MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 6030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021592	ATT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021592	TTA	2	6	45	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021592	ATT	2	6	101	106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021592	A	7	7	114	120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021592	TTTCA	2	10	145	154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021592	ATT	2	6	168	173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021592	TGC	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021592	ATT	2	6	234	239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021592	TGA	2	6	246	251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021592	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021592	ATT	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021592	ATT	2	6	372	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021592	ATT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021592	AT	3	6	480	485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021592	ATT	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021592	AAT	2	6	552	557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021592	ATT	2	6	575	580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021592	ATT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021592	ATT	2	6	708	713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021592	CAG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021592	ATT	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021592	ATA	2	6	817	822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021592	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021592	T	6	6	857	862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021592	T	7	7	876	882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021592	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021592	TTAAT	2	10	928	937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021592	T	7	7	1006	1012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021592	AT	3	6	1018	1023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021592	ATA	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021592	TA	3	6	1089	1094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021592	T	6	6	1109	1114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021592	ATT	2	6	1222	1227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021592	ATT	2	6	1288	1293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021592	A	6	6	1296	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021592	ATA	2	6	1310	1315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021592	TAAG	2	8	1347	1354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021592	ATTTA	2	10	1359	1368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021592	TAA	2	6	10278	10283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021592	TA	3	6	10287	10292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021592	TTTA	2	8	10300	10307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021592	AT	3	6	10317	10322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021592	TAT	2	6	10345	10350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021592	TA	3	6	10357	10362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021592	T	7	7	10378	10384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021592	ATTTT	2	10	10396	10405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021592	CTT	2	6	10486	10491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021592	GA	3	6	10500	10505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021592	TCT	2	6	10598	10603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021592	TTA	2	6	10662	10667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021592	AT	3	6	10712	10717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021592	TAA	2	6	10733	10738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021592	AGA	2	6	10759	10764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021592	GTT	2	6	10789	10794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021592	AATAA	2	10	10822	10831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021592	TA	3	6	10888	10893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021592	ATT	2	6	13610	13615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021592	GTA	2	6	13626	13631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021592	TAA	2	6	13643	13648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021592	CTAA	2	8	13661	13668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021592	TATTTT	2	12	13696	13707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021592	AGG	2	6	13790	13795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021592	TAA	2	6	13801	13806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021592	A	7	7	13829	13835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021592	TA	3	6	13860	13865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021592	A	6	6	17798	17803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021592	TAT	2	6	17828	17833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021592	A	6	6	17852	17857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021592	AT	3	6	17865	17870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021592	AAT	2	6	17965	17970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021592	AGG	2	6	17977	17982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021592	GAAA	2	8	17985	17992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021592	CTTT	2	8	17999	18006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021592	AAC	2	6	18014	18019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021592	AT	3	6	18022	18027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021592	AGG	2	6	18032	18037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021592	TGAA	2	8	18038	18045	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021592	T	7	7	18215	18221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021592	ATT	2	6	18253	18258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021592	TAA	3	9	18270	18278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021592	GAA	2	6	18280	18285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021592	CAA	2	6	18308	18313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021592	A	6	6	18312	18317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021592	ATT	2	6	18321	18326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021592	TAAAA	2	10	18395	18404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021592	TA	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021592	TAT	2	6	20148	20153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021592	AGG	2	6	20174	20179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021592	TCC	2	6	20218	20223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021592	TAA	2	6	21284	21289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021592	TG	3	6	21293	21298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021592	GAT	2	6	21323	21328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021592	ATT	2	6	21333	21338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021592	A	7	7	21381	21387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021592	AAT	2	6	21396	21401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021592	GAA	2	6	21418	21423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021592	CAAT	2	8	21457	21464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021592	ATA	2	6	21471	21476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021592	TTAA	2	8	21486	21493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021592	TTA	2	6	24328	24333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021592	CCA	2	6	24478	24483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021592	AGAA	2	8	24593	24600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021592	TAA	3	9	24617	24625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021592	TAAAA	2	10	24649	24658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021592	ATT	2	6	24660	24665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021592	TAAT	2	8	24694	24701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021592	ATC	2	6	24713	24718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021592	ATTT	2	8	24764	24771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021592	GGTT	2	8	24839	24846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021592	TCA	2	6	24856	24861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021592	CTTTT	2	10	24974	24983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021592	AT	3	6	25013	25018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021592	T	6	6	25018	25023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021592	AAT	2	6	25034	25039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021592	TGAAA	2	10	35593	35602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021592	CCG	2	6	35639	35644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_021592	A	6	6	35652	35657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021592	TA	3	6	35726	35731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021592	AAC	2	6	35755	35760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021592	AT	3	6	35782	35787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021592	TGGG	2	8	35864	35871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021592	TCAC	2	8	35899	35906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021592	TCT	2	6	35918	35923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021592	ATT	2	6	35933	35938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021592	ATT	2	6	35942	35947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021592	TTA	3	9	36100	36108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021592	AGAAA	2	10	36196	36205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021592	A	7	7	36214	36220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021592	ACA	2	6	36227	36232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021592	CTG	2	6	36266	36271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021592	TAT	2	6	36273	36278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021592	AT	3	6	36307	36312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021592	ACA	2	6	36314	36319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021592	TCAA	2	8	36348	36355	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021592	TA	3	6	39217	39222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021592	TGT	2	6	39228	39233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021592	ATT	2	6	39270	39275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021592	GAG	2	6	39279	39284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021592	A	6	6	39304	39309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021592	TTA	2	6	39316	39321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021592	TA	3	6	39356	39361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021592	A	6	6	39361	39366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021592	TA	4	8	39367	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021592	CTA	2	6	39375	39380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021592	TAT	2	6	39392	39397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021592	A	6	6	39415	39420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021592	ATGT	2	8	39475	39482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021592	GCAG	2	8	39493	39500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021592	GTT	2	6	39559	39564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021592	AATT	2	8	39589	39596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021592	AC	3	6	39601	39606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021592	TA	4	8	46357	46364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021592	TATTT	2	10	46382	46391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021592	GTA	2	6	47152	47157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021592	TA	4	8	47156	47163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021592	AT	3	6	47165	47170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021592	TA	3	6	47325	47330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021592	TCAA	2	8	47371	47378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_021592	GATG	2	8	47385	47392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021592	CCT	2	6	47393	47398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_021592	TCA	2	6	47470	47475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021592	TTC	2	6	47508	47513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_021592	AATA	2	8	47554	47561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021592	T	7	7	48766	48772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021592	TACA	2	8	48780	48787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_021592	TTA	2	6	48829	48834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021592	ATC	2	6	48836	48841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_021592	TTAA	2	8	48874	48881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021592	TTG	2	6	50354	50359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021592	AAT	2	6	50536	50541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021592	TA	4	8	50562	50569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021592	ATA	2	6	50631	50636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021592	T	6	6	50715	50720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021592	CTG	2	6	50761	50766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_021592	TG	3	6	50765	50770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021592	CTT	2	6	50824	50829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_021592	ATC	2	6	50889	50894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_021592	ATT	2	6	50900	50905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021592	AAG	2	6	50953	50958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021592	GGA	2	6	51066	51071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021592	ATT	2	6	51078	51083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021592	ATTT	2	8	51109	51116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021592	TTA	2	6	51146	51151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021592	AATT	2	8	51165	51172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021592	TA	4	8	51182	51189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021592	A	7	7	51189	51195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_021592	A	6	6	51515	51520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_021592	AT	3	6	51596	51601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021592	TA	3	6	51615	51620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_021592	ATT	2	6	51634	51639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021592	ATTA	2	8	51667	51674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021592	AAT	2	6	51702	51707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_021592	TTA	2	6	53006	53011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021592	ATC	2	6	53017	53022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_021592	ATCATA	2	12	57272	57283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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264	NC_021592	A	7	7	61693	61699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_021592	CATAT	2	10	61954	61963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_021592	AT	3	6	63493	63498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_021592	GTT	2	6	65336	65341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_021592	T	6	6	66630	66635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021592	ATTTC	2	10	66673	66682	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_021592	AT	3	6	66740	66745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_021592	GTA	2	6	66923	66928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_021592	ATA	2	6	66959	66964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_021592	T	7	7	93932	93938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_021592	TAT	2	6	94072	94077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_021592	CAT	2	6	94082	94087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_021592	T	7	7	96170	96176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_021592	CAT	2	6	98029	98034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_021592	ATT	2	6	103824	103829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_021592	T	7	7	103855	103861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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494	NC_021592	AT	3	6	106707	106712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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