	2	6	49275	49280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015665	CTT	2	6	49283	49288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015665	ATG	2	6	49294	49299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015665	ATG	2	6	49303	49308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015665	ACAA	2	8	49312	49319	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_015665	GA	4	8	49322	49329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015665	CAT	2	6	49388	49393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015665	AT	3	6	49406	49411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015665	A	7	7	49441	49447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015665	ATAA	2	8	49624	49631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015665	TAAAA	2	10	49649	49658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015665	GA	3	6	49667	49672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015665	ATG	2	6	49717	49722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015665	T	7	7	49763	49769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015665	AAT	2	6	49845	49850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015665	A	7	7	49870	49876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015665	C	6	6	49903	49908	0 %	0 %	0 %	100 %	336233512
1112	NC_015665	T	7	7	50021	50027	0 %	100 %	0 %	0 %	336233512
1113	NC_015665	CAA	2	6	50055	50060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233512
1114	NC_015665	TAA	2	6	50101	50106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233512
1115	NC_015665	ATGG	2	8	50165	50172	25 %	25 %	50 %	0 %	336233512
1116	NC_015665	CTT	2	6	50175	50180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233512
1117	NC_015665	AAT	2	6	50215	50220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233512
1118	NC_015665	ACC	2	6	50285	50290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015665	TATAA	2	10	50311	50320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015665	TTA	2	6	50327	50332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015665	ACA	2	6	50337	50342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015665	T	6	6	50345	50350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015665	TCGT	2	8	50455	50462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_015665	TACG	2	8	50479	50486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_015665	T	7	7	50506	50512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015665	AAT	2	6	50646	50651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015665	TCA	2	6	50690	50695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233513
1128	NC_015665	CAGC	2	8	50708	50715	25 %	0 %	25 %	50 %	336233513
1129	NC_015665	GCCG	2	8	50792	50799	0 %	0 %	50 %	50 %	336233513
1130	NC_015665	CCG	2	6	50805	50810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233513
1131	NC_015665	CGAA	2	8	50856	50863	50 %	0 %	25 %	25 %	336233513
1132	NC_015665	GCG	2	6	50877	50882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233513
1133	NC_015665	GAG	2	6	50902	50907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233513
1134	NC_015665	CGG	2	6	50961	50966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233514
1135	NC_015665	TTC	2	6	50972	50977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233514
1136	NC_015665	CGG	2	6	51001	51006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233514
1137	NC_015665	ATG	2	6	51048	51053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233514
1138	NC_015665	ATC	2	6	51059	51064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233514
1139	NC_015665	AGCGC	2	10	51082	51091	20 %	0 %	40 %	40 %	336233514
1140	NC_015665	GC	3	6	51096	51101	0 %	0 %	50 %	50 %	336233514
1141	NC_015665	CCG	2	6	51112	51117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233514
1142	NC_015665	ATC	2	6	51125	51130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233514
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1145	NC_015665	ATC	2	6	51357	51362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233514
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1147	NC_015665	GTA	2	6	51455	51460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233514
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1149	NC_015665	CGA	2	6	51607	51612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233514
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1152	NC_015665	CGA	2	6	51697	51702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233514
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1155	NC_015665	TCG	2	6	51850	51855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233514
1156	NC_015665	GGC	2	6	51898	51903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233514
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1158	NC_015665	C	6	6	52015	52020	0 %	0 %	0 %	100 %	336233514
1159	NC_015665	CTTTT	2	10	52025	52034	0 %	80 %	0 %	20 %	336233514
1160	NC_015665	ATG	2	6	52038	52043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233514
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1162	NC_015665	CAGC	2	8	52087	52094	25 %	0 %	25 %	50 %	336233514
1163	NC_015665	CGA	2	6	52096	52101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233514
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1165	NC_015665	T	6	6	52218	52223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_015665	CGG	2	6	52335	52340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_015665	ACA	2	6	52346	52351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1168	NC_015665	CCGG	2	8	52361	52368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1169	NC_015665	CCGC	2	8	52417	52424	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1170	NC_015665	ACG	2	6	52433	52438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1171	NC_015665	AAC	2	6	52461	52466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1172	NC_015665	CTG	2	6	52471	52476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1173	NC_015665	ATC	2	6	52538	52543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_015665	CAA	2	6	52564	52569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1175	NC_015665	CAGC	2	8	52607	52614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1176	NC_015665	GGC	2	6	52625	52630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1177	NC_015665	GC	3	6	52629	52634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1178	NC_015665	CAG	2	6	52767	52772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233515
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1183	NC_015665	A	6	6	52960	52965	100 %	0 %	0 %	0 %	336233515
1184	NC_015665	GC	3	6	52973	52978	0 %	0 %	50 %	50 %	336233515
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1195	NC_015665	CAG	2	6	53388	53393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233515
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1203	NC_015665	AAAC	2	8	53815	53822	75 %	0 %	0 %	25 %	336233516
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1223	NC_015665	CAG	2	6	54550	54555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233517
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1233	NC_015665	AGC	4	12	55058	55069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233517
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1247	NC_015665	CGGA	2	8	55652	55659	25 %	0 %	50 %	25 %	336233518
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1250	NC_015665	T	6	6	55821	55826	0 %	100 %	0 %	0 %	336233518
1251	NC_015665	CTT	2	6	55861	55866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233518
1252	NC_015665	CCG	2	6	55942	55947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233518
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1255	NC_015665	ATC	2	6	55968	55973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233518
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1257	NC_015665	GCC	2	6	56057	56062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233518
1258	NC_015665	GTTCGC	2	12	56063	56074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233518
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1380	NC_015665	TAT	2	6	61800	61805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_015665	GGC	2	6	61918	61923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1387	NC_015665	CAA	2	6	62055	62060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1388	NC_015665	ACAA	2	8	62074	62081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1389	NC_015665	AAAC	2	8	62096	62103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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